單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組之腫瘤免疫微環(huán)境篇-2篇高分文章研究思路獨家奉上留特!

案例1

文章信息

文章題目:胃袖狀切除術(shù)引發(fā)的小鼠肝細(xì)胞再生可改善非酒精性脂肪肝的研究

發(fā)表期刊:International Journal of Surgery

影響因子:12.5

技術(shù)路線

結(jié)果展示

圖1.單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組揭示SG后肝細(xì)胞群的變化划滋。A)PCA分析碎节;B)降維聚類分析蟹瘾;C)細(xì)胞群注釋;D)細(xì)胞亞群聚類統(tǒng)計腹尖;E)各亞群功能分析柳恐;F)Marker基因通路分析;G)基因表達(dá)定量集分析;H)實時定量PCR檢測

研究結(jié)論

本研究通過單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組乐设、空間轉(zhuǎn)錄組測序發(fā)現(xiàn)SG手術(shù)能增強(qiáng)飲食肥胖小鼠的肝臟再生能力讼庇,改善肝臟代謝,并且證明這種肝臟再生能力的增強(qiáng)與肝臟脂肪變性的改善無關(guān)近尚。這項研究為更好地理解SG手術(shù)誘導(dǎo)代謝改善的機(jī)制提供了依據(jù)蠕啄。

案例2

文章信息

文章題目:單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)揭示了不同垂體神經(jīng)內(nèi)分泌腫瘤譜系中不同的免疫浸潤表型和巨噬細(xì)胞-腫瘤相互作用軸

發(fā)表期刊:Genome medicine

影響因子:10.4

技術(shù)路線

結(jié)果展示

圖2.三種不同PitNETs譜系中腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞的三種不同亞型。A)降維聚類分析戈锻;B)不同亞型巨噬細(xì)胞Marker基因氣泡圖歼跟;C)三種不同譜系中五種巨噬細(xì)胞亞型占比;D格遭,E)Marker基因小提琴圖哈街;F-H)免疫熒光;I)流式細(xì)胞術(shù)分析拒迅;J)擬時序分析骚秦;K)基因及相關(guān)通路熱圖。

研究結(jié)論

本研究采用多組學(xué)技術(shù)璧微,結(jié)合大樣本數(shù)據(jù)作箍,揭示了不同PitNET譜系腫瘤異質(zhì)性,并詳細(xì)闡述了PitNET的免疫全景圖往毡。scRNA-seq和365樣本例bulk RNA-seq的分析結(jié)果顯示蒙揣,三種譜系PitNETs可分為6個亞型靶溜,且不同譜系具有高开瞭、中、低三型腫瘤免疫微環(huán)境罩息。通過分析免疫細(xì)胞中腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞(TAM)的亞群嗤详,識別出五群TAM,分別為LYVE1+瓷炮、ISG15+葱色、GPNMB+、C1Q+娘香、CX3CR1+ TAM苍狰。最后,作者通過空間轉(zhuǎn)錄組等實驗方法驗證了CX3CR1+TAM的配體受體對烘绽,并在體內(nèi)與體外驗證CX3CR1+TAM通過INHBA-ACVR1B軸調(diào)節(jié)SF1譜系腫瘤細(xì)胞凋亡淋昭,有望作為PitNETs后續(xù)治療的靶點。

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末安接,一起剝皮案震驚了整個濱河市翔忽,隨后出現(xiàn)的幾起案子,更是在濱河造成了極大的恐慌,老刑警劉巖歇式,帶你破解...
    沈念sama閱讀 206,013評論 6 481
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件驶悟,死亡現(xiàn)場離奇詭異,居然都是意外死亡材失,警方通過查閱死者的電腦和手機(jī)痕鳍,發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 88,205評論 2 382
  • 文/潘曉璐 我一進(jìn)店門,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來龙巨,“玉大人额获,你說我怎么就攤上這事」вΓ” “怎么了抄邀?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 152,370評論 0 342
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵,是天一觀的道長昼榛。 經(jīng)常有香客問我境肾,道長,這世上最難降的妖魔是什么胆屿? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 55,168評論 1 278
  • 正文 為了忘掉前任奥喻,我火速辦了婚禮,結(jié)果婚禮上非迹,老公的妹妹穿的比我還像新娘环鲤。我一直安慰自己,他們只是感情好憎兽,可當(dāng)我...
    茶點故事閱讀 64,153評論 5 371
  • 文/花漫 我一把揭開白布性穿。 她就那樣靜靜地躺著,像睡著了一般溃肪。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪损俭。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上,一...
    開封第一講書人閱讀 48,954評論 1 283
  • 那天亿汞,我揣著相機(jī)與錄音瞭空,去河邊找鬼。 笑死疗我,一個胖子當(dāng)著我的面吹牛咆畏,可吹牛的內(nèi)容都是我干的。 我是一名探鬼主播吴裤,決...
    沈念sama閱讀 38,271評論 3 399
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼旧找,長吁一口氣:“原來是場噩夢啊……” “哼!你這毒婦竟也來了嚼摩?” 一聲冷哼從身側(cè)響起钦讳,我...
    開封第一講書人閱讀 36,916評論 0 259
  • 序言:老撾萬榮一對情侶失蹤矿瘦,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎,沒想到半個月后愿卒,有當(dāng)?shù)厝嗽跇淞掷锇l(fā)現(xiàn)了一具尸體缚去,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 43,382評論 1 300
  • 正文 獨居荒郊野嶺守林人離奇死亡,尸身上長有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點故事閱讀 35,877評論 2 323
  • 正文 我和宋清朗相戀三年琼开,在試婚紗的時候發(fā)現(xiàn)自己被綠了易结。 大學(xué)時的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片。...
    茶點故事閱讀 37,989評論 1 333
  • 序言:一個原本活蹦亂跳的男人離奇死亡柜候,死狀恐怖搞动,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出,到底是詐尸還是另有隱情渣刷,我是刑警寧澤鹦肿,帶...
    沈念sama閱讀 33,624評論 4 322
  • 正文 年R本政府宣布,位于F島的核電站辅柴,受9級特大地震影響箩溃,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏。R本人自食惡果不足惜碌嘀,卻給世界環(huán)境...
    茶點故事閱讀 39,209評論 3 307
  • 文/蒙蒙 一涣旨、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望。 院中可真熱鬧股冗,春花似錦霹陡、人聲如沸。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 30,199評論 0 19
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽。三九已至导俘,卻和暖如春峦耘,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間,已是汗流浹背旅薄。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 31,418評論 1 260
  • 我被黑心中介騙來泰國打工, 沒想到剛下飛機(jī)就差點兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留泣崩,地道東北人少梁。 一個月前我還...
    沈念sama閱讀 45,401評論 2 352
  • 正文 我出身青樓,卻偏偏與公主長得像矫付,于是被迫代替她去往敵國和親凯沪。 傳聞我的和親對象是個殘疾皇子,可洞房花燭夜當(dāng)晚...
    茶點故事閱讀 42,700評論 2 345

推薦閱讀更多精彩內(nèi)容