1.問題 應(yīng)該是會經(jīng)常遇到這樣的熱圖,就是說它的聚類情況無法與分組信息吻合。其實(shí)這個(gè)并不是錯(cuò)了妥粟,是因?yàn)橛糜诰垲惖男校ㄟx出的這部分基因)的表達(dá)模式在兩組之間沒有明顯區(qū)別兑燥。只要改...
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一致性聚類是一種提供定量證據(jù)的方法帆赢,用以確定數(shù)據(jù)集中可能的聚類的成員及數(shù)量瓢省,例如微陣列基因表達(dá)禁荒。這種方法在癌癥基因組學(xué)中得到了廣泛應(yīng)用叉抡,以發(fā)現(xiàn)了新的疾病分子亞類尔崔。一致性聚類方...
腫瘤突變負(fù)荷(Tumor Mutational Burden, TMB),指腫瘤細(xì)胞基因組中褥民,基因的外顯子編碼區(qū)每兆堿基中發(fā)生置換和插入或缺失突變的總數(shù)季春。從理論上來說,高TM...
TIDE(http://tide.dfci.harvard.edu/[http://tide.dfci.harvard.edu/])代表腫瘤免疫功能障礙和排斥消返,用于評估免疫療...
sratoolkit 是NCBI提供的用于處理來自SRA 數(shù)據(jù)庫測序數(shù)據(jù)的一個(gè)工具包载弄。 #1. sratoolkit 配置 #1.1 sratoolkit 下載 首先,下載最...
Introduction 介紹 GDC mRNA定量分析管道測量 HT-Seq 原始reads統(tǒng)計(jì)中的基因表達(dá)水平撵颊,F(xiàn)ragments per Kilobase of t...
Clip 的含義 Clip 作為名詞講宇攻,有剪下來的東西的意義,在SAM/BAM 比對文件里面倡勇,用于描述那些一條序列上逞刷,在序列兩端,比對不上的堿基序列(還是很形象的妻熊,一條上比對...
Author:ligc Date:19/5/12 1. 一代測序(Sanger sequencing) 雙脫氧鏈終止法采用DNA復(fù)制原理夸浅。 Sanger測序反應(yīng)體系中包括目標(biāo)...
比較悲催的是現(xiàn)在下不了,查了很多沒有找到解決辦法 加上一個(gè)端口參數(shù) -P 33001扔役,貌似可以下載了(今天2019.5.23晚上在摸索下) 一帆喇、下載安裝Aspera Conn...