本文是對多個內(nèi)容的整理幢妄，不是原創(chuàng)恬口，在此聲明 1. 基本原理 支持向量機(jī)（SVM, support vector machine）SVM詳解[https://zhuanlan....
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機(jī)器學(xué)習(xí)SVM -
CytoTRACE 原理及代碼解釋CytoTRACE是一款基于單細(xì)胞計數(shù)矩陣推測細(xì)胞間活性和細(xì)胞間相對分化狀態(tài)的一款軟件窍荧，這里我們結(jié)合實(shí)際代碼例子辉懒，解釋CytoTRACE的數(shù)學(xué)原理： step 1:這一步先將...
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WGS數(shù)據(jù)分析（一）
WGS (whole genome sequencing) 全基因組測序分析，以Saccharomyces cerevisiae SY14菌株的illumin 測序數(shù)據(jù)為例。...
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復(fù)現(xiàn)《Cell》文章圖表：氣泡熱圖展示基因表達(dá)+分組添加今天我們來復(fù)現(xiàn)一下一篇《cell》文章中的圖標(biāo)僧叉，圖如下： （Liver Immune Profiling Reveals Pathogenesis and Therapeut...
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照葫蘆畫圖之統(tǒng)計描述（一）
說在前面 簡單說對一切實(shí)驗結(jié)果分析的核心就是數(shù)據(jù)，當(dāng)我們面對原始的大量數(shù)據(jù)時棺榔，這些數(shù)據(jù)中很可能夾雜著沒有任何意義或者意義模糊的數(shù)據(jù)瓶堕，我們很難從中發(fā)現(xiàn)有用的信息。 為了快速且有...
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樹模型遇上類別型特征(Python)在數(shù)據(jù)挖掘項目的數(shù)據(jù)中症歇，數(shù)據(jù)類型可以分為兩種：有序的連續(xù)數(shù)值 和 無序的類別型特征郎笆。 對于xgboost等boosting樹模型，基學(xué)習(xí)通常是cart回歸樹忘晤，而cart樹的輸...
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論文閱讀“Multi-view graph embedding clustering network"Xia W, Wang S, Yang M, et al. Multi-view graph embedding clustering network: Joint self...
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R語言ggplot2畫氣泡圖展示富集分析的結(jié)果之前的推文介紹了畫柱形圖展示富集分析的結(jié)果宛蚓，今天的推文介紹一下畫氣泡圖展示富集分析結(jié)果的代碼。氣泡圖就是散點(diǎn)圖的一個變種设塔。多了一個變量映射給點(diǎn)的大小凄吏，富集分析里通常是用來映射...
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NLP中的因果推斷（綜述）Causal Inference in Natural Language Processing Estimation, Prediction, Interpretation ...
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為什么使用PHATE進(jìn)行降維博文名稱：Why you should be using PHATE for dimensionality reduction博文鏈接：https://towardsdata...
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一文全面解決樣本不均衡（Python）一、樣本不均衡的介紹 1.1 樣本不均衡現(xiàn)象 樣本（類別）樣本不平衡（class-imbalance）指的是分類任務(wù)中不同類別的訓(xùn)練樣例數(shù)目差別很大的情況闰蛔，一般地痕钢，樣本類別比...
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照葫蘆畫圖之PcoA
說在前面 Immugent在之前一篇推文照葫蘆畫圖之PCA[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY5ODI1Nw==&mid=224...
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ggcorrplot相關(guān)系數(shù)可視化-R語言使用參考：https://rpkgs.datanovia.com/ggcorrplot/[https://rpkgs.datanovia.com/ggcorrplot/]我只...
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【哈佛大學(xué)：計算生物學(xué) & 生物信息學(xué)】學(xué)習(xí)記錄（二）筆記主要內(nèi)容：1~3代測序技術(shù)，fastq文件 & FASTQC （1）測序技術(shù) 1序六、一代測序技術(shù)：Sanger Sequencing 測序條件：需要有足夠的量的單鏈DNA任连，...
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一文詳解RNN及股票預(yù)測實(shí)戰(zhàn)(Python)！循環(huán)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)（RNN）是基于序列數(shù)據(jù)（如語言例诀、語音随抠、時間序列）的遞歸性質(zhì)而設(shè)計的，是一種反饋類型的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)余佃，其結(jié)構(gòu)包含環(huán)和自重復(fù)暮刃，因此被稱為“循環(huán)”。它專門用于處理序列數(shù)據(jù)爆土，...
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本周最新文獻(xiàn)速遞20220116本周最新文獻(xiàn)速遞20220116 一椭懊、精細(xì)解讀文獻(xiàn) 一 文獻(xiàn)題目： Mendelian randomization analyses support causal relat...
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一個R包搞定22種單細(xì)胞基因差異分析參考文獻(xiàn)：Confronting false discoveries in single-cell differential expression[https://doi.o...
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R-ggplot2-箱圖系列（2） 注釋P值與組間比較R-ggplot2-箱圖系列（1） basic - 簡書 (jianshu.com)[http://www.reibang.com/p/bafbd08b28ef]R-ggp...
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太贊了！這4款Pandas自動數(shù)據(jù)分析神器
我們做數(shù)據(jù)分析步势，在第一次拿到數(shù)據(jù)集的時候氧猬，一般會用統(tǒng)計學(xué)或可視化方法來了解原始數(shù)據(jù)。 了解列數(shù)坏瘩、行數(shù)盅抚、取值分布、缺失值倔矾、列之間的相關(guān)關(guān)系等等妄均，這個過程叫做EDA（Explor...
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數(shù)據(jù)分析：數(shù)據(jù)預(yù)處理--缺失值處理（三）前言 上一篇數(shù)據(jù)分析：數(shù)據(jù)預(yù)處理--標(biāo)準(zhǔn)化方法優(yōu)劣了解（二）[http://www.reibang.com/p/d4909f31b33e]講了兩類常用標(biāo)準(zhǔn)化方法柱锹，但沒涉及到...