一渊季、 重要參數(shù)璧疗，屬性與接口（RandomForestRegressor）回歸 所有的參數(shù)，屬性與接口脯颜，全部和隨機森林分類器一致。僅有的不同就是回歸樹與分類樹的不同避乏，不純度的指...
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隨機森林02 -
隨機森林如何處理缺失值
序 RF中有相應(yīng)的缺失值處理方法探橱，本次記錄其兩種缺失值處理技巧 暴力填補 Python中的na.roughfix包提供簡單的缺失值填補策略：對于訓(xùn)練集中處于同一個類別下的數(shù)據(jù)...
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有相關(guān)性就有因果關(guān)系嗎，教你玩轉(zhuǎn)孟德爾隨機化分析（mendelian randomization ）
流行病學(xué)研究常見的分析就是相關(guān)性分析了蛮放。 相關(guān)性分析某種程度上可以為我們提供一些研究思路缩抡，比如缺乏元素A與某種癌癥相關(guān)，那么我們可以通過補充元素A來減少患癌率包颁。這個結(jié)論的大前...
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單細胞測序數(shù)據(jù)整合練習(xí)（詳細代碼）最近在學(xué)習(xí)芬蘭CSC-IT科學(xué)中心主講的生物信息課程(https://www.csc.fi/web/training/-/scrnaseq)視頻瞻想，官網(wǎng)上還提供了練習(xí)素材以及詳...
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GATK4全基因組數(shù)據(jù)分析最佳實踐,我以這篇文章為標志,終結(jié)當前WGS系列數(shù)據(jù)分析的流程主體問題 | 完全代碼這是我根據(jù)之前的WGS系列和GATK4實踐文章進行重新梳理之后確定下來的分析流程压真，這是一個WGS的最佳實踐，它基于GATK4和我的實際經(jīng)驗蘑险，稍作修改即可應(yīng)用到實際的項目中滴肿。我...
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這篇3+分教你篩選拿出來幾個基因應(yīng)該如何分析今天和大家分享的是2020年發(fā)表在CancerCell Int（IF：3.439)上的一篇文章，“Constructionof a novel gene-based mode...
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篩個差異基因為什么就7分了佃迄？
今天跟大家分享的是2019年3月發(fā)表在J.Crohns.Colitis （IF：7.827）雜志上的一篇文章High-Throughput Identification of...
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用于進行Meta分析以合成相關(guān)數(shù)據(jù)的非技術(shù)性入門上期我們談到了系統(tǒng)綜述和Meta分析的常用軟件工具普碎，今天我們就來重點解析一下Meta分析的方法步驟吼肥。 Meta分析是對具備特定條件的、同課題的諸多研究結(jié)果進行綜合的一類統(tǒng)計方...
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meta分析的分類簡介（學(xué)習(xí)記錄）
今天學(xué)習(xí)了meta分析的分類麻车，做了一些筆記缀皱，記錄于此。 meta分析是什么绪氛？ 證據(jù)是循證醫(yī)學(xué) (Evidence-based Medcine唆鸡，EBM) 的核心，基于隨機對照試...
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Anaconda多環(huán)境多版本python配置指導(dǎo)
Anaconda是一個優(yōu)秀的開源Python發(fā)布版本臂痕，由于中文社區(qū)對這個軟件的介紹及教程比較少，還是官方文檔比較詳細猿涨，在此翻譯如下握童。 原文地址：http://conda.py...
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GWAS基本分析內(nèi)容之前給大家大致介紹了GWAS在臨床生信分析中的概況，包括一些基本概念叛赚，原理和注意事項（出門左手邊—>臨床生物信息學(xué)中的GWAS分析）澡绩，這次具體講講GWAS基本分析內(nèi)容及結(jié)果解...
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跑通GWAS，用這些腳本就夠了最近跑通了一遍GWAS分析俺附，全程在linux操作肥卡，雖然具體還有好多需要微調(diào)的地方，先把代碼整理分享出來mark一下 前期準備 1.理論知識 強烈推薦百邁客云課堂課程GWAS生...
