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    使用clusterProfiler進(jìn)行富集分析

    clusterProfiler是業(yè)界大神Y叔寫的R包,看過了它的繪圖就會(huì)使人沉迷于其顏值無法自拔倦淀。本文很多內(nèi)容直接翻譯自官方文檔椭微,加上了我的測(cè)試...

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    WGCNA分析,簡(jiǎn)單全面的最新教程

    本文應(yīng)該是第二全的WGCNA分析教程蜈漓,參考了最新的文檔蹲堂。第一全的還在路上黍翎,會(huì)出現(xiàn)于生信寶典和宏基因組公眾號(hào)組織的二代三代轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析實(shí)戰(zhàn)班上凉驻,...

    14.4 生信寶典 123 287 1
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    用tbtools進(jìn)行基因家族分析《一》

    此版本為無代碼版本腻要,依賴tbtools來實(shí)現(xiàn),純粹記錄自己的學(xué)習(xí)經(jīng)驗(yàn)涝登。 蛋白序列的blast比對(duì) 選擇擬南芥基因家族的蛋白序列文件 選擇你想要查...

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    基因在染色體上位置可視化

    感謝CJ大神的反復(fù)修改雄家,這個(gè)功能越變?cè)胶昧耍”疚闹荚趶?fù)現(xiàn)CJ大神推文內(nèi)容胀滚,具體請(qǐng)參考“省心炸雞”趟济,手動(dòng)狗頭(https://www.jiansh...

  • 差異分析之后——富集分析

    差異分析后可以得到基因表達(dá)的logFC值,p值咽笼。設(shè)定差異基因的篩選標(biāo)準(zhǔn)后顷编,選取基因,可以進(jìn)一步進(jìn)行GO分析剑刑,KEGG 分析媳纬,網(wǎng)絡(luò)分析。主要使用c...

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    把基因畫在染色體上

    之前有一次施掏,我導(dǎo)說“能不能把這些基因按順序畫在果蠅的染色體上”钮惠,因此,我尋找了一些實(shí)現(xiàn)這個(gè)需求的方法七芭。經(jīng)過一番奇奇怪怪的操作之后萌腿,最終用ggpl...

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    RNA-Seq:差異表達(dá)分析及可視化

    上一篇已經(jīng)系統(tǒng)介紹了有參RNASeq上游分析,從測(cè)序數(shù)據(jù)fastq文件到最終生成表達(dá)矩陣抖苦。這一系列基本都是RNASeq通用常規(guī)分析毁菱,其下...

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    GSEA的分析匯總-轉(zhuǎn)載

    GSEA的分析匯總 學(xué)習(xí)GSEA 生信技能樹 GSEA的統(tǒng)計(jì)學(xué)原理試講 GSEA GSEA這個(gè)java軟件使用非常方便,只需要根據(jù)要求做好GCT...

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    生物小工具

    本文主要介紹一些生物小工具,尤其是在文章中的锌历,還有就是生物信息學(xué)方面的贮庞,總而言之,言而總之究西,希望能夠幫助到大家窗慎。 關(guān)鍵詞:生物信息學(xué)工具;繪圖工...

    11.1 天明豆豆 7 142
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    GO富集可視化:clusterProfiler+GOplot

    現(xiàn)在的社會(huì)正處于大數(shù)據(jù)時(shí)代,生物學(xué)研究領(lǐng)域也迎來了大組學(xué)時(shí)代卤材。無論是植物遮斥。動(dòng)物,還是微生物扇丛,都有許多物種被測(cè)序术吗。在后續(xù)的個(gè)性化分析過程中,通常會(huì)...

專題公告

下游分析無底洞

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