使用prism計(jì)算顯著性，并繪制柱形圖： 示例：有4組數(shù)據(jù)厨幻，每組都有4個(gè)樣本鹅经，這種單變量的多組數(shù)據(jù)之間的比較適用One way ANOVA檢驗(yàn)婚肆。若是雙變量的多組數(shù)據(jù)則適用于T...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：臺(tái)灣
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Prism和SPSS的顯著性分析 -
有參轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn)11-上傳轉(zhuǎn)錄組到NCBI登錄NCBI>點(diǎn)擊submit>選SRA>選Project>點(diǎn)New submission 1 SUBMITTER 填寫名字伶丐，郵件麸粮，no group慧脱，學(xué)校學(xué)院，街道郵編國(guó)家仅炊，...
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有參轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn)10-差異基因KEGG富集分析##########下面做KEGG########emapper <- read.delim("out.emapper.annotations")emapper[emappe...
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有參轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn)9-差異基因GO富集分析#這里需要對(duì)非模式物種制作ORG.DB包，如果是模式物種澎蛛，“https://bioconductor.org/packages/release/BiocViews.html#...
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有參轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn)8-基因功能注釋_GO_KEGG_swissprot_pfam_TFDB_iTAK#進(jìn)行功能注釋時(shí)抚垄，我們只用到蛋白文件，就是上一期提取序列的文件“Ptri.protein.fa”。 #使用命令“grep -c ">" Ptri.protein.fa”統(tǒng)計(jì)下...
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有參轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn)7-基因序列提取#本教程仿自于“https://zhuanlan.zhihu.com/p/439168788”呆馁。#正則表達(dá)式教程https://www.runoob.com/regexp/r...
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有參轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn)6-差異基因繪制火山圖#本教程仿自于B站的15天入門生物信息視頻桐经，若有疑惑請(qǐng)以視頻為準(zhǔn)。若侵請(qǐng)聯(lián)浙滤。 #上一個(gè)教程我們得到了genes.counts.matrix.OE_vs_WT.DESeq2.D...
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有參轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn)5-差異基因分析#本教程仿自于B站的15天入門生物信息視頻阴挣，若有疑惑請(qǐng)以視頻為準(zhǔn)。若侵請(qǐng)聯(lián)系刪除纺腊。 #新開個(gè)文件夾畔咧，DE，把gene.count.matrix文件丟進(jìn)里面揖膜，編寫分組文件gro...
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有參轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn)4-可變剪接分析#以下教程主要參考 http://www.reibang.com/p/804ec7cf7cc2http://www.reibang.com/p/b5413ccffe2bh...
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有參轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn)3-計(jì)算readcount和TPM表達(dá)量#本教程部分文件誓沸，來源B站15天入門生物信息教程 “https://www.bilibili.com/video/BV1K44y1B7Dg/?spm_id_from=333....
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有參轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn)2-將批量轉(zhuǎn)錄組比對(duì)到基因組上#1，我們先下載毛果楊的基因組文件和GFF注釋文件壹粟，自己去NCBI下：（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/datasets/genome/GCF_00...
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有參轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn)1-批量質(zhì)控-fastp#本教程部分參考B站15天入門生物信息教程拜隧，在開啟以下教程前，請(qǐng)務(wù)必看看我前面兩個(gè)教程趁仙，Linux系統(tǒng)上安裝R語(yǔ)言（https://www.bilibili.com/read...
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或者使用for循環(huán)：
for i in {1..6};
do ascp -vQT -l 500m -P33001 -k 1 -i ~/miniconda3/etc/asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fastp.srsa.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR229/05${i}/SRR2295465${i}/SRR2295465${i}_1.fastq.gz;
done;Linux系統(tǒng)上安裝aspera并用其批量高速下載轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)
#使用aspera能夠幫助我們批量高速下載轉(zhuǎn)錄組等數(shù)據(jù)洪添，現(xiàn)在使用conda進(jìn)行安裝 conda install -c hcc aspera-cli -y #檢查是否安裝成功，...
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沒有查出序列坐儿，就是沒有結(jié)果
基因家族的鑒定-基于Windows系統(tǒng)上的HMMER
基因組的序列提取律胀，詳情請(qǐng)看我之前的教程：http://www.reibang.com/p/211a262aebc4 基因家族的鑒定-基于windows系統(tǒng)上的本地blast...
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Linux系統(tǒng)中批量替換文件名#1，現(xiàn)在我有一批文件貌矿，原名要被替換成新的名字炭菌，我們做一個(gè)names.txt文件，前面一列是oldname逛漫，后一列是newname黑低，用制表符（\t）分隔，最后空出一行即可： ...
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Linux系統(tǒng)上安裝aspera并用其批量高速下載轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)#使用aspera能夠幫助我們批量高速下載轉(zhuǎn)錄組等數(shù)據(jù)酌毡，現(xiàn)在使用conda進(jìn)行安裝 conda install -c hcc aspera-cli -y #檢查是否安裝成功克握，...
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在linux系統(tǒng)上安裝R語(yǔ)言#我們?cè)趌inux系統(tǒng)里面安裝R，能夠分析許多大數(shù)據(jù)枷踏。前提是安裝好conda菩暗，可以看教程“https://blog.csdn.net/liangjinghui123/arti...
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使用Primer Premier 5軟件設(shè)計(jì)引物文章首發(fā)于CSDN，B站等旭蠕，小hong書也有停团，簡(jiǎn)書能不能別再瘋狂賣廣告呀？跆埂！佑稠！ 1秒梅，首先需要得到待克隆的基因的CDS序列，上游UTR約250bp舌胶，下游UTR約250bp捆蜀。將上...
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ImageJ軟件測(cè)量葉片或其它樣品面積原文首發(fā)于CSDN和B站，簡(jiǎn)書幔嫂，小hong書也有辆它。 1，我們需要測(cè)量葉片或其它樣品的面積時(shí)候婉烟，需要用到imageJ軟件娩井，拍照的時(shí)候記得加個(gè)標(biāo)尺。我們用軟件打開圖片似袁，F(xiàn)ile>...