『簡述』以大豆疫霉XEG1為核心,簡述病原菌與寄主之間的協(xié)同進(jìn)化

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  1. 大家好袁辈,今天主要圍繞大豆疫霉核心效應(yīng)子XEG1匯報寄主與病原之間的關(guān)系。
  2. 為了確保XEG1的故事完整性珠漂,我將主要以第二篇文章為主晚缩,其余4篇文章作為支撐,從研究背景媳危,研究進(jìn)展橡羞,以及討論三個方面展開匯報。
  3. 植物有免疫系統(tǒng)嗎济舆?我們知道卿泽,從植物免疫概念的提出,到現(xiàn)在不斷完善的植物免疫信號網(wǎng)絡(luò)滋觉,經(jīng)過三十年的研究签夭,已經(jīng)明確,除了物理防御外椎侠,植物具有兩層免疫系統(tǒng)第租。
  4. 三十年來,植物免疫系統(tǒng)不斷豐富和完善我纪,近幾年的研究也明確了慎宾,植物兩層免疫系統(tǒng)并非涇渭分明丐吓,而是存在相互放大的協(xié)同關(guān)系。一層是由模式觸發(fā)的PTI趟据,另一層是由效應(yīng)子觸發(fā)的ETI券犁。而今天我們主要聚焦寄主與病原相互作用的第一戰(zhàn)場——質(zhì)外體。在第一戰(zhàn)場的研究焦點(diǎn)也無非是模式與受體的識別汹碱。
  5. 過去三十年來粘衬,已有60多個已知配體的受體被鑒定,但是真正以效應(yīng)子作為pamp分子的受體其實(shí)只有少數(shù)幾個是明確的咳促。下面我們就舉例幾個模式和受體相互作用的模型作為引入稚新。
  6. 通常來說,我們對模式和受體的關(guān)系跪腹,認(rèn)知是不足的褂删,或者說是單一的。一般冲茸,模式的受體大都是依賴共受體笤妙,僅有少數(shù)通過單一受體發(fā)揮識別作用。這都是作為典型PTI通路的認(rèn)識噪裕。比如右邊蘋果腐爛病菌valsa mali的一個激發(fā)子蹲盘,通過煙草VIGS,很容易就鑒定到了其受體是的RLP膳音。
  7. 第二個例子是幾丁質(zhì)觸發(fā)的免疫模型召衔,稻瘟病菌會分泌幾丁質(zhì)酶Mochia1降解chitin,阻斷chitin觸發(fā)的免疫祭陷;但同時植物質(zhì)外體存在一種四胎重復(fù)蛋白TPR1苍凛,可以優(yōu)先識別這種幾丁質(zhì)酶,以保護(hù)chitin不被降解兵志,從而恢復(fù)幾丁質(zhì)觸發(fā)的免疫醇蝴。因為這里的TPR1未發(fā)現(xiàn)有其他生物學(xué)功能,因此mochia作為一個負(fù)調(diào)控植物免疫的因子想罕,其是否有真正的受體悠栓,還未知。同時按价,質(zhì)外體蛋白OsMBL1也發(fā)揮類似的功能惭适。
  8. 第三個例子就比較神奇,壞死性病原菌分泌的Tox1被細(xì)胞壁相關(guān)受體激酶識別后會觸發(fā)寄主感病性楼镐。換句話說就是壞死性病原體(如結(jié)節(jié)狀芽孢桿菌)劫持了通常與生物營養(yǎng)性病原體抗性相關(guān)的分子途徑癞志。這也說明了壞死性和生物營養(yǎng)性病原菌與寄主植物相互作用的敏感性和抗性的復(fù)雜性。
  9. 后面框产,我將圍繞這5篇文獻(xiàn)講述XEG1的故事凄杯。這些文獻(xiàn)都是由南京農(nóng)業(yè)大學(xué)王源超老師團(tuán)隊發(fā)表的错洁。
  10. 首先,通過質(zhì)譜鑒定到一個大豆疫霉激發(fā)子戒突,可以和卵菌INF1一樣引起煙草過敏性壞死屯碴,而且這種壞死是依賴信號肽的,也就是說XEG可能在質(zhì)外體作為pamp發(fā)揮功能妖谴。需要注意的是窿锉,這里XEG1有兩種亞型酌摇。
  11. 通過外源施加純化蛋白膝舅,可以觸發(fā)多種植物的過敏性壞死,同時可以誘發(fā)煙草和大豆的抗病性窑多,這也進(jìn)一步表明XEG1是一個pamp分子仍稀。
  12. 通常,作為pamp分子埂息,一般是由定位于膜上的模式識別受體識別技潘。為了鑒定XEG1的受體,他們首先驗證了XEG1觸發(fā)的過敏性壞死是否依賴共受體BAK1和SOBIR1,煙草VIGS實(shí)驗表明:XEG1依賴BAK1而不依賴SOBIR1千康。然后很快就明確了RXEG1是受體享幽。
