ImageJ-如何對(duì)特定范圍的細(xì)胞進(jìn)行面積和計(jì)數(shù)統(tǒng)計(jì)

石蠟切片.jpg

上圖所示的石蠟切片中茫舶,包含多種細(xì)胞類型械巡,但我只想框定一個(gè)范圍對(duì)特定細(xì)胞類型(導(dǎo)管)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,在ImageJ中怎么操作:

1.將圖片拖拽到ImageJ界面打開

2.將圖片轉(zhuǎn)為灰度圖

ImageJ菜單欄中Image--Type--8bit

圖片2.jpg

ImageJ--Adjust--Threshold在彈出的框中輕微拉動(dòng)滑條調(diào)整饶氏,讓細(xì)胞與細(xì)胞之間的界線更加清楚讥耗,不要有紅色粘連 ,對(duì)比兩幅圖,第2張為調(diào)整之后疹启,細(xì)胞之間的界線更加清晰古程。

圖片4.jpg

圖片5.jpg

調(diào)整好后關(guān)掉小窗口--點(diǎn)擊菜單欄第一個(gè)矩形框--框出想要統(tǒng)計(jì)的范圍
框好后,Ctrl+T--more--specify--設(shè)定框的大小--OK

圖片6.jpg

計(jì)算 Analyze--Analyze Particles--第一個(gè)框是設(shè)定大小喊崖,第二個(gè)是設(shè)置圓的曲率挣磨,如果默認(rèn)參數(shù),就會(huì)出現(xiàn):被紅色標(biāo)記的所有細(xì)胞都被計(jì)數(shù)并計(jì)算面積荤懂。

圖片8.jpg

解決方法:在步驟3茁裙,調(diào)整好細(xì)胞輪廓的邊界后,先用菜單欄中的第四個(gè)多邊形工具节仿,描繪出想要框定范圍內(nèi)的晤锥,最小的細(xì)胞,或者最大的細(xì)胞粟耻,點(diǎn)擊M測(cè)量查近。
我這里想統(tǒng)計(jì)面積較大的導(dǎo)管,所以描出范圍中看著最小的導(dǎo)管挤忙,得到一個(gè)最小面積界定。記下來用于設(shè)定size谈喳。
再進(jìn)行步驟4的操作册烈。

圖片9.jpg

圖片10.jpg

這樣就可以只篩選框定范圍內(nèi)的特定的導(dǎo)管細(xì)胞的面積,和個(gè)數(shù)。
Results中展示統(tǒng)計(jì)的細(xì)胞數(shù)目赏僧,面積信息大猛,一次設(shè)置不好,可以叉掉Results淀零,返回步驟5進(jìn)行重新調(diào)整參數(shù)挽绩。

整理記錄一下,希望可以幫助到更多的人
另外驾中,ImageJ在操作過程中怎么撤銷上一步的操作呢唉堪?一直沒有找到撤銷的快捷鍵或者方法。肩民。唠亚。。持痰。灶搜。

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