開發(fā)技術(shù) 前端：vue.js驶沼、echarts 后端：springboot钢颂、vue.js 數(shù)據(jù)庫：mysql 大數(shù)據(jù)計(jì)算框架：spark锅锨、hadoop 算法(機(jī)器學(xué)習(xí)、人工智能...
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計(jì)算機(jī)畢業(yè)設(shè)計(jì)Python+Spark+LSTM中藥推薦系統(tǒng) 中藥大數(shù)據(jù)可視化 中藥數(shù)據(jù)分析 中藥可視化系統(tǒng) 中藥知識圖譜 -
R package：metID(七)：代謝物的鑒定metid包來源于MetDNA中用于二級譜圖匹配的算法棘捣，并進(jìn)行了優(yōu)化，又新加了能夠用于in-house代謝物庫構(gòu)建的功能。 1. metid包的安裝 metid是tidyma...
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TCGA數(shù)據(jù)差異分析后生存分析（批量單因素cox回歸/Lasso篩選丰辣，多因素cox建模，時間依賴ROC曲線及KM plot可視化）測序上游分析系列： mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測序pipeline：從raw r...
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TCGACox
TCGA Cox模型-訓(xùn)練集、內(nèi)部驗(yàn)證集糯俗、外部驗(yàn)證集綜合構(gòu)建Cox風(fēng)險(xiǎn)模型③
前面我們已經(jīng)進(jìn)行了單因素Cox回歸尿褪，LASSO回歸及多因素Cox回歸建模，而我們想對建好的模型進(jìn)行驗(yàn)證得湘，本例通過內(nèi)部驗(yàn)證組和外部驗(yàn)證組對Cox模型進(jìn)行內(nèi)部驗(yàn)證和外部驗(yàn)證杖玲，并對...
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公眾號：誤入BioInfor的大黃鴨
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不是ids摆马，這篇文章的b這個探針，基因名矩陣
多分組芯片數(shù)據(jù)的差異分析-升級版
1.背景知識 今天的目的是為了從一個5分組數(shù)據(jù)中篩選出兩個分組鸿吆，去做后續(xù)分析囤采。擴(kuò)展了一下，5個分組的數(shù)據(jù)其實(shí)也可以直接一步到位作差異分析的惩淳。 數(shù)據(jù)編號：GSE54238實(shí)驗(yàn)設(shè)...
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博主蕉毯，提個小意見，這個函數(shù)能不能優(yōu)化一下八祭纭代虾？不要把ids作為必須輸入條件，因?yàn)橛行┗蜃⑨屖翘崆芭玫?
多分組芯片數(shù)據(jù)的差異分析-升級版
1.背景知識 今天的目的是為了從一個5分組數(shù)據(jù)中篩選出兩個分組激蹲，去做后續(xù)分析棉磨。擴(kuò)展了一下，5個分組的數(shù)據(jù)其實(shí)也可以直接一步到位作差異分析的学辱。 數(shù)據(jù)編號：GSE54238實(shí)驗(yàn)設(shè)...
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【miRNA-Seq 實(shí)戰(zhàn)】二乘瓤、準(zhǔn)備分析數(shù)據(jù)，差異分析以及靶向基因預(yù)測這里是佳奧策泣！了解了大致流程衙傀，我們開始正式的分析實(shí)戰(zhàn)。 本次實(shí)戰(zhàn)的數(shù)據(jù)來源是這篇文章：EBV-miR-BART8-3p induces epithelial-mesenchym...
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10X單細(xì)胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）數(shù)據(jù)分析之轉(zhuǎn)錄因子的分析方法與解讀作者着降，追風(fēng)少年i 最近呢差油，收到了很多粉絲的提問，其實(shí)關(guān)于多樣本通訊分析比較的內(nèi)容我已經(jīng)在單細(xì)胞個性化分析之多樣本細(xì)胞通訊比較篇[http://www.reibang.com...
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細(xì)胞通訊-2單個數(shù)據(jù)集進(jìn)行細(xì)胞間通訊分析單個數(shù)據(jù)集分析任洞，多個數(shù)據(jù)集比較分析蓄喇，具有較大成分差異的數(shù)據(jù)集比較分析。本教程是單個數(shù)據(jù)集分析流程 此教程概述了使用 CellChat 的單個數(shù)據(jù)集對細(xì)胞通信網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行推斷交掏、分析...
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【單細(xì)胞組學(xué)】scCITE-seq（單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組+細(xì)胞表面蛋白表達(dá)）單細(xì)胞水平的測序技術(shù)發(fā)展的越來越快妆偏，目前應(yīng)用最多的是集中于mRNA表達(dá)的scRNA-seq和結(jié)合了空間信息的空間轉(zhuǎn)錄組。在此基礎(chǔ)上盅弛，還發(fā)展出了其他變種钱骂，比如snRNA-seq...
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單細(xì)胞測序?qū)崙?zhàn)（第一部分）這次要練習(xí)的文章數(shù)據(jù)出自：Spatially and functionally distinct subclasses of breast cancer-associated...
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R語言--并行計(jì)算包（parallel叔锐、foreach）
R語言是單核計(jì)算語言，在數(shù)據(jù)建募啵或計(jì)算過程中愉烙，常常出現(xiàn)相同或相似任務(wù)的重復(fù)計(jì)算，一般操作是for循環(huán)處理或采用apply族函數(shù)處理解取，為了更快完成計(jì)算步责，采用并行計(jì)算是更優(yōu)的選擇...
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用clusterProfiler做GSEA之前寫過用clusterProfiler做GSEA,enrichplot中的gseaplot作圖，但是圖沒有最新版enrichplot包的gseaplot2做的圖好看禀苦。此外蔓肯，...
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單細(xì)胞文獻(xiàn)-3帶代碼 嚴(yán)重COVID-19患者的外周免疫反應(yīng)單細(xì)胞圖譜A single-cell atlas of the peripheral immune response in patients with severe COVID-19 ...
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關(guān)注科研生態(tài)慧邮，推廣科學(xué)成果调限，解密生命奧妙，歡迎關(guān)注公眾號：生信風(fēng)暴
