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發(fā)簡信
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RNAseq分析如何選擇 參考基因組 和 gtf
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坑隊友系列：ftp協(xié)議下載ensembl參考基因組你問我為啥標題這么長，據(jù)說是關鍵詞給的多，容易被搜到欢伏。寫得不好畅形，不用海涵属桦，直接提出无虚，謝謝您吶~ 1. 前言： 沒錯拯坟，作為一個自以為入門了的人其實還在門外眶诈。根據(jù)達克效應圖解涨醋，充...
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轉錄組數(shù)據(jù)分析前準備——參考基因組準備進行轉錄組分析前浴骂，需準備好參考基因組文件。醫(yī)學研究中應用最多的就是人類宪潮、大鼠溯警、小鼠趣苏。本文以這三種為主進行介紹。 參考基因組的下載可以進入ensembl數(shù)據(jù)庫進行 點擊畫紅框位...
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實戰(zhàn)之 mutect2檢測somatic變異流程1 用途 mutect2是GATK（The Genome Analysis Toolkit梯轻，是BroadInstitute開發(fā)的用于二代重測序數(shù)據(jù)分析的一款軟件食磕，里面包含了很...
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GATK4流程學習之背景知識與前期準備GATK4流程學習之背景知識與前期準備 - 簡書[http://www.reibang.com/p/97e803755fa6]GATK4流程學習之DNA-Seq varia...
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全外顯子測序(wes)數(shù)據(jù)分析詳細流程(小樣本)
如果想看大樣本的數(shù)據(jù)處理分析流程請移步總目錄:三陰性乳腺癌全外顯子分析(wes)(大樣本727個) 分析流程目錄如下： 1 wes相關軟件下載與安裝并添加環(huán)境變量2 下載GA...
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單細胞實戰(zhàn)(2)：cellranger使用
將SRA轉為fastq 數(shù)據(jù)下載好之后彬伦，我們得到的是SRR文件，需要將其轉換為fastq格式才能使用 結束之后每個SRR文件會變成解壓出三個文件 為什么會有三個文件伊诵，這個需要...
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《水凝膠》微信公眾號關注生物醫(yī)學功能材料交叉學科前沿進展曹宴，分享學習最新SCI文獻及科研信息搂橙。
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個性化生信分析
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2019.8月中旬開始系統(tǒng)自學生信湘捎，<br>自學路漫漫索性報個班。<br><br>生信技能樹真的很棒窄刘！<br><br>這是我的一個學習筆記平臺窥妇，點滴記錄。
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主要分享一些自己的學習過程，以菜鳥干貨為主翻伺，大家有問題可以在我的博客交流(打賞也是)<br><br>
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<br>自學生信的小白吨岭，<br>生物屆的一只單身狗!<br><br>從爬蟲過來的蛇友拉宗！
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周運來，男姐浮，長大了才會遇到的帥哥谷遂，穩(wěn)健，瀟灑单料，大方埋凯，靠譜点楼。一段生信緣扫尖，一棵技能樹。生信技能樹核心成員掠廓，單細胞天地供稿人换怖，簡書創(chuàng)作者，單細胞數(shù)據(jù)科學家蟀瞧。
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我只是知識的搬運工~
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