轉(zhuǎn)錄組 - 專題

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轉(zhuǎn)錄組

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cytoscape構(gòu)建ceRNA網(wǎng)絡(luò)的輸入文件如何制作
前面給大家介紹了?miRNA相關(guān)數(shù)據(jù)庫及miRNA靶基因批量預(yù)測[https://link.zhihu.com/?target=http%3A/...

7.3 生信交流平臺 0 13
寫國自然缺素材？來篇55分的綜述幫你總結(jié)lncRNAs的基因調(diào)控及其生物學(xué)功能
盡管lncRNA作為單點(diǎn)創(chuàng)新已經(jīng)沒有那么充分迟蜜，但是lncRNA與其他熱點(diǎn)的交叉方向依舊是國自然中標(biāo)熱門。你的國自然標(biāo)書是不是還需要一些lncRN...

2.5 尐尐呅 0 14

轉(zhuǎn)錄組解釋轉(zhuǎn)載
三四十頁的轉(zhuǎn)錄組的測序報(bào)告不知該如何入手笨篷，眾多分析結(jié)果不知該關(guān)注哪些斩个？今天我們就從RPKM到KEGG书妻，慢慢給你講解获高。 01 什么是RPKM值哈肖？ ...

3.9 xiaosine 1 39
簡單的轉(zhuǎn)錄組差異基因表達(dá)分析 -- DESeq2
經(jīng)典的轉(zhuǎn)錄組差異分析通常會使用到三個(gè)工具limma/voom, edgeR和DESeq2。今天我們就通過一個(gè)小規(guī)模的轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)來演示DESe...

0.5 塵世中一個(gè)迷途小書僮 0 16
DESeq2詳解系列(3)
接著前兩篇文章：DESeq2詳解系列(1)：http://www.reibang.com/p/88511070e2ddDESeq2詳解系列(2...

1.2 Shaoqian_Ma 0 12
一文學(xué)會常規(guī)轉(zhuǎn)錄組分析
數(shù)據(jù)來源：Cytosolic acetyl-CoA promotes histone acetylation predominantly at ...

2.7 TOP生物信息 1 18
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)---從原理到分析(Hisat2+Stringtie+Deseq2)
一念秧、首先放一段illumina測序平臺的官方原理鏈接： https://www.bilibili.com/video/BV1Cx411p7dm...

3.2 食品豬的生信雞 2 28

StringTie + DESeq2 進(jìn)行 RNA-seq 差異基因分析
按：RNA-seq 流程非常多樣化淤井，每一個(gè)步驟可選工具都非常多。我的選擇是 StringTie 進(jìn)行組裝取得 read counts 數(shù)值摊趾，DE...

2.1 BeeBee生信 8 35
miRNA的下一個(gè)研究浪潮币狠？A-to-I edited miRNA走起！
提到非編碼RNA砾层，大家最熟悉的就是miRNA, miRNA靶基因研究漩绵，miRNA-lncRNA研究等等。小編最近發(fā)現(xiàn)了一個(gè)miRNA的新研究...

5.3 唯問生物 0 16
R語言繪制火山圖
火山圖火山圖用于展示基因表達(dá)差異的分布肛炮，橫軸為Log2 Fold Change止吐，越偏離中心差異倍數(shù)越大；縱軸為(-1)*Log10 P_adj...

0.7 Seurat_Satija 0 9