請一定看這里：寫下來只是為了記錄一些自己的實踐侦副，當然如果能對你有所幫助那就更好了渔隶，歡迎大家和我交流 差異分析流程: 1 初始數(shù)據(jù) 2 標準化(normalization)：D...
IP屬地：西藏
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RNA-seq摸索：4. edgeR/limma/DESeq2差異基因分析→ggplot2作火山圖→biomaRt轉(zhuǎn)換ID并注釋 -
生信 | circos文件準備大全（以擬南芥為例）一为鳄、寫在前面 扣扣群：559758504（目前無需驗證涯肩，一鍵即可加入） 如果你不想學，老板又催著要损话，你可以加群私聊我尋求幫助( $ _ $ )幽告，但還是自己學，知識都是自己的突颊。...
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「2022-01-04更新」HiC軟件安裝篇之Lachesis2022-01-04 update: 更新了一些錯誤集錦 Lachesis是希臘神話眾神之一鲁豪，負責決定生命之線的長度潘悼。但是咱們這個lachesis是2013年發(fā)表在natur...
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從0開始的RNA-seq教程
本次RNA-seq分析目標明確，得到基因的表達矩陣即可爬橡，不涉及其他分析治唤。 樣本：植物的葉和莖的轉(zhuǎn)錄組；測序方法：雙端測序糙申；有參考基因組文件 1.數(shù)據(jù)質(zhì)控拿到測序數(shù)據(jù)宾添，第一步進...
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Linux Sort 按照某一列排序
轉(zhuǎn)載：https://segmentfault.com/a/1190000005713784sort是在Linux里非常常用的一個命令，管排序 sort將文件的每一行作為一個...
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Jalview使用方法（1）——多序列比對今天我們介紹一款全平臺可以使用的多序列比對工具柜裸，那就是Jalview缕陕，它的功能非常強大，但是我們今天講解最基本的多序列比對及結(jié)果輸出疙挺。 1. 導入序列 你可以導入你的fast...
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無參轉(zhuǎn)錄組序列組裝 — Trinity轉(zhuǎn)錄組分析策略 轉(zhuǎn)錄組分析策略根據(jù)有無參考轉(zhuǎn)錄組可以分為兩類： 有參比對—定量—差異分析—功能富集分析等 無參組裝—定量—差異分析—功能富集分析等image 無參考轉(zhuǎn)錄組序列...
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RNA-seq從入門到自閉（Trimmomatic和Fastp）抱歉拖了這么久扛邑，主要是最后分析出來的數(shù)據(jù)跟某平臺對比后發(fā)現(xiàn)差了很多。無法解釋這個結(jié)果铐然。用了幾個軟件測試蔬崩，最后的結(jié)果都跟之前平臺的Exp結(jié)果對不上。最后猜測可能還是這套數(shù)據(jù)有問...
