孟德?tīng)栯S機(jī)化 - 專題

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PWAS新發(fā)現(xiàn) | Nat Neurosci: 抑郁癥發(fā)病機(jī)制中存在新蛋白
編者按：抑郁癥是一種常見(jiàn)的精神疾病奇颠，但目前的治療方法只對(duì)一小部分人有效。為了確定新的治療靶點(diǎn)，美國(guó)埃默里大學(xué)醫(yī)學(xué)院神經(jīng)內(nèi)科Thomas S. ...

0.1 ee00dc6faab7 0 1
TWAS（fusion）
最近在看遺傳數(shù)據(jù)與表達(dá)結(jié)合的東西绿语，介紹一個(gè)經(jīng)典的方法吧，fusion衣式。 Gusev et al. “Integrative approaches...

2.4 又是一只小菜鳥 11 32

全轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析TWAS的原理與方法
作者：Resther審稿：童蒙編輯：angelica 什么是TWAS 對(duì)GWAS（genome-wide association study, ...

2.3 生信阿拉丁 3 43
孟德?tīng)栯S機(jī)化--初篩
孟德?tīng)栯S機(jī)化--初篩各位觀眾老爺們大家好帚屉，歡迎來(lái)到蟹道人的生信小課堂！本節(jié)內(nèi)容我們主要講解如何進(jìn)行孟德?tīng)栯S機(jī)化暴露與結(jié)局的快速初篩慕趴。主要列...

0.2 生信蟹道人 0 4
??孟德?tīng)栯S機(jī)化之Exposure data
一痪蝇、暴露因素的數(shù)據(jù)要求： 1.對(duì)于暴露因素的GWAS數(shù)據(jù)，TwoSampleMR需要一個(gè)工具變量數(shù)據(jù)構(gòu)成的data frame冕房，每行對(duì)應(yīng)一個(gè)SN...

0.2 生信蟹道人 0 2
??孟德?tīng)栯S機(jī)化之Introduction
1. 安裝孟德?tīng)栯S機(jī)化分析相應(yīng)的R包 2. 概述：孟德?tīng)栯S機(jī)化流程如下：選擇暴露的工具變量（篩選顯著的SNP[P < 5e-8]躏啰，并進(jìn)行LD...

0.1 生信蟹道人 0 2
PWAS+TWAS+共定位+孟德?tīng)栯S機(jī)化(適用于精神以及腦部疾病)【新課發(fā)布】
TWAS簡(jiǎn)介全轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析 (TWAS, transcriptome-wide association studies) 是把轉(zhuǎn)錄調(diào)控（ex...

0.2 生信蟹道人 0 4

??性狀/疾病間的共同遺傳研究
項(xiàng)目?jī)?nèi)容流程簡(jiǎn)介軟件安裝參考數(shù)據(jù)介紹 GWAS數(shù)據(jù) 安裝Fast2TWAS包 GWAS數(shù)據(jù)的預(yù)處理 LDSC計(jì)算遺傳相關(guān)性 LDSC計(jì)算p...

0.1 生信蟹道人 0 1
Post-GWAS: eQTL、mQTL共定位分析(Summary-data-based Mendelian Randomization,SMR)
1耙册、eQTL给僵、mQTL共定位分析的作用 eQTL、mQTL共定位分析屬于Post-GWAS的一項(xiàng)重要工作详拙，旨在GWAS結(jié)果的基礎(chǔ)上鑒定與表型相關(guān)...

1.8 橙子牛奶糖 2 23
不會(huì)做QTL分析想际，也能輕松找sQTL、eQTL溪厘、meQTL | 癌癥研究數(shù)據(jù)庫(kù)推薦
單核苷酸多態(tài)性（SNPs）是人類最常見(jiàn)的遺傳變異胡本，是研究疾病遺傳基礎(chǔ)的寶貴資源。在相關(guān)疾病研究中畸悬，常常涉及將基因表達(dá)的變異與基因型聯(lián)系起來(lái)的表達(dá)...

0.3 尐尐呅 0 4