做腫瘤糖酵解研究疫剃,這個(gè)檢測(cè)少不了

Seahorse能量代謝分析儀主要功能

1苦始、采用超敏感的生物傳感器和非接觸式設(shè)計(jì),真正實(shí)現(xiàn)檢測(cè)細(xì)胞零損傷慌申;

2陌选、實(shí)時(shí)檢測(cè)細(xì)胞線粒體、糖酵解的能量代謝情況蹄溉,即時(shí)反應(yīng)細(xì)胞生理狀態(tài)咨油;

3、同步檢測(cè)細(xì)胞的耗氧量和產(chǎn)酸率(pH值變化)柒爵,數(shù)據(jù)結(jié)果更加全面役电;

4、實(shí)現(xiàn)同時(shí)檢測(cè)96個(gè)細(xì)胞樣品棉胀,通量高法瑟,速度快;

5唁奢、自動(dòng)化控制檢測(cè)流程霎挟、自動(dòng)化控制添加多達(dá)四種藥物,操作方便高效麻掸。



原 理

Seahorse XF 技術(shù)可測(cè)量微孔板細(xì)胞周圍培養(yǎng)基中的氧通量(即耗氧率酥夭,oxygen consumption rate,OCR)和質(zhì)子通量(即細(xì)胞外酸化率extracellular acidification rate脊奋,ECAR)熬北。OCR 與線粒體呼吸成正比,而 ECAR 與糖酵解成正比诚隙。

1. 有氧呼吸(線粒體呼吸)

因?yàn)橛醒鹾粑窃诘谌A段(氧化磷酸化階段)才消耗氧分子讶隐,所以測(cè)定氧消耗速率反映的是有氧呼吸的水平以及潛力的變化。既然XF技術(shù)是實(shí)時(shí)檢測(cè)氧氣含量變化久又,那么我們肯定是需要細(xì)胞耗氧能力發(fā)生變化的巫延,所以我們可以將呼吸鏈上的不同蛋白逐個(gè)抑制掉。

1.1 ATP合成酶抑制劑——Oligomycin(寡霉素)

ATP合成酶籽孙,即線粒體復(fù)合物V烈评,是有氧呼吸最后一步釋放大量能量的關(guān)鍵分子火俄,其活性若被抑制則有氧呼吸在最后一步(合成ATP)被終止犯建,而前一階段(氧與質(zhì)子以及電子生成水)因下游“擁堵”導(dǎo)致耗氧停止(個(gè)人理解,若有誤瓜客,請(qǐng)大咖們批評(píng)更正)适瓦。下降的這部分為ATP production(這個(gè)概念很容易理解)或ATP-linked respiration(這個(gè)概念不是很好理解竿开,我的疑問是這個(gè)概念似乎更應(yīng)該直接抑制complex IV,這樣可以直接終止其介導(dǎo)的耗氧反應(yīng))玻熙。

▲線粒體膜上電子傳遞鏈以及測(cè)試過程中使用的四種藥物


1.2 線粒體解偶聯(lián)劑——FCCP

這里的解偶聯(lián)解的是氧化反應(yīng)和磷酸化反應(yīng)之間的偶聯(lián)否彩,氧化反應(yīng)可以理解為電子的傳遞過程,這個(gè)過程中會(huì)總伴隨著自由能的釋放(即形成質(zhì)子梯度差)嗦随,在ATP合成酶介導(dǎo)的最后一步反應(yīng)時(shí)列荔,這些自由能轉(zhuǎn)化到了ATP中。FCCP可以通過減小質(zhì)子在線粒體內(nèi)膜兩側(cè)的梯度差枚尼,導(dǎo)致氧化反應(yīng)和磷酸化反應(yīng)不再偶聯(lián)贴浙,但復(fù)合物IV介導(dǎo)的耗氧反應(yīng)仍可繼續(xù),氧消耗率繼續(xù)上升署恍,線粒體膜間區(qū)域的質(zhì)子濃度繼續(xù)上升崎溃,直至達(dá)到上限。高出基礎(chǔ)耗氧的部分即為儲(chǔ)備有氧呼吸能力(reserve capacity)盯质。


▲線粒體壓力測(cè)試圖譜


1.3 復(fù)合物 I 和 III (有氧呼吸)抑制劑——魚藤酮和抗霉素(rotenone & antimycin)

電子傳遞鏈的起點(diǎn)復(fù)合物 I 以及復(fù)合物 III 被抑制則整個(gè)氧化磷酸化(線粒體呼吸)過程被抑制袁串,因此剩下的則是非線粒體驅(qū)動(dòng)的耗氧。


看到這里呼巷,你是不是覺得囱修,做了上述指標(biāo)的檢測(cè)跟我們標(biāo)題所說的糖酵解基本沒啥關(guān)系?

