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文章題目：Multimodal Analysis of Composition and Spatial Architecture in Human Squamous Cell Carcinoma
發(fā)表期刊：《Cell》
影響因子：45.5
PART 1? ?研究背景
皮膚鱗狀細(xì)胞癌（cSCC）主要特征是組織極性破壞和基底膜侵襲，是惡性腫瘤的一種。西米普利單抗/Cemiplimab是一款全人源PD-1抗體贴唇，用于轉(zhuǎn)移性/局部晚期皮膚鱗狀細(xì)胞癌的藥物。但耐藥和生物標(biāo)志物預(yù)測(cè)反應(yīng)的不足伦忠，需要更好地表征腫瘤微環(huán)境(TME)中的免疫抑制。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)（SC-RNA-Seq）揭示了許多癌癥類(lèi)型的腫瘤內(nèi)異質(zhì)性(ITH)稿辙，確定了驅(qū)動(dòng)耐藥昆码、預(yù)測(cè)轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)和介導(dǎo)可塑性的細(xì)胞群，但研究往往缺乏識(shí)別腫瘤特異性生物學(xué)所需的正常組織比較和組織分離過(guò)程中空間信息的丟失邻储。然而赋咽，空間轉(zhuǎn)錄組能夠同時(shí)捕獲TME內(nèi)數(shù)十種細(xì)胞類(lèi)型的位置，這對(duì)于理解腫瘤-基質(zhì)串?dāng)_至關(guān)重要吨娜。
本研究將單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序與空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)和來(lái)自一系列人類(lèi)cSCC和配對(duì)正常皮膚的多重離子束成像相結(jié)合脓匿，揭示了cSCC的空間異質(zhì)性，突出了控制相關(guān)細(xì)胞類(lèi)型定位和狀態(tài)的潛在細(xì)胞間信號(hào)宦赠，并為進(jìn)一步研究腫瘤和免疫動(dòng)力學(xué)提供了資源陪毡。
PART 2? 技術(shù)路線(xiàn)
PART 3? 研究結(jié)論
為了確定皮膚鱗狀細(xì)胞癌(cSCC)的細(xì)胞組成和結(jié)構(gòu)，本研究將單細(xì)胞測(cè)序與空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)和來(lái)自一系列人類(lèi)cSCC和配對(duì)正常皮膚的多重離子束成像相結(jié)合勾扭。cSCC表現(xiàn)出四個(gè)腫瘤亞群毡琉，三個(gè)涵蓋了正常表皮狀態(tài)的群體，以及癌癥特有的腫瘤特異性角化細(xì)胞(TSK)群妙色，其定位于纖維血管生態(tài)位桅滋。單細(xì)胞和空間數(shù)據(jù)映射的配體-受體網(wǎng)絡(luò)與特定細(xì)胞類(lèi)型的整合，揭示了TSK細(xì)胞是細(xì)胞間通訊的樞紐身辨。此外丐谋，本研究觀察到潛在免疫抑制的多種特征，包括T調(diào)節(jié)細(xì)胞(Treg)與CD8 T細(xì)胞在區(qū)隔化腫瘤基質(zhì)中的共定位煌珊。最后号俐，研究通過(guò)人類(lèi)腫瘤異種移植物的單細(xì)胞特性和體內(nèi)CRISPR篩選確定了特定腫瘤亞群富集基因網(wǎng)絡(luò)在腫瘤發(fā)生中的重要作用。這些數(shù)據(jù)定義了cSCC腫瘤和基質(zhì)細(xì)胞亞群之間相互作用的空間生態(tài)位定庵，以及它們參與癌癥的交流基因網(wǎng)絡(luò)吏饿。
