你好舅逸，比對后共有序列含有數(shù)字是啥含義呀僵控？
利用GeneDoc美化同源比對結(jié)果軟件準備：GeneDoc下載地址http://www.jalview.org/getdown/release/[http://www.jalview.org/getdown/...
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群體遺傳學之個體間遺傳距離及其計算方法
01-Definition Genetic Distance Genetic distance is the degree of genetic difference (ge...
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遺傳背景分析（群體結(jié)構(gòu)10個樣品以上）
2020.11.9【GWAS/WGS流程】丨全基因組關(guān)聯(lián)分析繪圖全流程_穆易青的博客-CSDN博客_gwas全基因組關(guān)聯(lián)分析[https://blog.csdn.net/ya...
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博主甫恩，我運行admixture，沒有結(jié)果文件.P和.Q酌予，也不報錯磺箕，不論是.ped還是.bed作為輸入文件，都沒結(jié)果抛虫，救救孩子吧
Linux 安裝admixture
1松靡、安裝VMware tools或掛載共享文件夾2、下載anacondahttps://repo.anaconda.com/archive/[https://repo.ana...
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對于最適m值會有多次重復建椰，那么繪制樹圖時最適m值的第幾次重復可以當做最后結(jié)果呢雕欺？每一個重復的結(jié)構(gòu)都不太一樣
【群體遺傳】Treemix四倍體分析 & 最優(yōu)m值選擇
距離上一次寫博客，已經(jīng)是上一次了棉姐。 之前已經(jīng)有生信菜鳥團前輩寫過關(guān)于Treemix的分析屠列，但值得關(guān)注的是，現(xiàn)在的軟件大部分都只適用于二倍體谅海，那今天介紹一下四倍體怎么進行Tre...
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【群體遺傳】Treemix四倍體分析 & 最優(yōu)m值選擇距離上一次寫博客撞蜂，已經(jīng)是上一次了。 之前已經(jīng)有生信菜鳥團前輩寫過關(guān)于Treemix的分析侥袜，但值得關(guān)注的是蝌诡，現(xiàn)在的軟件大部分都只適用于二倍體，那今天介紹一下四倍體怎么進行Tre...
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群體進化分析--基因流及群體歷史分析——我愿稱之為史上最全基因流（也稱基因遷移）是指從一個物種的一個種群向另一個種群引入新的遺傳物質(zhì)枫吧，從而改變?nèi)后w“基因庫”的組成浦旱。通過基因交流向群體中引入新的等位基因，是遺傳變異一個非常重要的來源九杂，...
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5. GWAS：群體結(jié)構(gòu)——Admixture群體結(jié)構(gòu)是指材料的亞群分化情況颁湖，會導致標記間的非連鎖關(guān)聯(lián)，進而導致關(guān)聯(lián)分析結(jié)果出現(xiàn)假陽性例隆。 地理隔離甥捺、人工選擇、移民和遺傳漂變等都可能導致群體分化镀层。 是指遺傳變異在物種或群體...
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生信小工具：Plink之下載安裝與其基本格式（1）
談起Plink相信熟悉的人更定都會知道镰禾，這是一個全面的基因組分析工具集，具有很多的小功能，在SNP數(shù)據(jù)統(tǒng)計吴侦，過濾屋休，GWAS分析中都可以用得上，而且速度非常的快备韧，堪稱是生物信息...
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同求劫樟，超到的ks咋過濾
全基因組復制分析（WGD）
全基因組復制 全基因組復制事件是物種的染色體由于某種原因整體復制加倍的事件； 大多數(shù)被子植物都經(jīng)歷過多倍化事件盯蝴； 物種在自然選擇壓力較大的時候可能會發(fā)生全基因組復制來豐富自己...
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「比較基因組學」簡單個性化之畫KaKs圖個性化需求 鑒定得到的wgd gene pair捧挺，TBtools計算得到TBtools.kaks.tab.xls虑绵，繪制Ks為橫坐標，Ka為縱坐標的點圖闽烙，對各數(shù)據(jù)進行分別以斜...
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使用vcftools對變異文件進行群體分析Tajima D 這個是選擇相關(guān)的一個參數(shù)翅睛，大于0代表群體觀測雜合度高于預期雜合度，稀有等位基因頻率降低（群體收縮或者平衡選擇）黑竞，小于0說明群體觀測雜合位點少于預期值捕发，稀有等...
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WGDI - 推斷祖先核型0.僅作個人筆記使用意思就是只考慮我能不能看懂具體每個參數(shù)的含義參照官方文檔, 這里全部用默認參數(shù)https://wgdi.readthedocs.io/en/latest/...
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宏基因組學/群體遺傳學 方向
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我進行ksd分析時扎酷，報錯：AttributeError: type object 'object'has no attribute 'dtype',不知道啥問題，求助遏匆！
使用WGD鑒定全基因組復制
轉(zhuǎn)載自鏈接：http://www.reibang.com/p/3cfeb49c821a[http://www.reibang.com/p/3cfeb49c821a] 古老...