  13. 然后作者進(jìn)一步明確了,XEG1對RXEG1的唯一依賴性和RXEG1對XEG1的唯一識別性拾弃。雙向證明RXEG1就是XEG1的受體值桩。
  14. IP實(shí)驗也證實(shí)了前面煙草沉默的結(jié)果.
  15. 前面是壞死的情況,那從觸發(fā)免疫反應(yīng)方面豪椿,也明確了XEG1觸發(fā)的植物免疫是依賴RXEG1的奔坟。講到這里,這個故事主要的內(nèi)容似乎已經(jīng)結(jié)束了搭盾。盡管我沒有按照文章發(fā)表的時間順序來說咳秉,但是從邏輯上來說鑒定到一個激發(fā)子的受體,就到此為止了鸯隅。但是后面的故事才是寄主和病原協(xié)同進(jìn)化的核心澜建。
  16. 實(shí)際上,該團(tuán)隊同時還通過IP-MS檢測到一種與番茄木葡聚糖特異性內(nèi)切葡聚糖酶抑制劑蛋白XEGIP具有37%氨基酸同一性的蛋白蝌以,將其命名為大豆葡聚糖酶抑制蛋白1(GmGIP1)霎奢。pull down和co-IP證實(shí)了PsXEG1和GmGIP1之間的相互作用。GmGIP1與天冬氨酸蛋白酶相似饼灿,但缺乏關(guān)鍵的催化天冬氨酸殘基幕侠。當(dāng)GmGIP1在本氏煙中表達(dá)時,未檢測到PsXEG1的不穩(wěn)定性碍彭。此外晤硕,還證實(shí)了XEG1-GmGIP1相互作用是特異性的悼潭。
  17. 通過蛋白結(jié)構(gòu)同源建模發(fā)現(xiàn)GmGIP1與PsXEG1互作中存在5個可能的關(guān)鍵互作區(qū)段,將這幾個區(qū)段的氨基酸替換為丙氨酸后舞箍,通過Co-IP發(fā)現(xiàn)G5區(qū)域在互作中發(fā)揮決定作用舰褪。
  18. 到這里,就有一個問題疏橄,既然XEG1可以被RXEG1識別占拍,以觸發(fā)寄主的PTI反應(yīng),這里的GmGIP1與XEG1互作又如何解釋捎迫?因為GmGIP1是一個葡聚糖酶抑制蛋白晃酒。接下來作者研究了GmGIP1是否可以抑制PsXEG1對木葡聚糖的水解。與GmGIP1G5突變體的作用相比窄绒,增加純化的GmGIP1蛋白的量強(qiáng)烈抑制了PsXEG1催化的木葡聚糖體外解聚贝次。PsXEG1活性較低并非由于GmGIP1引起的不穩(wěn)定性,因為PsXEG1與GmGIP1孵育6小時后依然穩(wěn)定彰导。這些結(jié)果表明蛔翅,GmGIP1可以作為PsXEG1葡聚糖酶活性的抑制劑。
  19. 也正因此位谋,過表達(dá)GmGIP1能夠介導(dǎo)大豆對大豆疫霉病的抗性山析,而過表達(dá)G5突變體不能增強(qiáng)抗性。同時沉默GmGIP1掏父,顯著增加了對大豆疫霉的易感性笋轨。
  20. 前面是從寄主的角度出發(fā),探索了寄主對XEG1的抑制作用损同。而從XEG1對大豆疫霉毒力貢獻(xiàn)的角度看,兩個酶活位點(diǎn)的突變顯著減弱了其毒,XEG1對毒力的貢獻(xiàn)依賴酶活翩腐。
  21. 為了確定GmGIP1是否可能抑制其他PsXEG1家族成員,通過Co-IP分析膏燃。在測試的10個蛋白中茂卦,只有一個叫PsXEG1樣蛋白1(PsXLP1)顯示出與GmGIP1的相互作用。PsXLP1與PsXEG1具有約67%的氨基酸序列一致性组哩。然而等龙,PsXLP1比PsXEG1短52個殘基,因為在C端附近的缺失導(dǎo)致了對酶活性至關(guān)重要的一個殘基的丟失(E222)伶贰。這兩種蛋白都靶向質(zhì)外體蛛砰。
  22. 鑒于他們的序列相似性,評估PsXLP1的水解酶活性黍衙。結(jié)果表明泥畅,PsXLP1缺乏與PsXEG1相當(dāng)?shù)乃饷富钚浴?
