串聯(lián)法和并聯(lián)法構(gòu)建進(jìn)化樹 串聯(lián)法(Concatenation)：先將不同物種之間的每個(gè)單拷貝基因單獨(dú)進(jìn)行多序列比對(duì)蛤售，然后將這些比對(duì)后的單拷貝基因進(jìn)行首尾相連串接成一個(gè)supe...
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串聯(lián)法和并聯(lián)法構(gòu)建進(jìn)化樹
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R包c(diǎn)lusterProfiler: 轉(zhuǎn)換ID揩尸、GO/KEGG富集分析參考這篇ID轉(zhuǎn)換不用怕，clusterProfiler幫你忙這篇詳細(xì)講了無參考基因組該怎么辦首量，值得一看 簡單介紹一下幾種常用的ID：Ensemble id：一般以ENSG開頭...
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「GO富集分析」從原理到實(shí)踐 ~ 零基礎(chǔ)掌握寫在前面 原本红柱，我并無寫這一稿件的想法迎变。主要原因有二： 網(wǎng)絡(luò)上已有相關(guān)資料較多，盡管類似的問題天天仍然有人問 再談起 GO富集分析留潦，距離上次已是五六年只盹，簡單來說，不想談 如果...
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隨筆 | 做一個(gè)“有情懷”的人 - 關(guān)于軟件開發(fā)和日惩迷海瑣事
想來想去殖卑，倒是可以記錄一下最近的一些事件和思考。 刪了一行代碼秆乳，功能加速 100 倍 寫代碼也有好幾年了懦鼠，盡管是業(yè)余工作钻哩，但多少還是有一些提升。肉眼可見的是肛冶，開發(fā)速度明顯下降...
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關(guān)心一下你的研究材料街氢？農(nóng)林牧漁~寫在前面 很多時(shí)候，我們會(huì)看到一些文稿睦袖，上來就是“我研究的物種如何如何重要”珊肃。其中，最有說服力的馅笙，或許就是伦乔，基于“FAO STAT”，品類產(chǎn)量幾何幾何董习。以前烈和，我也不多關(guān)注這個(gè)...
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20個(gè)轉(zhuǎn)錄組基本知識(shí)點(diǎn)
隨著測序成本的不斷下降，轉(zhuǎn)錄組測序分析已然成為生物學(xué)及醫(yī)學(xué)研究不可或缺的技術(shù)手段皿淋。 重點(diǎn)介紹一下轉(zhuǎn)錄組測序分析的相關(guān)知識(shí)招刹。 Question and Answer 1、什么是...
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TBtools | 開箱須知寫在前面 最近可能是不少人要趕畢業(yè)論文窝趣，于是找上了 TBtools疯暑，并急急忙忙希望解決自己的問題。于是哑舒，他們總是會(huì)在群里 @我 或者 @管理員妇拯。事實(shí)上，這是一個(gè)違背群約定的事...
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木薯抗性NBS基因家族分析
雖然我們一直在說可以“用別人的數(shù)據(jù)洗鸵，寫自己的文章”越锈，但是具體怎么操作，很多同學(xué)還是不清楚预麸。今天就用一個(gè)完全用公共數(shù)據(jù)庫資源進(jìn)行分析發(fā)文的例子來和大家分享下這方面的思路瞪浸。 讀前...
