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關(guān)于火山圖掀淘,繪制的教程有很多也有不少專門繪制火山圖的包,說到底火山圖無非就是散點圖的變形油昂,本節(jié)來介紹如何通過ggpotl2繪制火山圖 安裝&加載R包 ctrl+shift+M...
對于非模式生物或者無參考基因組的項目革娄,經(jīng)常需要進(jìn)行基因的功能注釋倾贰,而GO注釋是基因功能注釋的重要部分。有很多軟件能夠獲得GO注釋的信息拦惋,例如interproscan匆浙、eggn...
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一. GO/KEGG (一)富集分析 (二)GOChord厕妖、弦圖什么的 脫離clusterprofiler包首尼,需要從以上富集結(jié)果整理輸入文件 (三)進(jìn)階富集分析比較與可視化 ...
本文寫于觀看生信技能樹公眾號(vx: biotrainee)的七步走純R代碼通過數(shù)據(jù)挖掘復(fù)現(xiàn)一篇實驗文章(第1到6步)[https://mp.weixin.qq.com/s/...
參考學(xué)習(xí)資料:還是小潔老師的TCGA-3.R包TCGA-biolinks下載數(shù)據(jù)下載安裝包 這個包有點大,安裝需要點時間其實從知道這個包名举畸,應(yīng)該就知道怎么學(xué)習(xí)了查排,不用贅述 學(xué)...
1. 什么是TCGA?TCGA中有哪些數(shù)據(jù)抄沮? TCGA的全稱是The Cancer Genome Atlas, 這個項目始于2005年跋核,它旨在使用基因測序和生物信息學(xué)編目與癌...
背景介紹 Bioconductor項目的主要優(yōu)勢之一在于使用通用數(shù)據(jù)基礎(chǔ)結(jié)構(gòu)搅吁,該數(shù)據(jù)基礎(chǔ)結(jié)構(gòu)可實現(xiàn)跨越R包的相互操作性威创。 用戶應(yīng)該能夠使用來自不同Bioconductor軟件...
本文參考Satija Lab的seurat 包,網(wǎng)址https://satijalab.org/seurat 設(shè)置Seurat對象 在本教程中谎懦,我們將分析10X Genomi...