8月16日寂纪,由深圳國(guó)家基因庫(kù)主辦,深圳華大生命科學(xué)研究院赌结、深圳市華大基因?qū)W院捞蛋、深圳市猛犸公益基金會(huì)協(xié)辦,DataCastle承辦的"數(shù)源杯"百萬(wàn)單細(xì)胞基因表達(dá)數(shù)據(jù)算法大賽決賽在深圳國(guó)家基因庫(kù)順利舉行姑曙。
經(jīng)過(guò)初賽襟交、復(fù)賽的嚴(yán)格評(píng)審篩選,10支隊(duì)伍從300余個(gè)參賽團(tuán)隊(duì)中脫穎而出進(jìn)入本次的最后決戰(zhàn)伤靠。經(jīng)過(guò)激烈角逐決出最終結(jié)果:來(lái)自華中科技大學(xué)的柳嘉鑫同學(xué)一舉奪魁,另外9支來(lái)自浙江大學(xué)、波士頓大學(xué)宴合、西安交通大學(xué)等高谢烂罚或機(jī)構(gòu)的隊(duì)伍分別榮獲二、三等獎(jiǎng)和優(yōu)秀獎(jiǎng)卦洽。
"數(shù)源杯"百萬(wàn)單細(xì)胞基因表達(dá)數(shù)據(jù)算法大賽于5月17日正式開啟贞言,鼓勵(lì)相關(guān)領(lǐng)域的研究人員和從業(yè)者以國(guó)家基因庫(kù)生命大數(shù)據(jù)平臺(tái)存儲(chǔ)的百萬(wàn)單細(xì)胞數(shù)據(jù)資源為基礎(chǔ),針對(duì)“聚類”這一單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析的重要步驟阀蒂,進(jìn)行單細(xì)胞聚類算法的開發(fā)和優(yōu)化该窗,進(jìn)而打造能夠降低內(nèi)存占用、提升運(yùn)算速度的優(yōu)質(zhì)計(jì)算工具蚤霞;與此同時(shí)酗失,為生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)昧绣、計(jì)算機(jī)科學(xué)等多領(lǐng)域的專業(yè)人才提供跨領(lǐng)域规肴、跨學(xué)科的技術(shù)交流平臺(tái)。本次大賽吸引了國(guó)內(nèi)外100余家知名高校和近90家企事業(yè)單位的專業(yè)技術(shù)人員參與夜畴,包括北京大學(xué)拖刃、清華大學(xué)、波士頓大學(xué)贪绘、費(fèi)城兒童醫(yī)院兑牡、中科院計(jì)算所、解放軍總醫(yī)院税灌、華為均函、騰訊、百度垄琐、平安科技等边酒。累計(jì)提交作品1819個(gè)。
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重磅開場(chǎng)
下午兩點(diǎn)狸窘,決賽正式開始墩朦,華大集團(tuán)聯(lián)合創(chuàng)始人、董事翻擒、理事長(zhǎng)楊煥明院士和深圳國(guó)家基因庫(kù)主任王韌博士分別發(fā)表寄語(yǔ)和致開幕辭氓涣。
楊煥明院士寄語(yǔ):“為什么要做單細(xì)胞?生命的基本結(jié)構(gòu)/功能單位是細(xì)胞陋气,今天我們就是把細(xì)胞水平和基因?qū)用娴难芯拷Y(jié)合起來(lái)劳吠。在這次的競(jìng)賽中你們每一個(gè)人都是勝利者,我更希望在你們中涌現(xiàn)出一些高手巩趁,改變我們對(duì)生命的認(rèn)識(shí)痒玩,改變現(xiàn)有生命解碼工具!”
王韌博士致辭:“今天我們迎來(lái)了入圍決賽的10支充滿創(chuàng)造力和活力的隊(duì)伍。你們擁有令人羨慕的青春年華和才學(xué)蠢古,最富有朝氣奴曙、最富有夢(mèng)想,勇于瞄準(zhǔn)科技前沿草讶,迎難而上洽糟,搶占先機(jī),用自己的智慧為我國(guó)單細(xì)胞研究工作貢獻(xiàn)力量堕战。生物學(xué)大廈不是一個(gè)人建立的坤溃,只有各位年輕的生物工作者通力合作,才能實(shí)現(xiàn)學(xué)術(shù)上的重要突破嘱丢。今天不只是一個(gè)比拼的戰(zhàn)場(chǎng)薪介,更是一個(gè)交流的平臺(tái),希望各位能在今天的比賽中激發(fā)新的靈感屿讽,擦出不一樣的火花昭灵!”
