菜雞
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：浙江
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基于參考基因組的基因組組裝和注釋
將基因組組裝到染色體水平無(wú)非就是兩種方式： 獨(dú)立組裝（de novo）悬襟； 基于參考基因組的組裝（reference-guided）布蔗，即基于近緣或同一物種的基因組染色體同源性進(jìn)...
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西澳大學(xué)生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因組與群體基因組學(xué)的挖掘<br><br>簡(jiǎn)信不回答問(wèn)題纵揍，有問(wèn)題發(fā)至<br>lakeseafly50@gmail.com
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RagTag, 快速錨定config
RagTag, Reference-guided genome assembly correction and scaffolding. 是Ragoo的一個(gè)升級(jí)，可對(duì)cont...
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基于VCF文件做基因滲入分析(Dsuite)Dsuite軟件文章：Malinsky, M., Matschiner, M. and Svardal, H. (2021) Dsuite ‐ fast D‐statisti...
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學(xué)習(xí)筆記<br>研究方向: 植物群體遺傳學(xué)<br>
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snpEff注釋變異位點(diǎn)信息SnpEff是一種變體注釋和效果預(yù)測(cè)工具妒潭，它注釋和預(yù)測(cè)遺傳變異的影響（例如氨基酸變化）。 1. 軟件安裝 2. 運(yùn)行 2.1 構(gòu)建SnpEff數(shù)據(jù)庫(kù) SnpEff軟件的運(yùn)行鳄炉，...
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努力努力再努力~<br>個(gè)人博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Flishensuo.github.io%2F" target="_blank">https://lishensuo.github.io/</a>
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基因家族分析保姆級(jí)教程（分子進(jìn)化）-生信小白自學(xué)之路（一）一、基因家族基礎(chǔ)知識(shí)與研究思路介紹 1.基因家族簡(jiǎn)介 基因是染色體上一段可以發(fā)生轉(zhuǎn)錄的區(qū)域（內(nèi)含子外顯子啟動(dòng)子）。轉(zhuǎn)錄本才是基因的研究實(shí)體团驱，轉(zhuǎn)錄本transcript（別名 ...
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maker基因組注釋一（基礎(chǔ)篇）在基因組注釋上嚎花，MAKER算是一個(gè)很強(qiáng)大的分析流程寸痢。能夠識(shí)別重復(fù)序列，將EST和蛋白序列比對(duì)到基因組紊选，進(jìn)行從頭預(yù)測(cè)啼止，并在最后整合這三個(gè)結(jié)果保證結(jié)果的可靠性。此外兵罢，MAKER還...
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基因組組裝項(xiàng)目的十二步建議1. 建立項(xiàng)目團(tuán)體 多機(jī)構(gòu)合作献烦，數(shù)據(jù)和利益共享。 2. 收集目標(biāo)基因組信息 考慮的因素：基因組大小卖词、倍性巩那、雜合性、GC含量和重復(fù)此蜈。 數(shù)據(jù)庫(kù)查詢：fungi (http://w...