  23. 為了鑒定結(jié)合GmGIP1所需的PsXLP1的氨基酸,作者通過三維結(jié)構(gòu)建模預(yù)測PsXLP1的五個區(qū)域(X1至X5)與GmGIP1相互作用琅翻,其中一些相互作用殘基與PsXEG1共享位仁,一些不同柑贞。接下來,測試五個區(qū)域中每一個區(qū)域的丙氨酸取代突變破壞與GmGIP1相互作用的能力聂抢。Co-IP結(jié)果表明:X1钧嘶、X2、X3和X5都是PsXLP1與GmGIP1的完全結(jié)合所必需的琳疏。
  24. 那XEG1和XLP1存在怎樣的關(guān)系呢有决?作者發(fā)現(xiàn):PsXLP1的表達(dá)模式與PsXEG1的表達(dá)模式十分相似。
  25. 此此外空盼,PsXEG1和PsXLP1基因在大豆疫霉基因組中相距2370個堿基對书幕,頭對頭排列,這種頭對頭排列廣泛存在于已測序的幾乎所有疫霉我注。
  26. 鑒于XLP1與XEG在某些方面的相似性按咒,毒力測定表明:活性位點(diǎn)突變體及關(guān)鍵互作位點(diǎn)突變體過表達(dá)后對大豆表現(xiàn)出更強(qiáng)的毒力迟隅。而PsXLP1缺失表現(xiàn)出更弱的毒力但骨。
  27. 兩個實(shí)驗的結(jié)果是一致的。即智袭,GmGIP1結(jié)合PsXLP1所需的殘基對于PsXLP1對毒力的貢獻(xiàn)至關(guān)重要奔缠。但PsXLP1的酶活性不參與對毒力的貢獻(xiàn)。
  28. 由于PsXLP1的GmGIP1結(jié)合活性是其毒力貢獻(xiàn)所必需的吼野,因此接下來測試了GmGIP-PsXEG1復(fù)合物是否可以被PsXLP1破壞校哎。結(jié)果表明,PsXLP存在時瞳步,PsXEG1-GmGIP1相互作用顯著降低闷哆,但在PsXLP1X123存在時,其相互作用不變单起。PsXEG1和GmGIP1相互作用的減少不是由于蛋白質(zhì)不穩(wěn)定性抱怔,因為PsXLP1蛋白質(zhì)存在時蛋白質(zhì)水平?jīng)]有變化。為了測試PsXLP1如何從GmGIP1復(fù)合物中取代PsXEG1嘀倒,通過ITC測定了GmGIP對PsXEG1和PsXLP 1的體外結(jié)合親和力屈留。解離常數(shù)(Kd)表明,PsXLP1與GmGIP1的結(jié)合強(qiáng)度是PsXEG1的5倍测蘑。這些結(jié)果表明灌危,PsXLP1可能保護(hù)PsXEG1免受GmGIP1結(jié)合。
  29. 大豆疫霉PsXLP1的過表達(dá)可中和轉(zhuǎn)基因大豆毛狀根中GmGIP1的過表達(dá)所提供的防御碳胳。同時勇蝙,毛狀根中的PsXLP1過表達(dá)不會增加對大豆疫霉PsXEG1敲除株的敏感性。
  30. XLP1對XEG1的這種保護(hù)機(jī)制可能被許多疫霉屬物種使用挨约。
  31. 總的來說大豆疫霉部署了誘餌(PsXLP1)來破壞植物防御味混。
  32. 前面提到藕帜,XEG1有兩種亞型,XEG1在質(zhì)外體被降解惜傲。其中較小亞型比較大亞型對降解更敏感洽故,表明較大亞型被翻譯后修飾。用蛋白質(zhì)合成抑制劑環(huán)己酰亞胺(CHX)阻斷新蛋白質(zhì)合成后盗誊,瞬時表達(dá)的PsXEG1迅速降解时甚。較小的亞型對降解特別敏感。此外哈踱,天冬氨酸蛋白酶抑制劑PepA顯著抑制了PsXEG1的降解荒适。
  33. 質(zhì)外體定位的PsXEG1抑制劑GmGIP1是一種非活性天冬氨酸蛋白酶樣蛋白,它與PsXEG1直接相互作用开镣。為了確定GmGIP1的酶活性同源物是否靶向PsXEG1降解刀诬,全基因組分析了可能的活性天冬蛋白酶澈蚌。其中有兩個表現(xiàn)出與PsXEG1相似的表達(dá)特征章姓,Co-IP結(jié)果表明,GmAP5可以與PsXEG1結(jié)合共郭,Western也證實(shí)了GmAP5對PsXEG1的降解树埠,但其他共表達(dá)大豆蛋白沒有降解糠馆。并且GmAP5在體外只能與PsXEG1的較小亞型互作。此外怎憋,消除GmGIP1結(jié)合的PsXEG1突變PsXEG1X1又碌,2,3不影響與GmAP5的結(jié)合绊袋,表明GmAP5和GmGIP1與PsXEG1的結(jié)合不同毕匀。
