基因家族 - 專題

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基因家族

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基因家族分析十（基因家族加倍分析）
一：數(shù)據(jù)準(zhǔn)備自己去下載擬南芥的基因組茄蚯，gff3，CDS序列，pep文件佃扼。 1.根據(jù)gff文件獲得基因位置信息。可以自己用awk抓蔼夜，也可以寫個...

0.6 多啦A夢的時光機(jī)_648d 2 11
用TBtools做物種內(nèi)共線性分析（僅步驟）
主要是參考https://www.tinymind.net.cn/articles/64d36abc7fd091 首先我們拿到的是以下的材料 1...

2.9 Devin561 13 63

【比較基因組】共線性分析（MCscanX）
前面介紹了WGDI兼耀，今天分享另一個工具M(jìn)CscanX。 MCScanX是另外一個檢測基因共線性和進(jìn)化分析的常用工具之一求冷，2012發(fā)表至今引用數(shù)已...

0.3 jjjscuedu 0 5
共線性分析collinearity沒有結(jié)果
使用TBtools做物種間共線性分析的時候瘤运，使用A物種基因和擬南芥的基因做共線性分析，得到的collinearity文件只有開頭注釋內(nèi)容沒有結(jié)果...

0.1 悠閑的輝 3 7
物種內(nèi)共線性圈圖繪制
本文參考生信札記[http://www.reibang.com/u/068665394ccf] 相關(guān)內(nèi)容制作準(zhǔn)備數(shù)據(jù)： 1.物種內(nèi)的共線性...

4.1 科研星君 13 53
基因家族專題(3)：基因家族成員的鑒定
Data preparation 繼續(xù)上次的內(nèi)容匠题，下載好數(shù)據(jù)后就可以正式開始鑒定了拯坟。首先回顧一下，下載好的數(shù)據(jù)韭山。基因組序列信息郁季，存儲基因組序列...

5.7 lakeseafly 12 108
dN/dS (Ka/Ks) 原理及計算方法
CONCEPTS In genetics, dN/dS also known asor Ka/Ks, is used to estimate t...

0.1 小紅樓上的樹影 0 3

零基礎(chǔ)多物種間共線性分析
首先非常感謝Cj大神開發(fā)出來的TBtools生信工具，為生信分析做圖帶來了極大的便利钱磅。作為生信小白梦裂，在做多物種間共線性分析時，嘗試了多種方法盖淡，苦...

9.7 花舞lala 31 110 1
【課程筆記】學(xué)CJ在騰訊課堂上的基因家族分析1
明晰概念基因是染色體上一段可以發(fā)生轉(zhuǎn)錄的區(qū)域基因≠CDS 基因應(yīng)該包括：CDS 內(nèi)含子 UTR 啟動子可轉(zhuǎn)錄的區(qū)域是多變的我們做分析的時...

2.7 蟲蟲工工隊 7 14
什么是共線性(synteny)或同線性(colinearity)年柠？
你需要知道：基因組( Genome)：指生物體所有遺傳物質(zhì)的總和。這些遺傳物質(zhì)包括DNA或RNA（病毒RNA）褪迟∪吆蓿基因組包括編碼DNA和非編碼DN...

11.5 勝言_ 5 60