1 Alignment (fastq->bam) (1) 10X Genomics fastq data If we get fastq data from 10X Gen...
發(fā)簡信
IP屬地：北京
-
The pipleline of single cell RNA seq
-
Inhibitory CD161 receptor identified in gliomainfiltrating T cells by single-cell analysis文章信息 文章題目： 利用單細(xì)胞分析在腦膠質(zhì)瘤的T細(xì)胞中鑒定出抑制性CD161受體期刊： cell日期： 2021.3末位通訊作者： Kai W. Wucherpfen...
-
Interrogation of the Microenviromental Landscape in Brain Tumors Reveals Disease-Specific Alteration今天給大家介紹一篇在2020年六月發(fā)表于cell上的一篇關(guān)于腦膠質(zhì)瘤的文章谍夭，Interrogation of the Microenviromental Landscape ...
-
maftools畫棒棒糖圖 （Lollipop chart）-基因突變可視化maftools是一個(gè)很強(qiáng)大的R語言可視化包，上篇“maftools畫瀑布圖（oncoplot）”(http://www.reibang.com/p/6cccf7c4bb0...
-
跑流程遇到的問題以及解決過程:
最近在跑新抗原的流程湃累，遇到了一些問題記錄下來： 1与柑，前期跑GATK4亲轨，詳細(xì)教程可見GATK4+mutect2 call somatic mutation - 簡書 (jian...
-
Clonal Relatedness and Mutational Differences between Upper Tract and Bladder Urothelial Carcinoma今天沒大家介紹一篇文章醇坝，這篇文章發(fā)表在clinical cancer research 上扰柠。 下圖中我們可以看到這個(gè)雜志這幾年來的影響因子的波動(dòng)變化牡整。 首先我們看下這篇文章的...
-
Upper tract urothelial carcinoma has a luminal-papillary T-cell depleted contexture and activated...今天給大家介紹一篇基因組和轉(zhuǎn)錄組的文章藐吮。首先看下，這篇文章的corrsponding author ： 他來自威爾康奈爾醫(yī)學(xué)院：美國常青藤大學(xué)康奈爾大學(xué)旗下的威爾康奈爾醫(yī)學(xué)院...
-
GATK4+mutect2 call somatic mutation
最近看了GATK的網(wǎng)站逃贝，以前經(jīng)常用GATK call somatic mutation谣辞， 但是用的版本太老了，另外服務(wù)器最近換了盤沐扳，很多代碼路徑都變了泥从，網(wǎng)上關(guān)于GATK4的教...
-
Single-cell transcriptomic analysis defines the interplay between tumor cells, viral infection, a...鼻咽癌是EBV有關(guān)的惡性腫瘤具有復(fù)雜的腫瘤生態(tài)系統(tǒng)。 腫瘤細(xì)胞沪摄，EBV之間如何相互作用躯嫉，以及腫瘤微環(huán)境如何促進(jìn)NPC的形成以及免疫的侵襲依然不是很清楚的。 在這里杨拐，我們對來...
-
切瓜少年于2020年在南昌大學(xué)獲得了臨床醫(yī)學(xué)戏阅、計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)雙學(xué)士學(xué)位昼弟，并于同年至山東大學(xué)攻讀內(nèi)科學(xué)（消化系病）博士學(xué)位奕筐。他的主要研究興趣包括腸道先天性免疫舱痘、炎癥性腸病的發(fā)病機(jī)制、抗菌肽設(shè)計(jì)离赫，以及電動(dòng)自行車的維修與保養(yǎng)藝術(shù)芭逝。
-
Mucosal Profiling of Pediatric-Onset Colitis and IBD Reveals Common Pathogenics and Therapeutic P...今天給大家分享一篇2019年11月發(fā)表在cell上的一篇文章， 這篇文章通過對未分化的結(jié)腸炎渊胸，Crohn’s 疾病旬盯，潰瘍性結(jié)腸炎的兒童做單細(xì)胞和風(fēng)險(xiǎn)分析找到了普遍的發(fā)病機(jī)制，...
-
R語言中dplyr包join函數(shù)之目前我看到過的最形象的教程所涉及的函數(shù) Mutating Joins: inner_join(), left_join(), right_join(), full_join() Filtering J...
-
