您好氓英，請問一下這個結果可以復刻出來嘛 最近正在復刻里面腎臟的數(shù)據(jù) （10x下的） 最后得到的TE特異性位點的tsv 文件感覺怪怪的 不知道能不能幫忙看一下??
SpatialTE：從空間轉錄組數(shù)據(jù)集分析轉座因子表達的工具 | 空間轉錄組分析工具推薦空間轉錄組學（ST）正在改變我們研究基因表達的方式混蔼。然而在大量轉錄組數(shù)據(jù)中，轉座因子（TE）由于其高度重復性而未被研究勒叠。近年來，TEs被認為是基因表達的重要調(diào)節(jié)因子。因此，以...
目前關于空間轉錄組學的許多文獻是技術性的，并不面向不熟悉該領域的研究人員攻冷。近日娃胆，《Genome Medicine》發(fā)表了一篇綜述文章為空間轉錄組學提供了一個入門指南：涵蓋了生...
識別空間域（即在基因表達和組織學上具有空間相關性的區(qū)域）是空間轉錄組學中最重要的課題之一。近日等曼，《Nucleic Acids Research》發(fā)表了一個準確且通用的深度學習...
空間轉錄組學（ST）正在改變我們研究基因表達的方式禁谦。然而在大量轉錄組數(shù)據(jù)中胁黑，轉座因子（TE）由于其高度重復性而未被研究。近年來州泊，TEs被認為是基因表達的重要調(diào)節(jié)因子丧蘸。因此，以...
還在羨慕海峽那邊的朋友下載SRA 快到飛起遥皂？還在難過用wget 下載數(shù)據(jù)經(jīng)常下載不完整力喷？用了官方的下載工具還是慢的不行？這里有一個SRA 下載自救嘗試指南供你參考演训。 需要用到...
作者试伙，Evil Genius 這一篇我們繼續(xù)分享關于空間通訊的內(nèi)容嘁信，今天偷個懶。 10X Visium HD平臺已經(jīng)發(fā)布疏叨，高精度平臺潘靖，配套loupe軟件，看起來幾乎是無敵的蚤蔓，...
學習目標 學習用DiffBind流程評估兩個樣本間的差異結合區(qū)域 用PCA評估樣本間的關系 評估不同工具得到的差異peaks的一致性 評估差異peaks富集的工具 ATAC-...
首先附上軟件鏈接：https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/systemPipeR.htmlhttp:/...
?我們關注蛋白質(zhì)的功能威沫，而結構和功能聯(lián)系緊密。一旦在氨基酸序列水平發(fā)現(xiàn)有趣的序列（比如一個模體（motif）或者進化上保守的片段）洼专，下一步往往就是研究這段序列的3-D結構棒掠。（...
