@Yorleleiyo ??硼补，一切都會(huì)好起來(lái)的
2022年度總結(jié)及2023展望2022年是比較魔幻的一年，2月份在海南遭遇了有史以來(lái)最大皮肉之苦哑姚，整個(gè)人從電瓶車上摔了下來(lái)，身上七七八八的擦傷，打完補(bǔ)丁后仿佛是個(gè)木乃伊志鹃，好在沒(méi)有破相和傷到骨頭。認(rèn)識(shí)到了電...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：海南
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@YYYYxiao 水稻的話是rap-db泽西，詳看我關(guān)于水稻基因組的數(shù)據(jù)庫(kù)介紹曹铃。
【基因組學(xué)】從基因組中提取基因序列，一段序列及相應(yīng)的注釋文件
寫在前面要讓從基因組中獲取信息變得像喝水那樣簡(jiǎn)單捧杉。 --by zhougengxu 預(yù)先準(zhǔn)備 我以水稻基因組為例陕见，像大家介紹如何提取序列。 基因組文件：水稻基因組味抖，水稻...
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@jing_我愿 透明或白色reads.質(zhì)量低评甜，不太可信，可以用pcr驗(yàn)證一下仔涩。
【基因組學(xué)】使用IGV可視化查看基因組重測(cè)序比對(duì)結(jié)果
寫在前面IGV能夠?qū)⒒蚪M的變異情況可視化忍坷，因此廣泛應(yīng)用于基因組學(xué)的研究中。下面我以windows下的IGV為例，介紹一下IGV在查看基因組變異方面的應(yīng)用承匣。 一.下載 下載鏈...
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2022年度總結(jié)及2023展望
2022年是比較魔幻的一年蓖乘，2月份在海南遭遇了有史以來(lái)最大皮肉之苦，整個(gè)人從電瓶車上摔了下來(lái)韧骗，身上七七八八的擦傷嘉抒，打完補(bǔ)丁后仿佛是個(gè)木乃伊，好在沒(méi)有破相和傷到骨頭袍暴。認(rèn)識(shí)到了電...
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【科研相關(guān)】有機(jī)化合物的系統(tǒng)命名法
寫在前面????最近由于課題需要些侍，接觸了些有機(jī)化合物的結(jié)構(gòu)式，我首先想弄明白的是政模，它的編號(hào)是怎么來(lái)的岗宣，搜索了一下優(yōu)質(zhì)內(nèi)容×苎花了半小時(shí)看完以后耗式，仿佛回憶起自己高中和本科學(xué)過(guò)的那...
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@bc8cfc3797df 一起進(jìn)步
【軟件使用】PyMol入門教程
主要講述PyMOL中常見的圖形界面（鼠標(biāo)）操作 1.認(rèn)識(shí)PyMol 1. 軟件界面介紹 1.2 內(nèi)置demo介紹 打開PyMOL,點(diǎn)擊1.1菜單窗口的Wizard菜單，然后點(diǎn)...
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@員外家的小公舉 看看國(guó)外rodwing或者韓斌老師他們的數(shù)據(jù)庫(kù)呢
【基因組學(xué)】水稻常用基因組數(shù)據(jù)庫(kù)介紹
水稻常用數(shù)據(jù)庫(kù)介紹 ????近幾年隨著測(cè)序數(shù)據(jù)量呈井噴式增長(zhǎng)趁猴，涌現(xiàn)出一大批優(yōu)秀的數(shù)據(jù)庫(kù)刊咳。而水稻和擬南芥分別作為植物研究中單雙子葉的模式植物，其基因組信息得到了很大程度的挖掘儡司。...
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@jefflllyyy 有時(shí)候不穩(wěn)定娱挨，換成有線或者過(guò)幾天看看
[基因組學(xué)]使用biomaRt做水稻ID轉(zhuǎn)換及相關(guān)信息的填充
水稻的基因號(hào)大致分為兩類，一類是RAP號(hào)捕犬，格式為“Os-Chr-g-number”跷坝，另一類是MSU號(hào)，格式為“LOC_Os-Chr-g-number”碉碉。平時(shí)做各種分析時(shí)柴钻，需要...
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NGS分析手把手教學(xué)：零基礎(chǔ)RNA-seq轉(zhuǎn)錄組分析實(shí)踐，兩套方案(2023年最新）??不想充值付費(fèi)的小伙伴可以點(diǎn)贊誉裆，會(huì)隨機(jī)挑選幸運(yùn)觀眾贈(zèng)送全文顿颅。 NGS分析手把手教學(xué)系列繼WGS全基因組分析[http://www.reibang.com/p/04cacc...
