有許多不同的統(tǒng)計(jì)量可以衡量差異選擇的區(qū)域或基因滲入障礙的區(qū)域。這里介紹常用的四個(gè)統(tǒng)計(jì)量的計(jì)算： pi, 衡量遺傳多樣性 Fst, 衡量群體分化程度 dxy, 對(duì)核苷酸多樣性絕...
IP屬地：青海
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pi, Fst, dxy, fd的計(jì)算
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karyoploteR：畫染色體的好幫手投稿在其他公眾號(hào)里了聂使，這份為作死測(cè)試用的，真的不是抄襲辐脖，每庆，拗慨， karyoploteR official website(github) bioconductor github...
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染色體拆分VCF文件合并
本篇帖子的分享內(nèi)容主要也是和前面大基因組拆分相呼應(yīng)的，利用前面拆分的基因組文件锅很，對(duì)變異檢測(cè)結(jié)果文件中拆分的染色體部分進(jìn)行合并，并輸出最終結(jié)果凤跑。 腳本內(nèi)容如下： 往期內(nèi)容 大基...
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ggplot2之文本換行在做基因富集時(shí)爆安，有些通路特別長(zhǎng)，以至于使圖片的大小不好控制仔引，這種情況可以用stringr包的str_wrap來(lái)完成文本自動(dòng)換行扔仓。如使用clusterProfiler的barp...
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比較基因組學(xué)習(xí)
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持續(xù)更新生信學(xué)習(xí)筆記，記錄學(xué)習(xí)歷程义桂≌殷荩伙伴們有需求可以一起探討實(shí)現(xiàn)，共同進(jìn)步吖慷吊！
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Linux: 生成數(shù)字序列和字母序列
在shell中生成滿足要求的數(shù)字序列各和字母序列 1. 使用 { } 1.1 生成連續(xù)數(shù)字序列 1.2 生成字母序列 1.3 生成組合字母序列 1.4 { }中不支持對(duì)其他變...
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gffread軟件使用教程gffread 不僅可以實(shí)現(xiàn)GTF與GFF的互相轉(zhuǎn)換溉瓶，而且還可以對(duì)GFF文件進(jìn)行過(guò)濾處理急鳄。可以直接讀取GTF文件堰酿。 相關(guān)database：最好在ucsc上下載疾宏。或者cellr...
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公號(hào)：Python大數(shù)據(jù)分析岩馍，關(guān)注送10G資料
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機(jī)器學(xué)習(xí)入門 | 必知必會(huì)的基礎(chǔ)理論一碉咆、什么是機(jī)器學(xué)習(xí)、數(shù)據(jù)挖掘蛀恩？ 1疫铜、AI是什么？ AI（人工智能）是研究開(kāi)發(fā)用于模擬双谆、延伸和擴(kuò)展人的智能理論块攒、方法、技術(shù)及應(yīng)用系統(tǒng)的一門新的技術(shù)科學(xué)佃乘。人工智能是計(jì)算機(jī)科學(xué)的一...
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單細(xì)胞測(cè)序（sc-RNA seq）分析：Seurat4.0系列教程趣避、高級(jí)分析庞呕、文章復(fù)現(xiàn)
時(shí)代的洪流奔涌而至，單細(xì)胞技術(shù)也從舊時(shí)王謝堂前燕程帕，飛入尋常百姓家住练。雪崩的時(shí)候，沒(méi)有一片雪花是無(wú)辜的愁拭，你我也從素不相識(shí)讲逛，到被一起卷入單細(xì)胞天地。R語(yǔ)言和Seurat已以勢(shì)如破竹...
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Seurat4.0系列教程1：標(biāo)準(zhǔn)流程時(shí)代的洪流奔涌而至岭埠，單細(xì)胞技術(shù)也從舊時(shí)王謝堂前燕盏混，飛入尋常百姓家。雪崩的時(shí)候惜论，沒(méi)有一片雪花是無(wú)辜的许赃，你我也從素不相識(shí)，到被一起卷入單細(xì)胞天地馆类。R語(yǔ)言和Seurat已以勢(shì)如破竹...
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單細(xì)胞上游軟件cellranger從頭說(shuō)
對(duì)于我們的10x數(shù)據(jù)上游分析混聊，主要靠cellranger 拆分bcl 安裝bcl2fastq 這是它的官網(wǎng)：https://support.illumina.com/sequ...
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Python基礎(chǔ)-4 函數(shù)Python-4 函數(shù) 一、函數(shù)作用 代碼出現(xiàn)大量重復(fù)操作時(shí)乾巧，考慮將操作重構(gòu)為函數(shù)(Functions)句喜。 例如，我們想做一個(gè)記賬本沟于，記錄日期咳胃、地點(diǎn)和消費(fèi)內(nèi)容及金額。 不用函...
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chatGPT | 大伙都可以玩玩社裆，讓他寫個(gè)生信軟件~昨晚拙绊，Guanliang師弟發(fā)了一個(gè)鏈接給我「https://gpt.chatapi.art[https://gpt.chatapi.art]」一個(gè) chatGPT 的完全免...
