菜雞
發(fā)簡信
IP屬地：浙江
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基于參考基因組的基因組組裝和注釋
將基因組組裝到染色體水平無非就是兩種方式： 獨立組裝（de novo）鞠柄； 基于參考基因組的組裝（reference-guided）骄瓣，即基于近緣或同一物種的基因組染色體同源性進(jìn)...
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西澳大學(xué)生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因組與群體基因組學(xué)的挖掘<br><br>簡信不回答問題，有問題發(fā)至<br>lakeseafly50@gmail.com
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RagTag, 快速錨定config
RagTag, Reference-guided genome assembly correction and scaffolding. 是Ragoo的一個升級按灶，可對cont...
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基于VCF文件做基因滲入分析(Dsuite)Dsuite軟件文章：Malinsky, M., Matschiner, M. and Svardal, H. (2021) Dsuite ‐ fast D‐statisti...
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學(xué)習(xí)筆記<br>研究方向: 植物群體遺傳學(xué)<br>
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snpEff注釋變異位點信息SnpEff是一種變體注釋和效果預(yù)測工具量蕊，它注釋和預(yù)測遺傳變異的影響（例如氨基酸變化）铺罢。 1. 軟件安裝 2. 運行 2.1 構(gòu)建SnpEff數(shù)據(jù)庫 SnpEff軟件的運行，...
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努力努力再努力~<br>個人博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Flishensuo.github.io%2F" target="_blank">https://lishensuo.github.io/</a>
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基因家族分析保姆級教程（分子進(jìn)化）-生信小白自學(xué)之路（一）一泉瞻、基因家族基礎(chǔ)知識與研究思路介紹 1.基因家族簡介 基因是染色體上一段可以發(fā)生轉(zhuǎn)錄的區(qū)域（內(nèi)含子外顯子啟動子）脉漏。轉(zhuǎn)錄本才是基因的研究實體，轉(zhuǎn)錄本transcript（別名 ...
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maker基因組注釋一（基礎(chǔ)篇）在基因組注釋上，MAKER算是一個很強(qiáng)大的分析流程鞭达。能夠識別重復(fù)序列司忱，將EST和蛋白序列比對到基因組，進(jìn)行從頭預(yù)測畴蹭，并在最后整合這三個結(jié)果保證結(jié)果的可靠性坦仍。此外，MAKER還...
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基因組組裝項目的十二步建議1. 建立項目團(tuán)體 多機(jī)構(gòu)合作叨襟，數(shù)據(jù)和利益共享繁扎。 2. 收集目標(biāo)基因組信息 考慮的因素：基因組大小、倍性糊闽、雜合性锻离、GC含量和重復(fù)。 數(shù)據(jù)庫查詢：fungi (http://w...
