發(fā)簡信
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Prism和SPSS的顯著性分析使用prism計算顯著性诚亚，并繪制柱形圖： 示例：有4組數(shù)據(jù)淹魄，每組都有4個樣本种呐，這種單變量的多組數(shù)據(jù)之間的比較適用One way ANOVA檢驗设塔。...
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有參轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn)11-上傳轉(zhuǎn)錄組到NCBI登錄NCBI>點(diǎn)擊submit>選SRA>選Project>點(diǎn)New submission 1 SUBMITTER 填寫名字郎逃，郵件断楷，no gro...
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有參轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn)10-差異基因KEGG富集分析##########下面做KEGG########emapper <- read.delim("out.emapper.annotations"...
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有參轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn)9-差異基因GO富集分析#這里需要對非模式物種制作ORG.DB包响委，如果是模式物種铃辖，“https://bioconductor.org/packages/release/...
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有參轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn)8-基因功能注釋_GO_KEGG_swissprot_pfam_TFDB_iTAK#進(jìn)行功能注釋時剩愧，我們只用到蛋白文件，就是上一期提取序列的文件“Ptri.protein.fa”娇斩。 #使用命令“grep -c ">" Ptri...
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有參轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn)7-基因序列提取#本教程仿自于“https://zhuanlan.zhihu.com/p/439168788”仁卷。#正則表達(dá)式教程https://www.runo...
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有參轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn)6-差異基因繪制火山圖#本教程仿自于B站的15天入門生物信息視頻，若有疑惑請以視頻為準(zhǔn)犬第。若侵請聯(lián)锦积。 #上一個教程我們得到了genes.counts.matrix.OE...
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有參轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn)5-差異基因分析#本教程仿自于B站的15天入門生物信息視頻，若有疑惑請以視頻為準(zhǔn)歉嗓。若侵請聯(lián)系刪除丰介。 #新開個文件夾，DE，把gene.count.matrix文...
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有參轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn)4-可變剪接分析#以下教程主要參考 http://www.reibang.com/p/804ec7cf7cc2http://www.reibang.com/...