使用susieR鑒定多個(gè)因果變異位點(diǎn)只需要兩個(gè)輸入文件铝穷,一個(gè)輸入文件是包含Zscore值的SNP位點(diǎn)(zscore.txt)钠怯,另一個(gè)文件是LD ...
之前教程提到過Metal是可以做Meta分析,除了Metal曙聂,PLINK也可以進(jìn)行Meta分析晦炊。命令如下所示: 輸入文件gwas1.plink文...
基因型比值比(genotypic odds ratio)和等位基因比值比(allelic odds ratio)是兩個(gè)不同的概念。一般而言宁脊,通過...
GWAS表型的標(biāo)準(zhǔn)化方法一般有Quantile normalization断国、Inverse rank normalization、Z-score...
mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS)作用:通過對多個(gè)表型相似的GWAS summary結(jié)果進(jìn)行聯(lián)合分析榆苞,發(fā)現(xiàn)更...
1稳衬、scDRS的計(jì)算原理如下所示: 圖片來源:Zhang M J, Hou K, Dey K K, et al. Polygenic enric...
LDSC 除了可以計(jì)算基因多效性、遺傳度坐漏、遺傳相關(guān)性[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg2MDA2MDQz...
本周最新文獻(xiàn)速遞20220522 一薄疚、精細(xì)解讀文獻(xiàn) 一 文獻(xiàn)題目: Single-nucleus chromatin accessibility...
本周最新文獻(xiàn)速遞20220515 一、精細(xì)解讀文獻(xiàn) 一 文獻(xiàn)題目: Multi-ancestry genetic study of type 2...