發(fā)簡信
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GEO數(shù)據(jù)庫簡介（2018-06-03）[轉(zhuǎn)] GEO數(shù)據(jù)庫--檢索界面及檢索結(jié)果簡介 原文：http://baijiahao.baidu.com/s?id=1575064181962032&wfr=spider&...
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DNA甲基化測序數(shù)據(jù)處理（一）：數(shù)據(jù)比對前言 因為組里面出了一批甲基化測序數(shù)據(jù)，使用的技術(shù)為BS-seq垂寥，處理的時候順帶記錄了學(xué)習(xí)過程，演示使用數(shù)據(jù)為官方提供的example.fastq另锋。 DNA甲基化及CpG島定...
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中科院上海生科院碩博連讀生夭坪。<br>
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老板親自傳授的文獻閱讀方法前言 論一個氣場合適的導(dǎo)師的重要性文判。想起一個微信朋友前截圖 A：導(dǎo)師牛不牛，師兄師姐牛不牛室梅，跟你牛不牛沒有關(guān)系 B：你錯啦戏仓，導(dǎo)師牛不牛疚宇，師兄師姐牛不牛，很大程度上決定我牛不牛...
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如何快速查找物種間對應(yīng)的同源基因有時候赏殃，大家做實驗以小鼠為模型敷待，但希望查看與之對應(yīng)的人同源基因。像這種情況仁热，我們可以不需要進行序列比對來查找榜揖，因為比較麻煩。使用公共數(shù)據(jù)可能更高效抗蠢。 1.基于NCBI Hom...
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Fst的計算原理與實戰(zhàn)
概念回顧 Fst：群體間遺傳分化指數(shù)举哟，是種群分化和遺傳距離的一種衡量方法，分化指數(shù)越大迅矛，差異越大妨猩。適用于亞群體間多樣性的比較。 用于衡量種群分化程度秽褒，取值從0到1册赛，為0則認(rèn)為...
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生物信息常用工具和網(wǎng)站最近接二連三帶了不少實習(xí)生和輪轉(zhuǎn)生，可以預(yù)見后面幾年實驗室再有實習(xí)或者輪轉(zhuǎn)的十有八九應(yīng)該都是我?guī)д鸺怠＿@一篇列舉一些生物信息部分常用工具和幾個神奇網(wǎng)站森瘪。基本上每個工具都給出一兩句...
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生信基因功能分析工具：Orthofinder使用教程
最近Orthofinder2開始陸續(xù)更新票堵，文章已經(jīng)投發(fā)到biorkix上扼睬，在網(wǎng)上搜了一圈，關(guān)于Orthofinder的使用的中文教程幾乎是空白的悴势，這周就借此機會和大家一起來學(xué)...
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「基因組學(xué)」使用OrthoFinder進行直系同源基因分析談?wù)摰街毕低椿蚍治龅臅r候窗宇，大部分教程都是介紹OrthoMCL，這是2003年發(fā)表的一個工具特纤，目前的引用次數(shù)已經(jīng)達到了3000多军俊，但這個軟件似乎在2013年之后就不在更新，...
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基因家族分析 | 預(yù)測基因家族收縮與擴張（orthofinder捧存，cafe）
以下參照 hoptop的「基因組學(xué)」使用OrthoFinder進行直系同源基因分析這篇帖子試跑了一遍 1.軟件安裝 2.數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 下載「基因組學(xué)」使用OrthoFinder進...
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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「基因組學(xué)」使用CAFE進行基因家族擴張收縮分析環(huán)境準(zhǔn)備 安裝軟件: 參考「基因組學(xué)」使用OrthoFinder進行直系同源基因分析 安裝OrthoFinder昔穴，然后再安裝CAFE 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備: 一共會分析mouse, r...
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生信基礎(chǔ)知識復(fù)習(xí)之測序劉小澤寫于18.11.25每學(xué)習(xí)一遍之前的知識镰官，總能從不同角度獲取一些觀點，然后擴增自己的知識庫吗货，這就是“知識迭代”這次我也就是想到哪寫到哪泳唠，把自己認(rèn)為重要的內(nèi)容梳理下，用Q...
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全基因組重測序基礎(chǔ)及高級分析知識匯總
轉(zhuǎn)自：http://www.360doc.com/content/18/0208/11/19913717_728563847.shtml 全基因組重測序是通過對已有參考序列（...
