2021年,Leader等人通過(guò)目前最大的非小細(xì)胞肺癌的單細(xì)胞測(cè)序和CITE-seq,對(duì)非小細(xì)胞肺癌的微環(huán)境進(jìn)行了多組學(xué)的分析井濒,最終構(gòu)建了一個(gè)包括驅(qū)動(dòng)突變、新生抗原列林、免疫狀態(tài)等多個(gè)元素的腫瘤微環(huán)境模式瑞你,可以對(duì)腫瘤免疫療法的應(yīng)答反應(yīng)進(jìn)行預(yù)判,本文發(fā)表在Cancer Cell上希痴。
本文亮點(diǎn):
- 單細(xì)胞測(cè)序揭示了LCAM免疫細(xì)胞激活模式者甲;
- CITE測(cè)序?qū)D(zhuǎn)錄組分型進(jìn)行進(jìn)一步驗(yàn)證;
- 腫瘤免疫激活模式與腫瘤突變負(fù)荷砌创,驅(qū)動(dòng)突變虏缸,異位抗原相關(guān);
- LCAM預(yù)示著對(duì)免疫檢查點(diǎn)抑制劑較為敏感嫩实;
多組學(xué)整合分析驗(yàn)證腫瘤間異質(zhì)性
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樣本間的歐式距離比較刽辙,提示腫瘤間的異質(zhì)性要遠(yuǎn)高于正常的肺組織間;
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DC3是腫瘤微環(huán)境中最主要的樹(shù)突狀細(xì)胞亞群甲献,cDC1的數(shù)量在腫瘤內(nèi)部會(huì)顯著地減少宰缤;由于mregDC對(duì)于調(diào)節(jié)T細(xì)胞的應(yīng)答功能具有重要的功能,作者采用了多色免疫熒光