對(duì)的王悍,可以說基本沒啥關(guān)系蔚袍,但也可以順便測(cè)一下

。我們重點(diǎn)要做的糖酵解還得看下面的內(nèi)容配名!


2. 胞外酸化率(反映糖酵解總體功能)

葡萄糖經(jīng)酶促反應(yīng)生成丙酮酸這一過程為糖酵解啤咽,在此過程中清寇,不需要消耗氧泥栖,所以跟前面的耗氧率沒有啥關(guān)系拦键。在沒有線粒體的參與下藏澳,丙酮酸最終轉(zhuǎn)化為乳酸武鲁,排到細(xì)胞外宁昭。所以骤菠,我們通過另一個(gè)指標(biāo)來反映糖酵解——酸化率铃肯。

2.1 呼吸的起點(diǎn)——葡萄糖

加葡萄糖后開始第一步反應(yīng)为朋,糖酵解臂拓,這很好理解。

2.2 ATP合成酶抑制劑——寡霉素(Oligomycin)

這里跟前面是一樣的作用习寸,主要用來阻斷有氧呼吸最后一步胶惰。為什么不用魚藤酮、抗霉素抑制復(fù)合物I和III抑制有氧呼吸的開始霞溪,目前還不是很能理解孵滞。等我搞明白了中捆,再來補(bǔ)充。

2.3 糖酵解抑制劑——2-DG

2-DG(2-脫氧葡萄糖)可與葡萄糖競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合糖酵解途徑的己糖激酶(糖酵解第一個(gè)限速酶)坊饶,因而抑制糖酵解泄伪。


▲糖酵解壓力測(cè)試圖譜(糖酵解功能關(guān)鍵參數(shù))


3. 糖酵解質(zhì)子流出率(更進(jìn)一步表征糖酵解的實(shí)時(shí)變化)

除了檢測(cè)耗氧率和胞外酸化率,Seahorse XF技術(shù)還可以檢測(cè)質(zhì)子流出率(proton efflux rate匿级,PER)蟋滴。主要利用魚藤酮/抗霉素和2-DG來相應(yīng)地改變有氧呼吸和糖酵解的質(zhì)子流(如下圖)。

▲糖酵解速率檢測(cè)原理


▲安捷倫 Seahorse XFp 糖酵解速率測(cè)定圖譜痘绎。


活細(xì)胞的質(zhì)子外流包括糖酵解和線粒體源性酸化脓杉。線粒體酸化。通過線粒體功能的抑制作用简逮。(Rot/AA) 對(duì)線粒體功能的抑制作用球散,可計(jì)算線粒體相關(guān)的酸化。將線粒體酸化減去總質(zhì)子流出率散庶,得出糖酵解質(zhì)子流出率蕉堰。


Agilent Seahorse XFp 糖酵解速率分析儀的原理。能量由細(xì)胞內(nèi)的兩種途徑產(chǎn)生--糖酵解和線粒體呼吸悲龟。在糖酵解過程中屋讶,葡萄糖分解為乳酸時(shí),質(zhì)子被擠出到細(xì)胞外介質(zhì)中须教,XFp 分析儀檢測(cè)到的是 ECAR皿渗。此外,線粒體 TCA 活動(dòng)會(huì)產(chǎn)生二氧化碳轻腺,使培養(yǎng)基水化和酸化乐疆。在檢測(cè)過程中使用復(fù)合體 I 和復(fù)合體 III 線粒體抑制劑(Rot/AA)抑制呼吸作用(OCR),可計(jì)算出呼吸作用的質(zhì)子外流率贬养,并從總質(zhì)子外流率中去除挤土,得出糖酵解質(zhì)子外流率(glycoPER)。為確認(rèn)途徑的特異性误算,注入糖酵解抑制劑 2-DG仰美,以阻止糖酵解酸化。


更 多 背 景 知 識(shí)

