發(fā)簡信
IP屬地：北京
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The pipleline of single cell RNA seq
1 Alignment (fastq->bam) (1) 10X Genomics fastq data If we get fastq da...
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Inhibitory CD161 receptor identified in gliomainfiltrating T cells by single-cell analysis文章信息 文章題目： 利用單細(xì)胞分析在腦膠質(zhì)瘤的T細(xì)胞中鑒定出抑制性CD161受體期刊： cell日期： 2021.3末位通訊作者： Ka...
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Interrogation of the Microenviromental Landscape in Brain Tumors Reveals Disease-Specific Alteration今天給大家介紹一篇在2020年六月發(fā)表于cell上的一篇關(guān)于腦膠質(zhì)瘤的文章，Interrogation of the Microenvirome...
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跑流程遇到的問題以及解決過程:
最近在跑新抗原的流程灸撰，遇到了一些問題記錄下來： 1炫七，前期跑GATK4咧栗，詳細(xì)教程可見GATK4+mutect2 call somatic muta...
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Clonal Relatedness and Mutational Differences between Upper Tract and Bladder Urothelial Carcinoma今天沒大家介紹一篇文章霞怀，這篇文章發(fā)表在clinical cancer research 上吉殃。 下圖中我們可以看到這個雜志這幾年來的影響因子的波動...
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Upper tract urothelial carcinoma has a luminal-papillary T-cell depleted contexture and activated...今天給大家介紹一篇基因組和轉(zhuǎn)錄組的文章酱鸭。首先看下劫樟，這篇文章的corrsponding author ： 他來自威爾康奈爾醫(yī)學(xué)院：美國常青藤大學(xué)康...
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GATK4+mutect2 call somatic mutation
最近看了GATK的網(wǎng)站痪枫，以前經(jīng)常用GATK call somatic mutation， 但是用的版本太老了叠艳，另外服務(wù)器最近換了盤奶陈，很多代碼路徑...
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Single-cell transcriptomic analysis defines the interplay between tumor cells, viral infection, a...鼻咽癌是EBV有關(guān)的惡性腫瘤具有復(fù)雜的腫瘤生態(tài)系統(tǒng)。 腫瘤細(xì)胞虑绵，EBV之間如何相互作用尿瞭，以及腫瘤微環(huán)境如何促進(jìn)NPC的形成以及免疫的侵襲依然不...
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Mucosal Profiling of Pediatric-Onset Colitis and IBD Reveals Common Pathogenics and Therapeutic P...今天給大家分享一篇2019年11月發(fā)表在cell上的一篇文章， 這篇文章通過對未分化的結(jié)腸炎翅睛，Crohn’s 疾病声搁，潰瘍性結(jié)腸炎的兒童做單細(xì)胞和...