尐尐呅

目前關于空間轉(zhuǎn)錄組學的許多文獻是技術性的，并不面向不熟悉該領域的研究人員艺沼。近日犀忱，《Genome Medicine》發(fā)表了一篇綜述文章為空間轉(zhuǎn)錄組學提供了一個入門指南：涵蓋了生...

尐尐呅

識別空間域（即在基因表達和組織學上具有空間相關性的區(qū)域）是空間轉(zhuǎn)錄組學中最重要的課題之一健田。近日饰抒，《Nucleic Acids Research》發(fā)表了一個準確且通用的深度學習...

尐尐呅

空間轉(zhuǎn)錄組學（ST）正在改變我們研究基因表達的方式雁乡。然而在大量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中姑荷，轉(zhuǎn)座因子（TE）由于其高度重復性而未被研究耐量。近年來飞蚓，TEs被認為是基因表達的重要調(diào)節(jié)因子。因此廊蜒，以...

思考問題的熊

還在羨慕海峽那邊的朋友下載SRA 快到飛起趴拧？還在難過用wget 下載數(shù)據(jù)經(jīng)常下載不完整溅漾？用了官方的下載工具還是慢的不行？這里有一個SRA 下載自救嘗試指南供你參考著榴。 需要用到...

Bioinfor生信云

重復序列廣泛存在于真核生物基因組中, 這些重復序列或集中成簇, 或分散在基因之間樟凄。根據(jù)分布把重復序列分為散在重復序列和串聯(lián)重復序列。 重復序列的分類 重復序列注釋流程 參考腳...

單細胞空間交響樂

作者兄渺，Evil Genius 這一篇我們繼續(xù)分享關于空間通訊的內(nèi)容缝龄，今天偷個懶。 10X Visium HD平臺已經(jīng)發(fā)布挂谍，高精度平臺叔壤，配套loupe軟件，看起來幾乎是無敵的口叙，...

六六_ryx

學習目標 學習用DiffBind流程評估兩個樣本間的差異結(jié)合區(qū)域 用PCA評估樣本間的關系 評估不同工具得到的差異peaks的一致性 評估差異peaks富集的工具 ATAC-...

小潤澤

首先附上軟件鏈接：https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/systemPipeR.htmlhttp:/...