  34. 進(jìn)一步用糖苷酶A或者F處理后,較大亞型的PsXEG1顯著減少癌别,同時用糖基化抑制劑突尼斯霉素TM處理后皂岔,只有較小亞型的PsXEG1表達(dá)。這些結(jié)果表明规个,較大亞型是糖基化的PsXEG1,較小亞型是非糖基化的PsXEG1凤薛。為了研究糖基化在PsXEG1毒力貢獻(xiàn)中的作用,作者分別創(chuàng)制了兩個糖基化位點(diǎn)替換的轉(zhuǎn)化子诞仓,發(fā)現(xiàn)他們的毒力均減弱缤苫。這些結(jié)果表明,PsXEG1的兩個糖基化位點(diǎn)是其對大豆疫霉毒力的完全所必需的墅拭。我們先前表明活玲,木糖葡聚糖酶活性是PsXEG1毒力貢獻(xiàn)所必需的。我們通過體外木糖葡糖酶活性測定證明,木糖聚糖的酶降解不需要PsXEG1的N-糖基化舒憾。
  35. PsXEG1分泌不需要N-糖基化镀钓。然而,在CHX阻斷新蛋白質(zhì)的合成后镀迂,瞬時表達(dá)的PsXEG1N174A和N190A-HA迅速降解丁溅。在使用與純化的PsXEG1蛋白混合的大豆質(zhì)外體液的體外試驗中,PsXEG1N174Q和N190Q(由大豆生產(chǎn))在質(zhì)外體液體存在下迅速降解探遵,但天冬氨酸蛋白酶抑制劑Pep A基本上阻止了這種降解窟赏。為了確認(rèn)這些突變蛋白的不穩(wěn)定性是由于缺乏糖基化所致,還測試了去糖基化的PsXEG1箱季;當(dāng)與大豆質(zhì)外體液混合時涯穷,其也被降解,但在Pep A的存在下不被降解藏雏】娇觯總之,這些結(jié)果表明天冬氨酸蛋白酶參與了細(xì)胞外液對非糖基化PsXEG1的降解掘殴。
  36. N-糖基化在大豆疫霉感染期間保護(hù)PsXEG1不被GmAP5降解赚瘦。為了評估GmAP5和PsXEG1之間的特異性相互作用是否發(fā)生在大豆疫霉感染期間,我們用CRISPR引入的兩種攜帶PsXEG1基因突變的大豆疫霉菌杯巨,即T91(PsXAG1N174A和N190A)和T3(PsXEG1Δ)蚤告,接種過表達(dá)或沉默GmAP5的大豆毛狀根努酸。當(dāng)GmAP5在根中過表達(dá)時服爷,與WT分離物相比,T91感染顯著減少获诈。相反仍源,表達(dá)未糖基化的PsXEG1的T91轉(zhuǎn)化體在GmAP5沉默的轉(zhuǎn)基因植物上恢復(fù)了毒力。然而舔涎,PsXEG1敲除系T3引起了大豆毛狀根的類似感染笼踩,無論GmAP5是沉默還是過度表達(dá)。這些結(jié)果表明亡嫌,GmAP5在大豆防御中的作用取決于PsXEG1的存在嚎于,并且N-糖基化在大豆疫霉感染期間保護(hù)了PsXEG1免受GmAP5的攻擊。
  37. 總的來說挟冠,大豆疫霉菌進(jìn)化出一個PsXEG1的同源蛋白PsXLP1于购,PsXLP1通過C端缺失喪失了酶活性但逃避了GmAP5的識別,以“誘餌模式”與PsXEG1競爭性結(jié)合GmGIP1知染,從而掩護(hù)PsXEG1對寄主的進(jìn)攻肋僧。同時,PsXEG1通過糖基化修飾武裝自己不被寄主分泌的保外天冬氨酸蛋白酶降解。這些研究全面闡明了寄主與病原菌在質(zhì)外體間發(fā)生的多重復(fù)雜免疫模式嫌吠。
  38. 最后的兩張片子通過結(jié)構(gòu)的解析明確:RXEG1與XEG1的結(jié)合止潘,抑制了XEG1的酶活和毒力水平。
  39. 并解釋了RXEG1識別XEG1后招募共受體BAK1的結(jié)合辫诅。
  40. 總的來說:大豆疫霉進(jìn)化出誘餌蛋白凭戴,以保護(hù)自身核心毒力因子的致病功能,以此抵御寄主的防御輸出炕矮。然而寄主與病原協(xié)同進(jìn)化過程中的復(fù)雜關(guān)系還有待更多的研究簇宽。
  41. 謝謝大家。

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