精彩答辯
浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院郭國(guó)驥教授、清華大學(xué)古槿副教授伐谈、哈工大(深圳)-奇安信數(shù)據(jù)安全研究院韓培義副院長(zhǎng)烂完、深圳華大生命科學(xué)研究院劉石平博士和國(guó)家基因庫(kù)生命大數(shù)據(jù)平臺(tái)負(fù)責(zé)人魏曉鋒坐鎮(zhèn)擔(dān)任決賽評(píng)委,進(jìn)入決賽的10支隊(duì)伍分別對(duì)各自的算法模型展開精彩論述诵棵。值得一提的是抠蚣,現(xiàn)有百萬(wàn)單細(xì)胞聚類算法的平均運(yùn)算時(shí)長(zhǎng)為6~8小時(shí),復(fù)賽階段排名第一的隊(duì)伍已經(jīng)將此時(shí)長(zhǎng)縮短到0.3小時(shí)履澳,大大提升了計(jì)算效率嘶窄。
每支參賽隊(duì)伍論述結(jié)束后,評(píng)委專家進(jìn)行提問(wèn)距贷,隨后從算法模型創(chuàng)新性柄冲、架構(gòu)設(shè)計(jì)、復(fù)雜度以及答辯過(guò)程的PPT陳述忠蝗、邏輯性等方面進(jìn)行評(píng)分现横。本次大賽的最終評(píng)分由線上得分和答辯得分兩部分組成,按二者加權(quán)后的最終得分進(jìn)行排名阁最。
10支參賽隊(duì)伍答辯完成后戒祠,韓培義副院長(zhǎng)作為專家代表、深圳華大生命科學(xué)研究院徐訊院長(zhǎng)作為大賽首席科學(xué)家分別為本次大賽進(jìn)行了總結(jié)和展望速种。
韓培義副院長(zhǎng)總結(jié)與展望:“計(jì)算機(jī)技術(shù)正在與其他學(xué)科交叉姜盈,尤其是生物學(xué)。大家應(yīng)當(dāng)善用公共數(shù)據(jù)庫(kù)(例如國(guó)家基因庫(kù)生命大數(shù)據(jù)平臺(tái))的數(shù)據(jù)和算力資源將想法付諸實(shí)踐配阵×笏蹋”
徐訊院長(zhǎng)總結(jié)與展望:“BT與IT融合(生物與信息融合)是“十四五”國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃示血,本次競(jìng)賽就是利用IT解決BT問(wèn)題的實(shí)際應(yīng)用。接下來(lái)數(shù)源杯還計(jì)劃圍繞時(shí)空組技術(shù)數(shù)據(jù)解析問(wèn)題發(fā)起競(jìng)賽饱亮,期待有越來(lái)越多不同學(xué)科背景的人才參與進(jìn)來(lái)矾芙,共同推進(jìn)BT與IT融合創(chuàng)新舍沙〗希”
冠軍出爐
經(jīng)過(guò)激烈的角逐,本次大賽的結(jié)果正式揭曉:
參賽選手與評(píng)委專家云合影拂铡。本次決賽根據(jù)國(guó)家疫情防控要求壹无,嚴(yán)格控制參會(huì)人數(shù),以“線上+線下”相結(jié)合的形式進(jìn)行感帅。
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至此"數(shù)源杯"百萬(wàn)單細(xì)胞基因表達(dá)數(shù)據(jù)算法大賽圓滿落幕斗锭。參賽選手們紛紛表示這既是一場(chǎng)有意義的競(jìng)賽,也是一次非常有趣的跨學(xué)科交流會(huì)失球,讓計(jì)算機(jī)岖是、數(shù)學(xué)、生物學(xué)等多學(xué)科背景的專業(yè)人才在此碰撞出新的數(shù)據(jù)分析思路实苞。
未來(lái)豺撑,國(guó)家基因庫(kù)將基于國(guó)家基因庫(kù)生命大數(shù)據(jù)平臺(tái)的數(shù)據(jù)和算力資源,以解決多組學(xué)數(shù)據(jù)分析難點(diǎn)問(wèn)題為目標(biāo)黔牵,持續(xù)舉辦數(shù)源杯系列大賽聪轿。通過(guò)跨領(lǐng)域人才的交流協(xié)作,促進(jìn)生物學(xué)與其他學(xué)科的交叉融合猾浦,推動(dòng)更多組學(xué)數(shù)據(jù)計(jì)算工具的開發(fā)及應(yīng)用陆错,為科學(xué)研究及產(chǎn)業(yè)發(fā)展帶來(lái)新視角。
首發(fā)公號(hào):國(guó)家基因庫(kù)大數(shù)據(jù)平臺(tái)??