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發(fā)簡信
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RNAseq分析如何選擇 參考基因組 和 gtf
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坑隊友系列：ftp協(xié)議下載ensembl參考基因組你問我為啥標題這么長，據(jù)說是關鍵詞給的多厕怜，容易被搜到叠国。寫得不好未檩，不用海涵，直接提出粟焊，謝謝您吶~ 1. 前言： 沒錯冤狡，作為一個自以為入門了的人其實還在門外孙蒙。根據(jù)達克效應圖解，充...
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轉錄組數(shù)據(jù)分析前準備——參考基因組準備進行轉錄組分析前，需準備好參考基因組文件合瓢。醫(yī)學研究中應用最多的就是人類坦胶、大鼠、小鼠晴楔。本文以這三種為主進行介紹顿苇。 參考基因組的下載可以進入ensembl數(shù)據(jù)庫進行 點擊畫紅框位...
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實戰(zhàn)之 mutect2檢測somatic變異流程1 用途 mutect2是GATK（The Genome Analysis Toolkit，是BroadInstitute開發(fā)的用于二代重測序數(shù)據(jù)分析的一款軟件税弃，里面包含了很...
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GATK4流程學習之背景知識與前期準備GATK4流程學習之背景知識與前期準備 - 簡書[http://www.reibang.com/p/97e803755fa6]GATK4流程學習之DNA-Seq varia...
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全外顯子測序(wes)數(shù)據(jù)分析詳細流程(小樣本)
如果想看大樣本的數(shù)據(jù)處理分析流程請移步總目錄:三陰性乳腺癌全外顯子分析(wes)(大樣本727個) 分析流程目錄如下： 1 wes相關軟件下載與安裝并添加環(huán)境變量2 下載GA...
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單細胞實戰(zhàn)(2)：cellranger使用
將SRA轉為fastq 數(shù)據(jù)下載好之后则果，我們得到的是SRR文件幔翰，需要將其轉換為fastq格式才能使用 結束之后每個SRR文件會變成解壓出三個文件 為什么會有三個文件，這個需要...
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《水凝膠》微信公眾號關注生物醫(yī)學功能材料交叉學科前沿進展，分享學習最新SCI文獻及科研信息茸时。
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個性化生信分析
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2019.8月中旬開始系統(tǒng)自學生信答姥，<br>自學路漫漫索性報個班铣除。<br><br>生信技能樹真的很棒！<br><br>這是我的一個學習筆記平臺鹦付，點滴記錄尚粘。
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主要分享一些自己的學習過程郎嫁，以菜鳥干貨為主秉继，大家有問題可以在我的博客交流(打賞也是)<br><br>
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<br>自學生信的小白尚辑，<br>生物屆的一只單身狗!<br><br>從爬蟲過來的蛇友！
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周運來澈蝙，男，長大了才會遇到的帥哥撵幽，穩(wěn)健，瀟灑礁击，大方盐杂，靠譜。一段生信緣哆窿，一棵技能樹链烈。生信技能樹核心成員，單細胞天地供稿人挚躯，簡書創(chuàng)作者强衡，單細胞數(shù)據(jù)科學家。
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我只是知識的搬運工~
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