Stata極簡(jiǎn)生存分析

1. 導(dǎo)入數(shù)據(jù)

webuse drugtr,clear
*webuse -- Use dataset from Stata website
stset,clear
*上一行命令導(dǎo)入進(jìn)來的數(shù)據(jù)是“生存時(shí)間數(shù)據(jù)”,會(huì)比最原始的數(shù)據(jù)多四列遭京,這一行命令的目的是重置為原始數(shù)據(jù)杰扫,之所以這樣做元践,是為了顯示數(shù)據(jù)處理的全部過程
codebook drug
codebook studytime
codebook died
codebook age
*codebook -- Describe data contents

2. 將原始數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為生存數(shù)據(jù)

stset studytime,failure(died==1)
*指定生存時(shí)間為studytime列萨咳,終止(failure)事件為died列族展,其中值為1表示終止
stsum
stdescribe
sts list
*以上幾個(gè)為描述命令

3. KM生存曲線

sts graph,by(drug)
*畫KM生存曲線
sts graph if age < 50,by(drug)
sts graph,by(drug) risktable
*生存曲線下方加表格

4. log-rank檢驗(yàn)

sts test drug
*檢驗(yàn)兩組差異是否顯著窝稿,默認(rèn)為log-rank檢驗(yàn)

5. Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型

stcox drug
stcox drug age
*cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型从绘,可以解讀為控制另一個(gè)(些)變量,當(dāng)前變量對(duì)發(fā)生終點(diǎn)事件風(fēng)險(xiǎn)的影響

6. PH假定的檢驗(yàn)

estat phtest
*Tests of proportional-hazards assumption撵幽,零假設(shè)為納入Cox回歸模型的變量滿足PH假定

stphplot, by(drug)adjust(age)
*by(drug)adjust(age)表示控制age變量看drug對(duì)發(fā)生終點(diǎn)事件的影響
*從圖形看PH假定灯荧,若兩條線近似平行,可以認(rèn)為是成立的
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