文章簡介:
本文通過單細胞多組學技術和空間轉錄組技術對患有唐氏綜合征(Ts21)的胎兒以及正常胎兒的骨髓和肝臟進行分析,構建了Ts21胎兒造血異常的高分辨率分子圖譜番甩。
樣本策略:scRNA-seq(15名Ts21胎兒和3名正常胎兒的肝臟和骨髓),snRNA-seq+scATAC-seq(3名Ts21胎兒和正常胎兒的肝臟)蹲堂,空間轉錄組測序(11名Ts21胎兒和5名正常胎兒的肝臟)掌猛。
應用技術:
scRNA-seq绰疤、snRNA-seq+scATAC-seq佩研、空間轉錄組測序柑肴、流式細胞術等。
研究亮點:
(1) 發(fā)現(xiàn)Ts21中基因表達的差異取決于細胞類型和環(huán)境旬薯,其中造血干細胞(HSCs)呈現(xiàn)“預分化”狀態(tài)晰骑;
(2) Ts21通過Ts21通過改變染色質可及性與基因表達之間的相關性,重構了調控元件-基因景觀绊序;
(3) 重構影響了對紅系分化至關重要的增強子活性和基因表達硕舆,以及與紅細胞系分化相關的調控網(wǎng)絡;
(4) 驗證了Ts21中觀察到的線粒體質量增加和氧化應激現(xiàn)象骤公,以及這些突變傾向于發(fā)生在HSCs表達基因的調控區(qū)域抚官。
研究意義:本研究不僅拓展了對唐氏綜合征胎兒造血異常的理解,還為唐氏綜合征相關的血液疾病提供了潛在的分子機制阶捆,這對于開發(fā)新的治療策略具有重要意義耗式。
文獻原文(DOI):10.1038/s41586-024-07946-4