文獻學習111-正常人和胰腺癌結(jié)直腸癌肺癌和卵巢癌患者升高的cfDNA來源

23年10月的cancer discovery, IF: 29.1

癌癥液體活檢,是近年來炙手可熱的研究領(lǐng)域函卒。
其中最受人關(guān)注的是血液中的游離DNA(cfDNA)和循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)君纫,因為已經(jīng)有大量的研究證實,腫瘤在發(fā)生發(fā)展過程中會往血液中釋放大量的DNA片段焙畔,而且越是晚期的腫瘤,釋放的DNA越多全蝶。
但一直以來闹蒜,血液中cfDNA的來源并不明確。雖然目前的主流思想推測抑淫,腫瘤患者血液中增加的cfDNA是腫瘤細胞或者腫瘤周邊組織細胞受損死亡后釋放的绷落,但是目前并沒有確鑿的證據(jù)。

近日始苇,約翰斯·霍普金斯大學著名腫瘤學家Bert Vogelstein領(lǐng)銜的團隊砌烁,在腫瘤領(lǐng)域頂級期刊Cancer Discovery上發(fā)表了一項重磅研究成果,首次系統(tǒng)性探索了正常人和腫瘤患者血液中cfDNA的來源催式。
他們發(fā)現(xiàn)函喉,無論是正常人還是腫瘤患者,無論cfDNA的濃度是高還是低荣月,他們血液中約76%的cfDNA都來自于白細胞管呵,尤其是中性粒細胞。而不是主要來自腫瘤細胞哺窄,也不是主要來自腫瘤原發(fā)組織周圍的正常上皮細胞捐下。基于以上研究結(jié)果萌业,Vogelstein團隊認為坷襟,癌癥可能會對細胞周轉(zhuǎn)或DNA清除產(chǎn)生系統(tǒng)性影響。

作團隊首先回顧了一下之前的研究生年。在2018年發(fā)表在《science》上的一項大型隊列研究(納入了812名健康人和1005名癌癥患者)中婴程,健康人血液中cfDNA的平均濃度為4.3ng/ml,而I-III期癌癥患者血液中cfDNA的平均濃度為12.6ng/ml抱婉,而且不同癌種的cfDNA濃度存在差異档叔,肺癌相對較低,肝癌最高蒸绩。

健康人和癌癥患者cfDNA濃度的比較

為了探究健康人和癌癥患者體內(nèi)cfDNA的來源蹲蒲,以及癌癥患者血液中cfDNA水平增加的源頭,Vogelstein團隊使用了 whole genome bisulfite sequencing 分析了他們招募的64名健康人和178名I-IV期癌癥患者的cfDNA水平侵贵。
總的來看,64名健康人血液中cfDNA的平均濃度為6ng/ml缘薛,178名I-IV期癌癥患者血液中cfDNA的平均濃度為21.8ng/ml窍育。

研究結(jié)果顯示卡睦,在健康人中(下圖中的藍色線和點),無論受試者血漿中cfDNA的濃度如何漱抓,絕大多數(shù)cfDNA(平均79%)都來自白細胞表锻。而在白細胞來源的cfDNA中,有2/3來自中性粒細胞乞娄;B細胞和T細胞來源的cfDNA分別占白細胞來源cfDNA的16.4%和17.5%瞬逊。值得注意的是,無論cfDNA濃度的水平有多高仪或,來自中性粒細胞确镊、B細胞和T細胞的cfDNA占比都是相似的。除了白細胞來源的cfDNA之外范删,其他cfDNA主要來自肝(5.8%)蕾域、腸(4%)、心臟(3.5%)到旦、腦(3.1%)和肺(2.4%)旨巷。

數(shù)據(jù)分析結(jié)果顯示,在所有cfDNA濃度下添忘,白細胞貢獻的cfDNA量與cfDNA總濃度之間都存在線性相關(guān)采呐。說明那些血液cfDNA濃度較高的人,多余的cfDNA可能來自于特定受損的組織細胞的說法不合理搁骑。

Fig 2. 不同組織細胞對血液cfDNA的貢獻情況 (藍色代表健康人斧吐,紅色代表癌癥患者)

使用另一個獨立的reference進行解卷積也得到了類似的結(jié)果。正常樣本中靶病,白細胞來源的cfDNA占到了61.2 ± 23.4%会通。其中占比最多的依然是中性粒細胞來源的,其次是單核細胞娄周,NK 細胞涕侈,myeloid progenitors,B 細胞和T細胞煤辨。

