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比較三種機器學(xué)習(xí)模型（隨機森林羊异，支持向量機，邏輯回歸）的分類效果我把這個思路搬運到我的課題里野舶，復(fù)現(xiàn)圖如下： 相似度：75%易迹。a和b是用AI畫的，所以今天分享下c和d的代碼 一 差異分析 假設(shè)我們有了這樣的一個表達矩陣赴蝇，叫Expr_all菩浙。...
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nmf運行太慢咋整
實戰(zhàn)-TCGA數(shù)據(jù)的NMF聚類和可視化
0.NMF NMF是非負(fù)矩陣分解，也是常用的劃分亞組（亞型）的聚類方法之一咯劲蜻。 代碼主要參考了幫助文檔和曾老板的博客：http://www.bio-info-trainee....
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【R>>MOVICS】多組學(xué)+亞型秘密武器MOVICS包整合多組學(xué)數(shù)據(jù)進行分析，其安裝的過程太讓人心酸含懊，大家安裝的過程慢慢體會身冬，下面就來學(xué)習(xí)下這個由“大魚海棠”老師開發(fā)的R包吧岔乔。 1.示例數(shù)據(jù) brca.tcga.R...
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R 散點圖加折線圖 高級統(tǒng)計分析需完成作業(yè) 原始數(shù)據(jù) 完成情況 仍需改進茁影，歡迎提供更改意見 參考代碼 [如何一鍵繪制具有顯著性檢驗信息的箱線圖/小提琴圖宙帝？](如何一鍵繪制具有顯著性檢驗信息的箱線圖/小提琴圖...
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[R語言] ggplot2包 可視化《R for data science》 1《R for Data Science》第二募闲、三章 Data visualisation 啃書知識點積累 參考書籍《R for data science》《R數(shù)據(jù)科學(xué)》The...
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gtex數(shù)據(jù)下載和整理數(shù)據(jù)下載 官網(wǎng)訪問有障礙相嵌，直接去xena吧。 1.讀取表達矩陣 2. 讀取注釋信息 3.表達矩陣和臨床信息對應(yīng)起來 4. 單基因表達量畫圖 5.兩個基因的相關(guān)性圖 6.炫酷的...
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實戰(zhàn)-TCGA數(shù)據(jù)的NMF聚類和可視化0.NMF NMF是非負(fù)矩陣分解，也是常用的劃分亞組（亞型）的聚類方法之一咯悄但。 代碼主要參考了幫助文檔和曾老板的博客：http://www.bio-info-trainee....
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如何下載感興趣的基因集（GO數(shù)據(jù)庫）
需求：下載DNA損傷修復(fù)相關(guān)的基因列表。 第一步 搜索數(shù)據(jù)庫 進入GO (Gene Ontology) 數(shù)據(jù)庫網(wǎng)頁 http://geneontology.org/ ，在搜索...
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2023-03-15可變剪接內(nèi)容學(xué)習(xí) 概念 可變剪接（Alternative Splicing嗡贺，AS）是指從一個mRNA前體中通過不同的剪接方式（選擇不同的剪接位點組合）產(chǎn)生不同的mRNA剪接異...
