TaoYan 計(jì)算相關(guān)矩陣 R內(nèi)置函數(shù)cor()可以用來計(jì)算相關(guān)系數(shù)：cor(x, method = c("pearson", "kendall", "spearman"))...
感謝各位簡(jiǎn)友一直的關(guān)注酥泛。 請(qǐng)關(guān)注：感謝陪伴[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg4MjY2NTA2Nw==&mid=2247483891&...
首先導(dǎo)入輸入文件物種某水平的分類表 百分比轉(zhuǎn)化 方式一 方式二 在微生物組數(shù)據(jù)分析中惕澎，樣品分析之前我們經(jīng)常需要對(duì)微生物組的豐度進(jìn)行篩選, 過濾在任何樣本中百分比小于1%的物種...
一文看懂PCA主成分分析中介紹了PCA分析的原理和分析的意義(基本簡(jiǎn)介如下唧喉，更多見博客)捣卤，今天就用數(shù)據(jù)來實(shí)際操練一下忍抽。 在生信寶典公眾號(hào)后臺(tái)回復(fù)“PCA實(shí)戰(zhàn)”，獲取測(cè)試數(shù)據(jù)董朝。...
轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的最直接目的，就是設(shè)法尋找組間顯著表達(dá)變化的基因闲询，解釋基因表達(dá)水平的變化對(duì)生物功能的影響久免。例如浅辙，腫瘤患者與正常人群相比哪些編碼蛋白或非編碼RNA分子發(fā)生了失調(diào)扭弧，這些...
本文首發(fā)于“生信大碗”公眾號(hào)泽腮，轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處 開始做科研之后的你想必經(jīng)常聽到“測(cè)序”這個(gè)詞御蒲，以至于讓你產(chǎn)生一種“這玩意兒，我懂”的感覺诊赊，但真讓你去說測(cè)序是什么厚满、怎么做的時(shí)候，...
難道鲸郊，這不像孔雀開屏嗎丰榴？ 寫在前面 組學(xué)數(shù)據(jù)已經(jīng)泛濫，但是信息的挖掘仍任重道遠(yuǎn)秆撮。順手的工具四濒，可以節(jié)省使用者盡可能多的時(shí)間，或者將看起來很復(fù)雜职辨，很難以完成的事情盗蟆，變得非常簡(jiǎn)單。...
這個(gè)是有讀者在B站給我的留言問到的問題 熱圖每隔三行分開一小段 怎么實(shí)現(xiàn)？我最開始的想法是用ggplot2來做惭每，將數(shù)據(jù)拆分骨饿，每三行數(shù)據(jù)做一個(gè)圖亏栈，最后采取拼圖的方式來實(shí)現(xiàn)。 后...
兩個(gè)dataframe數(shù)據(jù)之間的連接關(guān)系 經(jīng)常會(huì)碰到需要把兩個(gè)數(shù)據(jù)進(jìn)行合并闷游，大的方向有按“列”和按"行"合并兩種方式，這里主要講下按“列”進(jìn)行合并贴汪，如下圖脐往，假設(shè)有a、b兩個(gè)數(shù)...
寫在前面：經(jīng)常做轉(zhuǎn)錄組分析，就是把差異基因搞個(gè)火山圖和Venn圖看各組差異基因的共有和特有情況阳懂∶酚龋看見有個(gè)比較好的選擇，能直觀比較各種處理帶來的影響岩调，如下： 來自Nature ...
