一般的電腦配置都可以厚满，我測試win核心數(shù)8運行內(nèi)存16G也比較流暢
生信 | 生信人搭建數(shù)據(jù)庫的學習流程寫在前面 目前各種組學培訓(xùn)開展的如火如荼夺谁，卻鮮有生物信息學數(shù)據(jù)庫搭建的相關(guān)教程和學習流程青抛。原因有以下幾個： 1.學習數(shù)據(jù)庫的搭建付出多旗闽，回報少。有這功夫應(yīng)該可以把大部分組學知...
發(fā)簡信
IP屬地：江蘇
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生信 | iSeq超便捷适室！快速下載GSA/SRA/ENA的數(shù)據(jù)以及metadata信息一、寫在前面 最近在下載GSA數(shù)據(jù)的時候發(fā)現(xiàn)一個小工具iSeq举瑰，簡直太好用了捣辆，分享給大家！iSeq的GitHub鏈接：https://github.com/BioOmics/...
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目前嘗試使用TOBIAS： https://github.com/loosolab/TOBIAS
生信 | ATAC-Seq基礎(chǔ)分析+高級分析+多組學分析
寫在前面 其實很多作者已經(jīng)探索的差不多了此迅，相關(guān)腳本汽畴、教程也很多旧巾，但我還是自己系統(tǒng)的總結(jié)一下吧。有時候感覺是浪費時間整袁，但是在寫的時候能發(fā)現(xiàn)并學習到很多新的知識菠齿，不斷記錄反思，也...
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@一車小面包人 不是軟件問題绳匀，配置問題
生信 | Circos實戰(zhàn)
寫在前面 由于circos官網(wǎng)的教程太全面了炸客，雖然好但反而感覺比較復(fù)雜疾棵，難易上手，因此我將他們精簡了一下痹仙。由于官網(wǎng)的教程中包含的數(shù)據(jù)太雜了是尔，所以我精簡了數(shù)據(jù)與代碼放到了扣扣群...
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這里不是嚴格的bed开仰，不用的
生信 | circos文件準備大全（以擬南芥為例）
一、寫在前面 扣扣群：559758504（目前無需驗證众弓，一鍵即可加入） 如果你不想學恩溅，老板又催著要，你可以加群私聊我尋求幫助( $ _ $ )谓娃，但還是自己學，知識都是自己的滨达。...
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@Yy0324 可以
生信 | ATAC-Seq基礎(chǔ)分析+高級分析+多組學分析
寫在前面 其實很多作者已經(jīng)探索的差不多了奶稠，相關(guān)腳本捡遍、教程也很多锌订，但我還是自己系統(tǒng)的總結(jié)一下吧。有時候感覺是浪費時間稽莉，但是在寫的時候能發(fā)現(xiàn)并學習到很多新的知識，不斷記錄反思污秆，也...
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加載比較慢造成的吧
生信 | IGV Web快速搭建（無需root劈猪，無需更改配置文件）
最近需要將ATAC-Seq生成的bw導(dǎo)入IGV查看peak的分布情況良拼，但是一個個的將bw文件從服務(wù)器上下載到本地再傳到IGV里面太麻煩了战得，偶然間就看到了IGV官網(wǎng)上有一個叫做...
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單細胞之軌跡分析-2：monocle2 原理解讀+實操軌跡分析系列： 單細胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.reibang.com/p/ee0f7a8e6a06] 擬時間序列分析（Pseudot...
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@moral_vacuum 按理來說常侦，R中得Warning message不會影響結(jié)果的輸出呀浇冰，你看看有沒有輸出結(jié)果
生信 | 構(gòu)建物種的OrgDb
寫在前面 本文主要參考生信小白2018[http://www.reibang.com/p/bb4281e6604e]與多啦A夢的時光機[https://www.jiansh...
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僅包含基因ID即可，含有列名（可隨意定義）肘习。按列排列
生信 | 構(gòu)建物種的OrgDb
寫在前面 本文主要參考生信小白2018[http://www.reibang.com/p/bb4281e6604e]與多啦A夢的時光機[https://www.jiansh...
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win下面的文件夾沒有刪除權(quán)限
生信 | 構(gòu)建物種的OrgDb
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放一下你的代碼坡倔，因為大概率是你代碼敲多或敲少一個括號
生信 | 構(gòu)建物種的OrgDb
寫在前面 本文主要參考生信小白2018[http://www.reibang.com/p/bb4281e6604e]與多啦A夢的時光機[https://www.jiansh...
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@生信調(diào)包俠 參考： http://www.reibang.com/p/44a3c17a64f1
生信 | 基因組組裝實戰(zhàn)（二）：Survey數(shù)據(jù)質(zhì)控、NT比對
寫在前面 以下內(nèi)容均來自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培訓(xùn)班上記錄的課堂筆記 1. Survey分析的目的 ...
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@生信調(diào)包俠 你可以自己了解一下nt比對后的格式投蝉，自己調(diào)整，或者用別人寫好的代碼征堪，如：https://blog.csdn.net/weixin_44616693/article/details/127179909
生信 | 基因組組裝實戰(zhàn)（二）：Survey數(shù)據(jù)質(zhì)控瘩缆、NT比對
寫在前面 以下內(nèi)容均來自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培訓(xùn)班上記錄的課堂筆記 1. Survey分析的目的 ...
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@生信調(diào)包俠 想突出顯示某個染色體信息佃蚜，并不一定需要放大庸娱，比較好的方法是調(diào)整染色體的間距和半徑r的大小，從而實現(xiàn)突出重點谐算。如：https://cn.bing.com/images/search?view=detailV2&;ccid=FzjmithH&id=D480FF075541F88BFBA612E4E64024EE980966AF&thid=OIP.FzjmithH5mASQPdpA8PJFwHaHa&mediaurl=https%3a%2f%2fwenlongshen.github.io%2fimg%2fpost%2f2017_03_26_circos_links.png&exph=500&expw=500&q=circos%e6%95%99%e7%a8%8b&simid=607992770496713063&FORM=IRPRST&ck=4363CC4492E0FA9A5C777A7289297A55&selectedIndex=19&ajaxhist=0&ajaxserp=0
生信 | circos文件準備大全（以擬南芥為例）
一涌韩、寫在前面 扣扣群：559758504（目前無需驗證，一鍵即可加入） 如果你不想學氯夷，老板又催著要，你可以加群私聊我尋求幫助( $ _ $ )腮考，但還是自己學，知識都是自己的玄捕。...
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是“repos=NULL”踩蔚，如果改正之后依舊不行的話枚粘，增加“type”馅闽，如：install.packages("/org.Cauratus.eg.db", repos=NULL, type="source")。依舊不行馍迄，win下面估計需要安裝rtools之后再安裝
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寫在前面 本文主要參考生信小白2018[http://www.reibang.com/p/bb4281e6604e]與多啦A夢的時光機[https://www.jiansh...
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"./org.Cferus.eg.db/"中后面的/去掉
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在Win10中安裝Ubuntu為什么要使用WSL 本地調(diào)試/測試服務(wù)器程序工作電腦是Win10系統(tǒng)，但目前大部分公司的服務(wù)器都是linux系統(tǒng)攀圈，某些要部署到服務(wù)器上的程序需要在本地進行測試時，因啟動腳本都...
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所有物種均適用
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emapper中包含的只是K號现喳，并不知道通路代表什么意思凯傲，使用通過json文件解析才能對應(yīng)上，后面也用orgdb做的時候才能顯示出來通路的名稱嗦篱，不然都是K號冰单，你也不知道是什么
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