2021-07-04 RNA m6A修飾位點鑒定新策略-2

??今天繼續(xù)介紹不一樣的m6A修飾穩(wěn)定鑒定方法——一種基于RNA核酸內(nèi)切酶MazF對ACA與m6A修飾的ACA的切割活性差異的策略——MAZTER-seq 與m6A-REF-seq贪壳。


m6A修飾的ACA序列對MazF耐受

??MazF是一種RNA核酸內(nèi)切酶脏答，源自E. coli 毒素-抗毒素系統(tǒng)中的毒素蛋白莱革，能特異性切斷單鏈RNA中ACA序列5’末端的核酸內(nèi)切酶徒爹，不能切斷雙鏈RNA、雙鏈DNA及單鏈DNA澜搅。但是對于ACA基序中第一個A出現(xiàn)m6A修飾時刊侯，MazF無法進行切割讳苦，基于這樣的特性，結(jié)合m6A修飾位點常發(fā)生在GGAC這樣的基序中批狐，研究者開發(fā)了MAZTER-seq 與m6A-REF-seq扇售，通過確定切割位點即可用于進行全轉(zhuǎn)錄組m6A修飾位點的鑒定。


MAZTER-seq

Reference

  1. Garcia-Campos, M. A. et al. Deciphering the "m(6)A Code" via Antibody-Independent Quantitative Profiling. Cell 178, 731-747 e716 (2019).
  2. Zhang, Z. et al. Single-base mapping of m(6)A by an antibody-independent method. Science advances 5, eaax0250 (2019).
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