MUMmer輸出delta文件后惨寿，通過delta-filter文件delta進(jìn)一步整理养距，運(yùn)行5天了，輸出文件一直是0快鱼，也沒有報(bào)錯(cuò)哟楷，請(qǐng)問一下這種情況正常嗎
MUMMER 兩個(gè)基因組間比較最近在看泛基因組學(xué)馍刮，學(xué)習(xí)了下MUMMER軟件（http://mummer.sourceforge.net/manual/）：適用于兩個(gè)全基因組（基因草圖or完整基因組）的快速...
你好簸搞，你的結(jié)果最后跑出來了嗎？我也遇到你一樣的情況
生信分析|MUMmer4+SyRi前言 Comparing SVs between two genome：use whole-genome alignment 1塞栅、MUMmer4 MUMmer is a sy...
@xuzhougeng MUMmer輸出delta文件后者铜，通過delta-filter文件delta進(jìn)一步整理，運(yùn)行5天了，輸出文件一直是0作烟，也沒有報(bào)錯(cuò)愉粤，請(qǐng)問一下這種情況正常嗎
應(yīng)該是最新最詳細(xì)的MUMmer中文使用說明如何使用MUMmer比對(duì)大片段序列 測(cè)序技術(shù)剛開始發(fā)展的時(shí)候，大家得到的序列都是單個(gè)基因的長(zhǎng)度拿撩，所以一般都是逐個(gè)基因的比較衣厘，用的都是BLAST或FASTA通過逐個(gè)基因聯(lián)配的方...
請(qǐng)問一下我的delta文件大概5G，delta-filter運(yùn)行5天了 輸出文件一直是0压恒，也沒有報(bào)錯(cuò)這種情況正常嗎
MUMMER 兩個(gè)基因組間比較MUMmer出現(xiàn)的歷史背景測(cè)序技術(shù)剛開始發(fā)展的時(shí)候影暴，大家得到的序列都是單個(gè)基因的長(zhǎng)度，所以一般都是逐個(gè)基因的比較探赫，用的都是BLAST或FASTA通過逐個(gè)基因聯(lián)配的方式搜索數(shù)據(jù)...
@就是大餅 請(qǐng)問一下型宙，如果有多個(gè)同源基因?qū)Γ遣皇窃谶\(yùn)行hyphy之前要對(duì)每對(duì)同源基因?qū)M(jìn)行構(gòu)樹伦吠，然后計(jì)算每對(duì)同源基因?qū)Φ倪x擇壓力
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我也遇到了同樣的問題妆兑，應(yīng)該是蛋白序列出了問題，用軟件把cds轉(zhuǎn)成蛋白序列在往下做
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您上面的例子蛋白序列比對(duì)和構(gòu)樹都是用一個(gè)物種的蛋白嗎毛仪？
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