大魔王魚(yú)魚(yú)魚(yú)

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SCENIC單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子分析
1. 簡(jiǎn)介 SCENIC（single-cell regulatory network inference and clustering）是一個(gè)...

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10x HD圖片配準(zhǔn)
目前經(jīng)手的10x HD數(shù)據(jù)，基本上都要進(jìn)行圖像配準(zhǔn)郑叠。建議先人工對(duì)齊裆装，然后再進(jìn)行spaceranger分析秋泳，以免分析完成后發(fā)現(xiàn)對(duì)不起齊潦闲，還要在調(diào)整...

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空間轉(zhuǎn)錄組-多樣本數(shù)據(jù)合并分析
1. 讀入單個(gè)樣本 2. 合并數(shù)據(jù) 這里補(bǔ)充一點(diǎn)更新：合并空間數(shù)據(jù)后hvg怎么處理？從github上參考作者回復(fù)轮锥，有個(gè)函數(shù)來(lái)生成整體的hvg Y...

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多組cellchat數(shù)據(jù)分析
1. 合并多組數(shù)據(jù) 2.繪制兩組circle圖 3.繪制兩組bubble圖更多詳情矫钓，可查看官方說(shuō)明Comparison_analysis_of...

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scDRS
MAGMA安裝下載linux版本，在服務(wù)器解壓即可使用舍杜。數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 gene location數(shù)據(jù)image.png reference da...

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使用GWAS分析與疾病相關(guān)的細(xì)胞類(lèi)型
數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 https://zhuanlan.zhihu.com/p/467150143[https://zhuanlan.zhihu.com/p...

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DecontX - 去除單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中環(huán)境RNA污染
DecontX是一種通過(guò)去除RNA測(cè)序數(shù)據(jù)中非細(xì)胞信號(hào)的工具新娜，它適用于單細(xì)胞RNA測(cè)序數(shù)據(jù)和高通量RNA測(cè)序數(shù)據(jù)。https://github....

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TCGA數(shù)據(jù)下載及處理
篩選數(shù)據(jù)既绩，加入cart 從cart中下載需要的文件紅框中為需要下載的文件概龄。我選擇了使用linux client和gdc_manifest.t...

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細(xì)胞通訊iTALK使用 - 獲取pathway LR信息
使用方法參考大佬寫(xiě)的就行 http://www.reibang.com/p/dfe35a2a02d4[https://www.jianshu....

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