開(kāi)發(fā)技術(shù) 前端：vue.js、echarts 后端：springboot、vue.js 數(shù)據(jù)庫(kù)：mysql 大數(shù)據(jù)計(jì)算框架：spark洛史、hadoop 算法(機(jī)器學(xué)習(xí)、人工智能...
發(fā)簡(jiǎn)信
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計(jì)算機(jī)畢業(yè)設(shè)計(jì)Python+Spark+LSTM中藥推薦系統(tǒng) 中藥大數(shù)據(jù)可視化 中藥數(shù)據(jù)分析 中藥可視化系統(tǒng) 中藥知識(shí)圖譜 -
R package：metID(七)：代謝物的鑒定metid包來(lái)源于MetDNA中用于二級(jí)譜圖匹配的算法，并進(jìn)行了優(yōu)化，又新加了能夠用于in-house代謝物庫(kù)構(gòu)建的功能抽减。 1. metid包的安裝 metid是tidyma...
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TCGA數(shù)據(jù)差異分析后生存分析（批量單因素cox回歸/Lasso篩選，多因素cox建模橄碾，時(shí)間依賴ROC曲線及KM plot可視化）測(cè)序上游分析系列： mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測(cè)序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測(cè)序pipeline：從raw r...
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TCGACox
TCGA Cox模型-訓(xùn)練集卵沉、內(nèi)部驗(yàn)證集、外部驗(yàn)證集綜合構(gòu)建Cox風(fēng)險(xiǎn)模型③
前面我們已經(jīng)進(jìn)行了單因素Cox回歸法牲，LASSO回歸及多因素Cox回歸建模史汗，而我們想對(duì)建好的模型進(jìn)行驗(yàn)證，本例通過(guò)內(nèi)部驗(yàn)證組和外部驗(yàn)證組對(duì)Cox模型進(jìn)行內(nèi)部驗(yàn)證和外部驗(yàn)證拒垃，并對(duì)...
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公眾號(hào)：誤入BioInfor的大黃鴨
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不是ids，這篇文章的b這個(gè)探針戈毒，基因名矩陣
多分組芯片數(shù)據(jù)的差異分析-升級(jí)版
1.背景知識(shí) 今天的目的是為了從一個(gè)5分組數(shù)據(jù)中篩選出兩個(gè)分組艰猬，去做后續(xù)分析。擴(kuò)展了一下埋市，5個(gè)分組的數(shù)據(jù)其實(shí)也可以直接一步到位作差異分析的冠桃。 數(shù)據(jù)編號(hào)：GSE54238實(shí)驗(yàn)設(shè)...
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博主，提個(gè)小意見(jiàn)道宅，這個(gè)函數(shù)能不能優(yōu)化一下笆程？不要把ids作為必須輸入條件污茵，因?yàn)橛行┗蜃⑨屖翘崆芭玫?
多分組芯片數(shù)據(jù)的差異分析-升級(jí)版
1.背景知識(shí) 今天的目的是為了從一個(gè)5分組數(shù)據(jù)中篩選出兩個(gè)分組樱报，去做后續(xù)分析。擴(kuò)展了一下省咨，5個(gè)分組的數(shù)據(jù)其實(shí)也可以直接一步到位作差異分析的肃弟。 數(shù)據(jù)編號(hào)：GSE54238實(shí)驗(yàn)設(shè)...
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【miRNA-Seq 實(shí)戰(zhàn)】二、準(zhǔn)備分析數(shù)據(jù)零蓉，差異分析以及靶向基因預(yù)測(cè)這里是佳奧！了解了大致流程穷缤，我們開(kāi)始正式的分析實(shí)戰(zhàn)敌蜂。 本次實(shí)戰(zhàn)的數(shù)據(jù)來(lái)源是這篇文章：EBV-miR-BART8-3p induces epithelial-mesenchym...
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10X單細(xì)胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）數(shù)據(jù)分析之轉(zhuǎn)錄因子的分析方法與解讀作者，追風(fēng)少年i 最近呢津肛，收到了很多粉絲的提問(wèn)章喉，其實(shí)關(guān)于多樣本通訊分析比較的內(nèi)容我已經(jīng)在單細(xì)胞個(gè)性化分析之多樣本細(xì)胞通訊比較篇[http://www.reibang.com...
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細(xì)胞通訊-2單個(gè)數(shù)據(jù)集進(jìn)行細(xì)胞間通訊分析單個(gè)數(shù)據(jù)集分析，多個(gè)數(shù)據(jù)集比較分析身坐，具有較大成分差異的數(shù)據(jù)集比較分析秸脱。本教程是單個(gè)數(shù)據(jù)集分析流程 此教程概述了使用 CellChat 的單個(gè)數(shù)據(jù)集對(duì)細(xì)胞通信網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行推斷、分析...
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【單細(xì)胞組學(xué)】scCITE-seq（單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組+細(xì)胞表面蛋白表達(dá)）單細(xì)胞水平的測(cè)序技術(shù)發(fā)展的越來(lái)越快部蛇，目前應(yīng)用最多的是集中于mRNA表達(dá)的scRNA-seq和結(jié)合了空間信息的空間轉(zhuǎn)錄組摊唇。在此基礎(chǔ)上，還發(fā)展出了其他變種涯鲁，比如snRNA-seq...
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單細(xì)胞測(cè)序?qū)崙?zhàn)（第一部分）這次要練習(xí)的文章數(shù)據(jù)出自：Spatially and functionally distinct subclasses of breast cancer-associated...
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R語(yǔ)言--并行計(jì)算包（parallel巷查、foreach）
R語(yǔ)言是單核計(jì)算語(yǔ)言，在數(shù)據(jù)建哪ㄍ龋或計(jì)算過(guò)程中岛请，常常出現(xiàn)相同或相似任務(wù)的重復(fù)計(jì)算，一般操作是for循環(huán)處理或采用apply族函數(shù)處理警绩，為了更快完成計(jì)算崇败，采用并行計(jì)算是更優(yōu)的選擇...
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用clusterProfiler做GSEA之前寫過(guò)用clusterProfiler做GSEA,enrichplot中的gseaplot作圖，但是圖沒(méi)有最新版enrichplot包的gseaplot2做的圖好看肩祥。此外后室，...
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單細(xì)胞文獻(xiàn)-3帶代碼 嚴(yán)重COVID-19患者的外周免疫反應(yīng)單細(xì)胞圖譜A single-cell atlas of the peripheral immune response in patients with severe COVID-19 ...
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關(guān)注科研生態(tài)，推廣科學(xué)成果松申，解密生命奧妙云芦，歡迎關(guān)注公眾號(hào)：生信風(fēng)暴
