一、 重要參數(shù)，屬性與接口（RandomForestRegressor）回歸 所有的參數(shù)蜘拉，屬性與接口瘟判，全部和隨機(jī)森林分類(lèi)器一致承璃。僅有的不同就是回歸樹(shù)與分類(lèi)樹(shù)的不同粤攒，不純度的指...
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隨機(jī)森林02 -
隨機(jī)森林如何處理缺失值
序 RF中有相應(yīng)的缺失值處理方法笔刹，本次記錄其兩種缺失值處理技巧 暴力填補(bǔ) Python中的na.roughfix包提供簡(jiǎn)單的缺失值填補(bǔ)策略：對(duì)于訓(xùn)練集中處于同一個(gè)類(lèi)別下的數(shù)據(jù)...
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有相關(guān)性就有因果關(guān)系嗎互妓，教你玩轉(zhuǎn)孟德?tīng)栯S機(jī)化分析（mendelian randomization ）
流行病學(xué)研究常見(jiàn)的分析就是相關(guān)性分析了溪窒。 相關(guān)性分析某種程度上可以為我們提供一些研究思路，比如缺乏元素A與某種癌癥相關(guān)冯勉，那么我們可以通過(guò)補(bǔ)充元素A來(lái)減少患癌率澈蚌。這個(gè)結(jié)論的大前...
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單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)整合練習(xí)（詳細(xì)代碼）最近在學(xué)習(xí)芬蘭CSC-IT科學(xué)中心主講的生物信息課程(https://www.csc.fi/web/training/-/scrnaseq)視頻，官網(wǎng)上還提供了練習(xí)素材以及詳...
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GATK4全基因組數(shù)據(jù)分析最佳實(shí)踐,我以這篇文章為標(biāo)志,終結(jié)當(dāng)前WGS系列數(shù)據(jù)分析的流程主體問(wèn)題 | 完全代碼這是我根據(jù)之前的WGS系列和GATK4實(shí)踐文章進(jìn)行重新梳理之后確定下來(lái)的分析流程灼狰，這是一個(gè)WGS的最佳實(shí)踐宛瞄，它基于GATK4和我的實(shí)際經(jīng)驗(yàn)，稍作修改即可應(yīng)用到實(shí)際的項(xiàng)目中交胚。我...
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這篇3+分教你篩選拿出來(lái)幾個(gè)基因應(yīng)該如何分析今天和大家分享的是2020年發(fā)表在CancerCell Int（IF：3.439)上的一篇文章份汗，“Constructionof a novel gene-based mode...
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篩個(gè)差異基因?yàn)槭裁淳?分了盈电？
今天跟大家分享的是2019年3月發(fā)表在J.Crohns.Colitis （IF：7.827）雜志上的一篇文章High-Throughput Identification of...
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> 所有文章和譯文僅用于個(gè)人學(xué)習(xí)匆帚，不涉及商業(yè)利益<br>> 歡迎指出文章中的錯(cuò)誤<br><br>▼GitHub和微信▼<br>討論、學(xué)習(xí)轩猩、共同進(jìn)步
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用于進(jìn)行Meta分析以合成相關(guān)數(shù)據(jù)的非技術(shù)性入門(mén)上期我們談到了系統(tǒng)綜述和Meta分析的常用軟件工具卷扮，今天我們就來(lái)重點(diǎn)解析一下Meta分析的方法步驟。 Meta分析是對(duì)具備特定條件的均践、同課題的諸多研究結(jié)果進(jìn)行綜合的一類(lèi)統(tǒng)計(jì)方...
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meta分析的分類(lèi)簡(jiǎn)介（學(xué)習(xí)記錄）
今天學(xué)習(xí)了meta分析的分類(lèi)晤锹，做了一些筆記，記錄于此彤委。 meta分析是什么鞭铆？ 證據(jù)是循證醫(yī)學(xué) (Evidence-based Medcine，EBM) 的核心焦影，基于隨機(jī)對(duì)照試...
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Anaconda多環(huán)境多版本python配置指導(dǎo)
Anaconda是一個(gè)優(yōu)秀的開(kāi)源Python發(fā)布版本，由于中文社區(qū)對(duì)這個(gè)軟件的介紹及教程比較少彬呻，還是官方文檔比較詳細(xì)衣陶，在此翻譯如下。 原文地址：http://conda.py...
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GWAS基本分析內(nèi)容之前給大家大致介紹了GWAS在臨床生信分析中的概況闸氮，包括一些基本概念剪况，原理和注意事項(xiàng)（出門(mén)左手邊—>臨床生物信息學(xué)中的GWAS分析），這次具體講講GWAS基本分析內(nèi)容及結(jié)果解...
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跑通GWAS蒲跨，用這些腳本就夠了最近跑通了一遍GWAS分析译断，全程在linux操作，雖然具體還有好多需要微調(diào)的地方或悲，先把代碼整理分享出來(lái)mark一下 前期準(zhǔn)備 1.理論知識(shí) 強(qiáng)烈推薦百邁客云課堂課程GWAS生...