一儿礼、有氧呼吸的三個(gè)階段

1. 糖酵解

葡萄糖在細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)中分解為兩分子的丙酮酸咖杂,釋放少量能量:C6H12O6+酶→2丙酮酸(C3H4O3)+4[H]+能量(2ATP)。

2. TCA循環(huán)/檸檬酸循環(huán)

線粒體基質(zhì)中蚊夫,兩分子的丙酮酸分解為CO2和少量能量:2丙酮酸(C3H4O3)+6H2O+酶→6CO2+20[H]+能量(2ATP)诉字。包含乙酰CoA的形成這一準(zhǔn)備階段,乙酰CoA進(jìn)入線粒體內(nèi)參與的這個(gè)循環(huán)才是嚴(yán)格意義上的TCA循環(huán)階段。

3. 氧化磷酸化

這需要線粒體內(nèi)膜上的呼吸鏈的參與奏窑,又被稱為電子傳遞鏈(electron transport chain)磷酸化导披。線粒體內(nèi)膜上屈扎,ETC與氧結(jié)合埃唯,釋放大量能量:24[H]+6O2+酶→12H2O+能量(34ATP)。


---more---

氧化磷酸化的工作原理是利用釋放能量的化學(xué)反應(yīng)來驅(qū)動(dòng)需要能量的反應(yīng):這樣的反應(yīng)稱為是偶聯(lián)反應(yīng)鹰晨。電子在電子傳遞鏈上從電子供體(如NADH)到電子受體(如氧)的流動(dòng)墨叛,是一個(gè)放能的過程,而ATP的合成是一個(gè)耗能的過程模蜡,需要輸入能量漠趁。電子傳遞鏈和ATP合酶都在膜中,在稱為“化學(xué)滲透”的過程中忍疾,通過質(zhì)子穿過這層膜的運(yùn)動(dòng)闯传,將能量從電子傳遞鏈轉(zhuǎn)移到ATP合酶中。


前兩個(gè)階段獲得的ATP屬于底物水平的磷酸化(高能化合物通過酶促反應(yīng)使能量傳遞給ADP生成ATP)卤妒,而氧化磷酸化是指電子在從被氧化(需氧)的底物傳遞到氧的過程中甥绿,釋放出來的自由能推動(dòng)ADP生成ATP的過程。


呼吸鏈(即ETC)由四部分組成: 復(fù)合體I(NADH) 则披、復(fù)合體II(FADH2)共缕、復(fù)合體III和復(fù)合體IV。除此之外士复,還需要泛醌(CoQ)和細(xì)胞色素C(CytC)參與電子的傳遞图谷。傳遞順序如下 (從左到右) :

圖1. 呼吸鏈【1】


由于線粒體內(nèi)膜的兩側(cè)的氫離子濃度存在高低梯度(內(nèi)側(cè)(膜間區(qū)域)濃度比外側(cè)(線粒體基質(zhì)區(qū)域)濃度大),而位于內(nèi)膜上的ATP合成酶(復(fù)合物V)阱洪,可以將氫離子通過F0的氫離子通道便贵,使氫離子從高濃度的內(nèi)側(cè)回流到低濃度的外側(cè),即回流到線粒體基質(zhì)中冗荸,而 F1通過氫離子回流的能量嫉沽,驅(qū)動(dòng)ADP生成ATP。

圖2. 呼吸鏈上全部復(fù)合物及其相應(yīng)功能【3】


二俏竞、名詞解釋

氧化磷酸化是一個(gè)生物化學(xué)過程绸硕,發(fā)生在真核細(xì)胞的線粒體內(nèi)膜或原核生物的細(xì)胞質(zhì)中,是物質(zhì)在體內(nèi)氧化時(shí)釋放的能量通過呼吸鏈供給ADP與無機(jī)磷酸合成ATP的偶聯(lián)反應(yīng)魂毁。

ATP合成酶玻佩,又稱FoF?-ATP酶在細(xì)胞內(nèi)催化能源物質(zhì)ATP的合成。在呼吸或光合作用過程中通過電子傳遞鏈釋放的能量先轉(zhuǎn)換為跨膜質(zhì)子(H+)梯度差(可想象為高水位的勢(shì)能)席楚,之后質(zhì)子流順質(zhì)子梯差通過ATP合酶驅(qū)動(dòng)使ADP和磷酸鹽(Pi)合成ATP(類似水流帶動(dòng)發(fā)電機(jī)發(fā)電)咬崔。合成一個(gè)ATP分子所需的質(zhì)子數(shù)估計(jì)為為3至4個(gè)。


