發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：廣東
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我只是知識(shí)的搬運(yùn)工~
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測(cè)序有關(guān)問(wèn)題
1.為什么要在上機(jī)測(cè)序之前做PCR擴(kuò)增收厨？ 測(cè)到的reads數(shù)取決于flowcell上長(zhǎng)了多少cluster（1個(gè)模板鏈擴(kuò)增出一簇分子）呀邢，有多少cluster蛇损，理論上就得到多少...
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北京基因組所研究生在讀，實(shí)驗(yàn)&生信小蝸牛一只活玲。歡迎一起討論呀~ <br>liulinli17m@big.ac.cn
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DiseaseMeth 人類疾病相關(guān)的甲基化信息數(shù)據(jù)庫(kù)
DNA甲基化作為表觀遺傳的一種標(biāo)記涣狗，在生長(zhǎng)發(fā)育和疾病發(fā)生過(guò)程中扮演著重要角色谍婉。隨著大規(guī)模甲基化研究的進(jìn)行，積累了大量疾病相關(guān)的甲基化數(shù)據(jù)镀钓，DiseaseMeth就是一個(gè)保存了...
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iMETHYL : 整合了DNA甲基化, SNP和RNA_seq的多組學(xué)聯(lián)合數(shù)據(jù)庫(kù)
在NGS飛速發(fā)展的時(shí)代穗熬，有大量研究通過(guò)GSWA的方法，闡述了SNP于疾病之間的關(guān)聯(lián); 也有學(xué)者利用WGBS丁溅，RRBS, 甲基化芯片等方式研究DNA甲基化與疾病之間的關(guān)系唤蔗。不過(guò)...
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MethyCancer : 癌癥相關(guān)的甲基化基因數(shù)據(jù)庫(kù)
癌癥作為人類健康的頭號(hào)殺手，引起了科研工作者的官方關(guān)注窟赏。鑒于DNA甲基化修飾在腫瘤中的重要作用妓柜， MethyCancer數(shù)據(jù)庫(kù)整合了DNA甲基化數(shù)據(jù)和基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)，將癌癥與...
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歡迎關(guān)注微信公眾號(hào)<生信修煉手冊(cè)><br>關(guān)注公眾號(hào)规哪，可以加入微信群求豫，一起交流溝通
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MethHC: 整合了癌癥相關(guān)的甲基化與基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫(kù)
在MethHC數(shù)據(jù)庫(kù)中，提供了18種癌癥相關(guān)的DNA甲基化诉稍，microRNA表達(dá)譜和基因表達(dá)譜的數(shù)據(jù)蝠嘉，這里的數(shù)據(jù)來(lái)源于TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)。同時(shí)采用線性回歸的方法計(jì)算甲基化和表達(dá)譜...
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NGS - Alignment 序列對(duì)比Introduction Resequencing 重測(cè)序 [NIBI] Resequencinghttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/probe/doc...
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用泊松分布解釋 NGS 測(cè)序數(shù)據(jù)的 duplication 問(wèn)題
tags： NGS duplication 不管從哪個(gè)角度看我們都希望測(cè)序儀產(chǎn)出的數(shù)據(jù)中 duplicate 率盡量低杯巨。怎樣降低 duplicate 率蚤告？ 構(gòu)建文庫(kù)時(shí)，核酸提...
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NGS-概念解釋+測(cè)序過(guò)程對(duì)二代基因測(cè)序的有些概念還是不太清楚 Illumina 平臺(tái) https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3178052/The...
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NGS 數(shù)據(jù)過(guò)濾之 Trimmomatic 詳細(xì)說(shuō)明
tags： Trimmomatic NGS fastq NGS 原始數(shù)據(jù)過(guò)濾對(duì)后續(xù)分析至關(guān)重要服爷，去除一些無(wú)用的序列也可以提高后續(xù)分析的準(zhǔn)確率和效率杜恰。Trimmomatic 是...
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NGS的臨床應(yīng)用（二）近日在 Archives of Pathology & Laboratory Medicine 雜志上發(fā)表了一篇題為Review of Clinical Next-Gener...
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NGS的臨床應(yīng)用（一）近日在 Archives of Pathology & Laboratory Medicine 雜志上發(fā)表了一篇題為Review of Clinical Next-Gener...
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分析記錄 | 差異分析和KEGG GO物種Verticillium dahliae Kleb 1.deseq2差異分析 只有count數(shù)據(jù)。按照count數(shù)據(jù)建立col data表格仍源。 因?yàn)閏ol data表格只...
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Sanger 測(cè)序笼踩，NGS 測(cè)序逗爹，數(shù)據(jù)分析
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