DecontX是一種通過去除RNA測序數(shù)據(jù)中非細胞信號的工具塞茅，它適用于單細胞RNA測序數(shù)據(jù)和高通量RNA測序數(shù)據(jù)。https://github....
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DecontX - 去除單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中環(huán)境RNA污染
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如何科學(xué)選擇單細胞分析軟件呢启盛？
作者：Holiday審稿：童蒙編輯：amethyst 引言 對不同技術(shù)和實驗平臺產(chǎn)生的各種各樣的單細胞測序數(shù)據(jù)進行深入的比較，在目前看來技羔，仍然存...
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SCENIC/pySCENIC結(jié)果可視化 2022-11-08適用背景 之前寫了一篇文章介紹四步完成單細胞數(shù)據(jù)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)流程分析[http://www.reibang.com/p/71ed43163ce1]...
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單細胞軌跡分析之應(yīng)用篇作者僵闯，Evil Genius 最近見到了很多研究者，真的是不把單細胞軌跡分析當回事藤滥，拿到樣本不定義直接跑monocle鳖粟，這能對么？我看了都著急拙绊，...
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文獻學(xué)習(xí)005--[sc]如何開始單細胞測序數(shù)據(jù)分析這篇綜述今年6月1日發(fā)表在Journal of the American Society of Nephrology[IF=9.274]上向图。 在...
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RcisTarget||轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合基序富集RcisTarget準備 1.安裝RcisTarget所需要的程序包 另外，可以安裝一些其他程序包用來R進行cisTarget的交互式展示： R...
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SCENIC概念SCENIC workflow 包含3個主要步驟： 以single-cell RNA-seq數(shù)據(jù)推斷基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和細胞功能聚類 1.用GENIE...
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