好多同學(xué)詢問孟德爾隨機(jī)化的問題，我再來嘗試著梳理一遍，希望對大家有所幫助撒桨，首先看下圖1分鐘魏烫，盯著看將下圖印在腦海中： [圖片上傳失敗...(image-9bf17c-1668...
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R數(shù)據(jù)分析：孟德爾隨機(jī)化實(shí)操
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除了GWAS Catalog检痰，還可以用CAUSALdb數(shù)據(jù)庫做GWAS要查詢以往的 GWAS 研究結(jié)果难咕，可以使用 GWAS Catalog峰弹。GWAS Catalog 包含的信息非常多回怜，不過有時(shí)可能滿足不了需要大年。介紹一個(gè)叫 CAUSALdb 的數(shù)...
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R數(shù)據(jù)分析：工具變量回歸與孟德爾隨機(jī)化，實(shí)例解析
原諒我又拖更好久玉雾，沒辦法翔试，欸，就是懶抹凳，但是所有的單子都是保質(zhì)保量完成的哈遏餐。，今天給大家寫工具變量和孟德爾隨機(jī)化赢底，文章略微有些長失都，請大家準(zhǔn)備好清醒的頭腦柏蘑，和半個(gè)小時(shí)的閱讀時(shí)間哈...
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孟德爾隨機(jī)化(Mendelian Randomization) 統(tǒng)計(jì)功效（power）和樣本量計(jì)算1 統(tǒng)計(jì)功效（power）概念 統(tǒng)計(jì)功效（power）指的是在原假設(shè)為假的情況下，接受備擇假設(shè)的概率粹庞。 用通俗的話說就是咳焚，P<0.05時(shí)，結(jié)果顯著（接受備擇假設(shè)）; 在此結(jié)論...
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TwoSampleMR：兩樣本孟德爾隨機(jī)化孟德爾隨機(jī)化推斷暴露因素與健康結(jié)局的因果關(guān)系[http://www.reibang.com/p/8ac31267d3d8] 主要步驟：1. 讀取暴露因素GWAS數(shù)據(jù)選取合適...
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參考文獻(xiàn)排版庞溜，這幾點(diǎn)非常重要革半！之前和大家多次聊過參考文獻(xiàn)的排版。?? Zotero | 有了Zotero流码，參考文獻(xiàn)排版不再煩惱又官！ 定制版GB/T 7714來了，究竟有多好用漫试？| Zotero 今天繼續(xù)介紹...
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熱圖 | 轉(zhuǎn)錄組樣品表達(dá)量相關(guān)系數(shù)矩陣寫在前面 很多時(shí)候六敬，我們做完轉(zhuǎn)錄組，會想著看看樣品與樣品之間的表達(dá)相關(guān)性如何驾荣？依此外构，可以看看是否存在異常樣品，也或許可以找到一些生物學(xué)相關(guān)問題播掷。常常审编，我會使用 R 語言的 C...
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基于R語言繪制Network幾種方式平時(shí)對于網(wǎng)絡(luò)圖的繪制，一般我們都會在R中生成邊和點(diǎn)列表后導(dǎo)入到Cytoscape和Gephi等的本地工具軟件當(dāng)中歧匈，而R語言中也自帶有不少優(yōu)秀的包也可精美的可視化我們的數(shù)據(jù)垒酬，所...
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GOplot | 更美觀的富集分析可視化GOplot | 更美觀的富集分析可視化 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 GOplot使用了zscore概念，但其并不是指Z-score標(biāo)準(zhǔn)化件炉，而是指每個(gè)GO term下上調(diào)(logFC>0)基因...