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@Sherlocklock 我之前一直是用RAP號(hào)做的富集分析，沒(méi)用過(guò)Entrez足丢。最近有個(gè)項(xiàng)目粱腻，剛好試了試你說(shuō)的entrez ID，我發(fā)現(xiàn)確實(shí)有很大部分缺失斩跌。我的解決方案是將RAP號(hào)轉(zhuǎn)換成GO_id绍些，用GO_id去做富集分析，你可以嘗試一下耀鸦。
[基因組學(xué)]使用biomaRt做水稻ID轉(zhuǎn)換及相關(guān)信息的填充
水稻的基因號(hào)大致分為兩類柬批，一類是RAP號(hào)啸澡，格式為“Os-Chr-g-number”，另一類是MSU號(hào)氮帐，格式為“LOC_Os-Chr-g-number”嗅虏。平時(shí)做各種分析時(shí)，需要...
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@Sherlocklock :加油smile:
[基因組學(xué)]使用biomaRt做水稻ID轉(zhuǎn)換及相關(guān)信息的填充
水稻的基因號(hào)大致分為兩類上沐，一類是RAP號(hào)皮服，格式為“Os-Chr-g-number”，另一類是MSU號(hào)参咙，格式為“LOC_Os-Chr-g-number”龄广。平時(shí)做各種分析時(shí)，需要...
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【科研相關(guān)】使用PPT進(jìn)行科研繪圖(二)寫在前面????補(bǔ)充一些PPT相關(guān)的基礎(chǔ)知識(shí)蕴侧，主要包括圖片格式择同、分辨率、位圖分辨率設(shè)置净宵、快捷鍵的說(shuō)明和自定義工具欄敲才，總共五個(gè)部分。 一择葡、圖片格式的學(xué)問(wèn) 1.圖片分為位圖和矢量...
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【科研相關(guān)】使用PPT進(jìn)行科研繪圖(一)寫在前面????PPT堪稱是個(gè)神器归斤，不僅能做presentation，還能做Figure刁岸，而且上手還容易，畢竟大多數(shù)人從初中甚至小學(xué)就開始接觸了她我。我就利用封控期間虹曙，學(xué)習(xí)了一下...
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@Sherlocklock 如果單純做ID轉(zhuǎn)換的，RAP-DB的download界面有個(gè)MSU和RAP的轉(zhuǎn)換表(txt格式)番舆，你可以把它download下來(lái)酝碳，在R里面用merge函數(shù)進(jìn)行轉(zhuǎn)換，這種方法不用在線抓取恨狈，比較快捷疏哗。至于你說(shuō)的缺失的情況，1.可以看一下缺失基因的reads禾怠，如果不同樣本之間reads都很低返奉，基本上就可以忽略這個(gè)基因；另外酸役，2.缺失是肯定存在的耐床，每年基因組都在發(fā)生變化隙疚，重新測(cè)序，重新注釋等污尉，對(duì)應(yīng)不上很正常膀哲，盡量以最新版的基因組為準(zhǔn)；3.一半的缺失理論上不太可能被碗，檢查一下代碼看看某宪。
[基因組學(xué)]使用biomaRt做水稻ID轉(zhuǎn)換及相關(guān)信息的填充
水稻的基因號(hào)大致分為兩類，一類是RAP號(hào)锐朴，格式為“Os-Chr-g-number”兴喂，另一類是MSU號(hào)，格式為“LOC_Os-Chr-g-number”包颁。平時(shí)做各種分析時(shí)瞻想，需要...
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【R-statistics】方差分析方差分析(ANOVA) 什么是方差分析 模型可以歸納為在解決預(yù)測(cè)問(wèn)題 Q：如何評(píng)價(jià)預(yù)測(cè)結(jié)果的好壞？A：預(yù)測(cè)和模型越接近越好Q：如何刻畫”接近“娩嚼？A：需要定義”距離“蘑险，一般使用...
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【R-statistics】基本統(tǒng)計(jì)量、假設(shè)檢驗(yàn)和置信區(qū)間寫在前面溫習(xí)一下用R做基本統(tǒng)計(jì)的過(guò)程岳悟。 ======================================緒論：概率佃迄？統(tǒng)計(jì)？世界是隨機(jī)的模型 --概率--> 數(shù)據(jù)數(shù)...
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【文獻(xiàn)分享】調(diào)控植物免疫和發(fā)育的保守模塊寫在前面????本次分享由國(guó)外多家單位合作發(fā)表在植物學(xué)頂刊Nature Plants的一篇文章"A conserved module regulates receptor k...
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@acbb7ff00801 https://proteins.plus/#dogsite 我用這個(gè)網(wǎng)站確定過(guò)pocket
【軟件使用】PyMol入門教程
主要講述PyMOL中常見的圖形界面（鼠標(biāo)）操作 1.認(rèn)識(shí)PyMol 1. 軟件界面介紹 1.2 內(nèi)置demo介紹 打開PyMOL,點(diǎn)擊1.1菜單窗口的Wizard菜單呵俏，然后點(diǎn)...