zz_a46c

MUMmer輸出delta文件后，通過delta-filter文件delta進(jìn)一步整理，運(yùn)行5天了，輸出文件一直是0拳氢，也沒有報(bào)錯(cuò)，請(qǐng)問一下這種情況正常嗎

MUMMER 兩個(gè)基因組間比較

最近在看泛基因組學(xué)，學(xué)習(xí)了下MUMMER軟件（http://mummer.sourceforge.net/manual/）：適用于兩個(gè)全基因組（基因草圖or完整基因組）的快速...

生信要進(jìn)步

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zz_a46c

你好圣蝎，你的結(jié)果最后跑出來了嗎？我也遇到你一樣的情況

生信分析|MUMmer4+SyRi

前言 Comparing SVs between two genome：use whole-genome alignment 1衡瓶、MUMmer4 MUMmer is a sy...

行走的脫發(fā)機(jī)double

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zz_a46c

@xuzhougeng MUMmer輸出delta文件后徘公，通過delta-filter文件delta進(jìn)一步整理，運(yùn)行5天了哮针，輸出文件一直是0关面，也沒有報(bào)錯(cuò)，請(qǐng)問一下這種情況正常嗎

應(yīng)該是最新最詳細(xì)的MUMmer中文使用說明

如何使用MUMmer比對(duì)大片段序列 測(cè)序技術(shù)剛開始發(fā)展的時(shí)候十厢，大家得到的序列都是單個(gè)基因的長(zhǎng)度等太，所以一般都是逐個(gè)基因的比較，用的都是BLAST或FASTA通過逐個(gè)基因聯(lián)配的方...

xuzhougeng

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zz_a46c

請(qǐng)問一下我的delta文件大概5G蛮放，delta-filter運(yùn)行5天了 輸出文件一直是0澈驼，也沒有報(bào)錯(cuò)這種情況正常嗎

MUMMER 兩個(gè)基因組間比較

MUMmer出現(xiàn)的歷史背景測(cè)序技術(shù)剛開始發(fā)展的時(shí)候，大家得到的序列都是單個(gè)基因的長(zhǎng)度筛武，所以一般都是逐個(gè)基因的比較缝其，用的都是BLAST或FASTA通過逐個(gè)基因聯(lián)配的方式搜索數(shù)據(jù)...

生信師姐

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zz_a46c

@就是大餅 請(qǐng)問一下挎塌，如果有多個(gè)同源基因?qū)Γ遣皇窃谶\(yùn)行hyphy之前要對(duì)每對(duì)同源基因?qū)M(jìn)行構(gòu)樹内边，然后計(jì)算每對(duì)同源基因?qū)Φ倪x擇壓力

hyphy計(jì)算選擇壓力(+pal2nal的使用)

官網(wǎng)：http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...

就是大餅

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zz_a46c

我也遇到了同樣的問題榴都，應(yīng)該是蛋白序列出了問題，用軟件把cds轉(zhuǎn)成蛋白序列在往下做

hyphy計(jì)算選擇壓力(+pal2nal的使用)

官網(wǎng)：http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...

就是大餅

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zz_a46c

您上面的例子蛋白序列比對(duì)和構(gòu)樹都是用一個(gè)物種的蛋白嗎漠其？

hyphy計(jì)算選擇壓力(+pal2nal的使用)

官網(wǎng)：http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...

就是大餅

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zz_a46c

前言 “沒有什么比知道我們自己正在做什么更重要了” ——小史艺沼，20191121之感觸 這...