『鵝廠號: 生信云筆記』分享生信分析及數(shù)據(jù)可視化相關的內(nèi)容粪躬，歡迎關注和交流！<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2F1156054203.github.io" target="_blank">https://1156054203.github.io</a>
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RNA-seq入門實戰(zhàn)（八）：GSVA——基因集變異分析本節(jié)概覽：1.GSVA簡單介紹2.基因集的下載讀取: 手動與msigdbr包下載3.GSVA的運行4.limma差異分析5.GSVA結(jié)果可視化：熱圖吗货、火山圖泳唠、發(fā)散條形圖/柱形...
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解決報錯ImportError: cannot import name 'GC' from 'Bio.SeqUtils'
簡單記錄.在安裝軟件的時候遇到ImportError，模塊找不到.在我的情況中是因為biopython的版本問題. 所以宙搬，降低biopython版本 然后就看起來正常工作了!!
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使用R web框架Shiny輕松構建生信交互式網(wǎng)站做生信需要懂 R web框架 Shiny嗎脚仔？答案：不懂R Shiny的生信科研工作者不是好生信科研者 說說這幾年我用web框架參與構建生信網(wǎng)站的項目（就是我搬的磚），1.某病...
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【單細胞測序數(shù)據(jù)分析-1】認識Seurat對象數(shù)據(jù)結(jié)構/數(shù)據(jù)格式及操作一文了解單細胞對象數(shù)據(jù)結(jié)構/數(shù)據(jù)格式舆绎，單細胞數(shù)據(jù)操作不迷茫玻侥。本文內(nèi)容包括 單細胞seurat對象數(shù)據(jù)結(jié)構， 內(nèi)容構成亿蒸，對象的調(diào)用、操作掌桩，常見函數(shù)的應用等边锁。 1. 單細胞seu...
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基于Seurat結(jié)果推斷單細胞群腫瘤純度之ESTIMATEInferring tumour purity and stromal and immune cell admixture from expression data.，NC,...
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單細胞數(shù)據(jù)處理小細節(jié)匯總1. Seurat對象查看當前的Assay 在進行了SCTransform操作后改衩，矩陣默認會變成SCT矩陣岖常，如果不加設置，后續(xù)的PCA等操作都是基于SCT矩陣葫督。修改Defau...
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Seurat的打分函數(shù)AddMouduleScore在讀張澤民老師發(fā)表的新冠文獻的時候看到計算免疫細胞的cytokine score或inflammatory score使用了Seurat包的AddMouduleScore函數(shù)...
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clustree報錯
報錯信息：Error in check.length(gparname) : 'gpar' element 'lwd' must not be length 0解決辦法：更新...
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感謝樓主的教程橄镜，安裝完成Ａ搿！安裝過程中遇到sh mysql.server start 報錯：my_print_defaults: Can't read dir of '/etc/my.cnf.d' 通過 mkdir /etc/my.cnf.d 解決蛉鹿。參考https://blog.csdn.net/u011250186/article/details/109196145
Linux在線安裝mysql5.7到指定目錄
目標： 1.自定義mysql安裝目錄2.自定義mysql數(shù)據(jù)目錄3.正確安裝并啟動mysql4.輸入密碼正確登錄 說明：本文mysql下載目錄 /usr/download本文...
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單/多個基因在組間同時展示的多種選擇：分組小提琴圖、分組/分面柱狀圖响逢、單基因蜂群點圖拼圖繪制這是ggplot2可視化專題的第二個實例操作 【ggplot2的基本思路見前文總論】：基于ggplot2的RNA-seq轉(zhuǎn)錄組可視化：總述和分文目錄 【ggplot2繪圖具體...
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小技巧2-melt()函數(shù)轉(zhuǎn)換(R)我們常見的數(shù)據(jù)一般長這樣： 作圖時常用的形式是這樣：（這個就是melt型數(shù)據(jù)） 圖片來源：[pandas]處理pcr數(shù)據(jù)的時候绒窑，melt真是好東西呀 - 路人乙小明的文章 -...
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需要花8元獲得解壓密碼
Python編程快速上手 讓繁瑣工作自動化PDF版帶源碼
如今，人們面臨的大多數(shù)任務都可以通過編寫計算機軟件來完成舔亭。Python是一種解釋型些膨、面向?qū)ο蟆討B(tài)數(shù)據(jù)類型的高級程序設計語言钦铺。通過Python編程订雾，我們能夠解決現(xiàn)實生活中的很...