Fig 3

接著作者分析了癌癥患者的數(shù)據(jù)裳涛。在納入的在178名癌癥患者中,直腸癌18众辨、肺癌31端三、卵巢癌36、胰腺癌93鹃彻。出乎意料的是郊闯,癌癥患者血液cfDNA的組織來源與健康人相似,約70.5%的cfDNA來自于白細胞(約2/3來自中性粒細胞),11.4%來自于肝团赁、5.9%來自于腸育拨、3.6%來自于心臟、3.1%來自于腦欢摄、2.2%來自于肺熬丧,以及2.2%來自于胰腺(Fig 2紅色線和點)。另一個解卷積策略也得到了一致的結(jié)果(Fig 3紅色線和點)怀挠。

目前的主流思想認為cfDNA可能來自與腫瘤細胞或者腫瘤原發(fā)組織周圍的正常上皮細胞析蝴,因為腫瘤的侵襲性進展會破壞周圍的組織÷塘埽基于前面的結(jié)果闷畸,Vogelstein團隊重點關(guān)注了cfDNA濃度較高的癌癥患者。但分析結(jié)果出乎他們的預(yù)料:與健康人一樣躬它,在cfDNA濃度較高的患者中腾啥,白細胞貢獻的DNA量也與cfDNA總濃度呈線性相關(guān)。說明該說法并不成立(Fig 2和Fig 3紅色點)冯吓。

隨后倘待,作者以腸癌患者為研究對象,探索了腫瘤細胞貢獻的變化组贺。結(jié)果發(fā)現(xiàn)凸舵,腫瘤貢獻的cfDNA占比與正常腸上皮細胞來源的cfDNA占比也存在線性關(guān)系。來自肺癌和胰腺癌的研究失尖,也得到了類似的結(jié)論啊奄。這再次證明,這些腸癌患者體內(nèi)cfDNA的增加不是癌細胞帶來的掀潮。

正常組織與腫瘤組織的cfDNA呈線性相關(guān)

由于多項研究發(fā)現(xiàn)菇夸,術(shù)后患者的cfDNA水平會增加。因此仪吧,作者探索了術(shù)后增加的cfDNA來源本涕。針對8例胰腺癌患者的數(shù)據(jù)分析結(jié)果顯示裙盾,這8名患者術(shù)前cfDNA處于正常水平凯旋,術(shù)后24小時cfDNA總濃度急劇升高2.3-18倍不等辟犀。甲基化分析得出了3個結(jié)論。

  1. 術(shù)后來自所有可評估組織來源的cfDNA濃度均有所增加出皇,但肺羞芍、大腦、食道郊艘、小腸荷科、胰腺和心臟的增加幅度較小唯咬。
術(shù)前/術(shù)后不同組織來源cfDNA的濃度變化
  1. 術(shù)后的cfDNA大部分(平均57%,范圍42%至70%)來自白細胞步做,在白細胞來源的cfDNA中副渴,中性粒細胞來源的占比最高(平均73%,范圍67%至82%)全度。
  2. 除肝臟來源cfDNA占比顯著增加(平均46倍)外,其他組織來源的cfDNA比例在術(shù)后都有所下降或僅有輕微變化斥滤。經(jīng)過計算之后将鸵,他們發(fā)現(xiàn)在新增加的cfDNA中,肝細胞平均貢獻了其中的38.2%(范圍為23.9%至57.6%)佑颇,而白細胞平均貢獻了其中的48.4%(范圍為23.3%至67.1%)顶掉。
術(shù)前/術(shù)后不同組織來源cfDNA的占比變化

基于以上數(shù)據(jù),以及之前研究觀察到的數(shù)據(jù)挑胸,作者認為痒筒,術(shù)后增加的cfDNA很可能是由于肝損傷造成的。

總的來說茬贵,Vogelstein團隊的這個研究表明簿透,與健康人相比,癌癥患者血液中的cfDNA增加解藻,不過增加的cfDNA并不是主要來自腫瘤組織或者腫瘤周圍的受損的健康組織老充,而是主要來自白細胞中的中性粒細胞。由于其他組織器官往血液中釋放的DNA也增加了螟左,因此這是一種系統(tǒng)性的全身效應(yīng)啡浊。可能是由于腫瘤細胞或腫瘤里的血管內(nèi)皮細胞釋放的系統(tǒng)因子胶背,加速了全身細胞的更替巷嚣,導致了cfDNA的系統(tǒng)性釋放。也可能是癌癥患者體內(nèi)細胞更替正常钳吟,但是cfDNA的清除出現(xiàn)障礙廷粒。

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