兩種整合方法詳解 NGS系列文章包括NGS基礎讶凉、轉(zhuǎn)錄組分析(Nature重磅綜述|關(guān)于RNA-seq你想知道的全在這)本鸣、ChIP-seq分析(ChIP-seq基本分析流程)坏匪、...
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你可能會問“ Why should I use R朗涩?" 1.從上面圖中柏肪,我們可以看到R是數(shù)據(jù)科學家招聘廣告中最受歡迎的五種語言之一顶滩; 2.免費 3.功能廣泛:R是一種非常通用...
醫(yī)學生零基礎學生信是先學Python還是先學R語言咱揍?[https://www.zhihu.com/question/432353982]如何學習R語言[https://www...
關(guān)于火山圖颖榜,繪制的教程有很多也有不少專門繪制火山圖的包,說到底火山圖無非就是散點圖的變形,本節(jié)來介紹如何通過ggpotl2繪制火山圖 安裝&加載R包 ctrl+shift+M...
對于非模式生物或者無參考基因組的項目掩完,經(jīng)常需要進行基因的功能注釋噪漾,而GO注釋是基因功能注釋的重要部分。有很多軟件能夠獲得GO注釋的信息且蓬,例如interproscan欣硼、eggn...
前面給大家簡單介紹過?什么是Gene Ontology(GO)[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.co...
一. GO/KEGG (一)富集分析 (二)GOChord恶阴、弦圖什么的 脫離clusterprofiler包诈胜,需要從以上富集結(jié)果整理輸入文件 (三)進階富集分析比較與可視化 ...
本文寫于觀看生信技能樹公眾號(vx: biotrainee)的七步走純R代碼通過數(shù)據(jù)挖掘復現(xiàn)一篇實驗文章(第1到6步)[https://mp.weixin.qq.com/s/...
參考學習資料:還是小潔老師的TCGA-3.R包TCGA-biolinks下載數(shù)據(jù)下載安裝包 這個包有點大,安裝需要點時間其實從知道這個包名桅咆,應該就知道怎么學習了括授,不用贅述 學...
1. 什么是TCGA?TCGA中有哪些數(shù)據(jù)岩饼? TCGA的全稱是The Cancer Genome Atlas, 這個項目始于2005年荚虚,它旨在使用基因測序和生物信息學編目與癌...
背景介紹 Bioconductor項目的主要優(yōu)勢之一在于使用通用數(shù)據(jù)基礎結(jié)構(gòu)垛玻,該數(shù)據(jù)基礎結(jié)構(gòu)可實現(xiàn)跨越R包的相互操作性。 用戶應該能夠使用來自不同Bioconductor軟件...
本文參考Satija Lab的seurat 包奶躯,網(wǎng)址https://satijalab.org/seurat 設置Seurat對象 在本教程中帚桩,我們將分析10X Genomi...