解偶聯(lián)劑(uncoupler),指一類能抑制偶聯(lián)磷酸化的化合物垮斯。能使氧化與磷酸化脫離(即解偶聯(lián))郎仆,雖然氧化照常進(jìn)行,但因不能進(jìn)行磷酸化而不能生成ATP兜蠕,使P/O比值降低扰肌,甚至為零。FCCP(全稱是Carbonyl cyanide 4-(trifluoromethoxy)phenylhydrazone熊杨,同CCCP曙旭;酸性芳香族化合物)是一種有效的線粒體氧化磷酸化解偶聯(lián)劑 (IC50 = 20 nM),是一種代謝毒素晶府,通過跨線粒體內(nèi)膜運(yùn)輸質(zhì)子(H+能夠直接通過線粒體內(nèi)膜擴(kuò)散桂躏,而無需通過ATP合成酶,見圖3右上角部分)來破壞 ATP 合成川陆,使線粒體膜電位去極化剂习。

圖3. 細(xì)胞呼吸過程【4】


糖酵解質(zhì)子流出率(glycolytic proton efflux rate,glycoPER)较沪,糖酵解過程中源自糖酵解的質(zhì)子向細(xì)胞外介質(zhì)中排出的速率鳞绕,不考慮CO2依賴性酸化的作用。這一測(cè)量結(jié)果與細(xì)胞外乳酸生成率高度相關(guān)购对。


質(zhì)子滲漏(proton leak):質(zhì)子遷移到基質(zhì)中猾昆,但沒有產(chǎn)生 ATP,這使得底物氧和 ATP 的產(chǎn)生不能完全耦合骡苞。


有氧糖酵解垂蜗,在正常生理情況下,細(xì)胞只在限氧條件下進(jìn)行糖酵解解幽,而癌細(xì)胞即使在有氧條件下也傾向于進(jìn)行糖酵解贴见;這被稱為沃伯格(Warburg)效應(yīng)或有氧糖酵解,是癌細(xì)胞與正常細(xì)胞的區(qū)別所在躲株。


▲腫瘤細(xì)胞Warburg效應(yīng)與正常細(xì)胞的有氧呼吸代謝途徑的比較【6】




參考文獻(xiàn)

1. https://www.zhihu.com/question/416165432

2. https://zhuanlan.zhihu.com/p/629486604

3. https://istudy.pk/electron-transport-chain/

4. https://www.chegg.com/homework-help/questions-and-answers/refer-summary-diagram-cellular-respiration--fccp-metabolic-poison-allows-mathrm-h-diffuse--q122295525

5. https://www.agilent.com/cs/library/usermanuals/public/103346-400.pdf

6. Arora A, Singh S, Bhatt A N, et al. Interplay between metabolism and oncogenic process: role of microRNAs[J]. Translational oncogenomics, 2015, 7: 11.



?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末片部,一起剝皮案震驚了整個(gè)濱河市,隨后出現(xiàn)的幾起案子霜定,更是在濱河造成了極大的恐慌档悠,老刑警劉巖,帶你破解...
    沈念sama閱讀 219,490評(píng)論 6 508
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件望浩,死亡現(xiàn)場(chǎng)離奇詭異辖所,居然都是意外死亡,警方通過查閱死者的電腦和手機(jī)磨德,發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 93,581評(píng)論 3 395
  • 文/潘曉璐 我一進(jìn)店門缘回,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來吆视,“玉大人,你說我怎么就攤上這事酥宴±舶桑” “怎么了?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 165,830評(píng)論 0 356
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵拙寡,是天一觀的道長(zhǎng)授滓。 經(jīng)常有香客問我,道長(zhǎng)倒庵,這世上最難降的妖魔是什么褒墨? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 58,957評(píng)論 1 295
  • 正文 為了忘掉前任炫刷,我火速辦了婚禮擎宝,結(jié)果婚禮上,老公的妹妹穿的比我還像新娘浑玛。我一直安慰自己绍申,他們只是感情好,可當(dāng)我...
    茶點(diǎn)故事閱讀 67,974評(píng)論 6 393
  • 文/花漫 我一把揭開白布顾彰。 她就那樣靜靜地躺著极阅,像睡著了一般。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪涨享。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上筋搏,一...
    開封第一講書人閱讀 51,754評(píng)論 1 307
  • 那天,我揣著相機(jī)與錄音厕隧,去河邊找鬼奔脐。 笑死,一個(gè)胖子當(dāng)著我的面吹牛吁讨,可吹牛的內(nèi)容都是我干的髓迎。 我是一名探鬼主播,決...
    沈念sama閱讀 40,464評(píng)論 3 420
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼建丧,長(zhǎng)吁一口氣:“原來是場(chǎng)噩夢(mèng)啊……” “哼排龄!你這毒婦竟也來了?” 一聲冷哼從身側(cè)響起翎朱,我...
    開封第一講書人閱讀 39,357評(píng)論 0 276
  • 序言:老撾萬榮一對(duì)情侶失蹤橄维,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎,沒想到半個(gè)月后拴曲,有當(dāng)?shù)厝嗽跇淞掷锇l(fā)現(xiàn)了一具尸體争舞,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 45,847評(píng)論 1 317
  • 正文 獨(dú)居荒郊野嶺守林人離奇死亡,尸身上長(zhǎng)有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點(diǎn)故事閱讀 37,995評(píng)論 3 338
  • 正文 我和宋清朗相戀三年疗韵,在試婚紗的時(shí)候發(fā)現(xiàn)自己被綠了兑障。 大學(xué)時(shí)的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片。...
    茶點(diǎn)故事閱讀 40,137評(píng)論 1 351
  • 序言:一個(gè)原本活蹦亂跳的男人離奇死亡,死狀恐怖流译,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出逞怨,到底是詐尸還是另有隱情,我是刑警寧澤福澡,帶...
    沈念sama閱讀 35,819評(píng)論 5 346
  • 正文 年R本政府宣布叠赦,位于F島的核電站,受9級(jí)特大地震影響革砸,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏除秀。R本人自食惡果不足惜,卻給世界環(huán)境...
    茶點(diǎn)故事閱讀 41,482評(píng)論 3 331
  • 文/蒙蒙 一算利、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望册踩。 院中可真熱鬧,春花似錦效拭、人聲如沸暂吉。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 32,023評(píng)論 0 22
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽(yáng)慕的。三九已至,卻和暖如春挤渔,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間肮街,已是汗流浹背。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 33,149評(píng)論 1 272
  • 我被黑心中介騙來泰國(guó)打工判导, 沒想到剛下飛機(jī)就差點(diǎn)兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留嫉父,地道東北人。 一個(gè)月前我還...
    沈念sama閱讀 48,409評(píng)論 3 373
  • 正文 我出身青樓骡楼,卻偏偏與公主長(zhǎng)得像熔号,于是被迫代替她去往敵國(guó)和親。 傳聞我的和親對(duì)象是個(gè)殘疾皇子鸟整,可洞房花燭夜當(dāng)晚...
    茶點(diǎn)故事閱讀 45,086評(píng)論 2 355

推薦閱讀更多精彩內(nèi)容

  • 來到我入學(xué)的時(shí)節(jié)了篮条, 1.非細(xì)胞凋亡形式的細(xì)胞死亡可通過釋放與先天免疫受體識(shí)別的危險(xiǎn)相關(guān)分子模式引發(fā)無菌炎癥弟头。 然...
  • 4.1 能與細(xì)胞 4.1.1 能是做功的本領(lǐng) 化學(xué)能是分子中的勢(shì)能,是活的生物體內(nèi)最重要的能量形式。我們?cè)谟懻摷?xì)胞...
    墨羽濛雪閱讀 4,517評(píng)論 0 0
  • 1. 氧化磷酸化 2. 線粒體呼吸鏈 3. 氧化磷酸化抑制劑 3.1 線粒體呼吸抑制劑 3.2 磷酸化抑制劑 3....
    Hayley筆記閱讀 3,706評(píng)論 1 6
  • 1涉茧、植物的水分生理 一赴恨、考試要求 1、了解并掌握植物對(duì)水分的需要的基本概念伴栓,理解植物的含水量伦连、植物體內(nèi)水分的存在狀...
    木木子kinoko閱讀 5,671評(píng)論 1 10
  • 第一章蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能 第 一 節(jié) 蛋 白 質(zhì) 的 分 子 組 成 一雨饺、組成蛋白質(zhì)的元素 1、主要有C惑淳、H额港、O、...
    Guangchao閱讀 3,476評(píng)論 2 7